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云南省烟草黑胫病菌遗传多样性研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章 引言第11-20页
 1 烟草黑胫病的概况第11-13页
   ·烟草黑胫病的发现与命名第11页
   ·烟草黑胫病的分布与危害第11-12页
   ·烟草黑胫病的发病规律及因素第12-13页
 2 烟草黑胫病的病原第13-14页
   ·烟草黑腔病菌分类地位与形态特征第13页
   ·烟草黑胚病茵的寄主范围第13-14页
   ·烟草黑胫病菌致病性分化研究第14页
 3 烟草疫霉遗传多样性研究第14-17页
   ·基于DNA多态性的分子标记第15-17页
     ·RFLP技术第15-16页
     ·RAPD技术第16页
     ·简单重复序列的扩增长度多态性第16-17页
     ·DNA序列分析方法第17页
 4 系统发育树的构建方法第17-18页
   ·距离法第17-18页
   ·最大似然法第18页
   ·最大简约法第18页
   ·贝叶斯树估计方法第18页
 5 本研究的目的和拟解决的问题第18-20页
第二章第20-49页
 1 材料与方法第20-30页
   ·材料第20页
     ·病株样本第20页
     ·供试植物第20页
     ·主要试剂和药品第20页
     ·主要实验仪器第20页
   ·方法第20-30页
     ·培养基的配制第20-21页
     ·样品采集与分离第21页
     ·烟草黑胫病菌的鉴定第21-23页
       ·烟草黑胫病菌基因组DNA的提取第21页
       ·特异性引物鉴定烟草黑胫病菌第21-22页
       ·PCR产物直接测序及分析第22-23页
     ·烟草黑胫病菌菌丝生长速率差异的测定第23页
     ·烟草黑胫病菌游动孢子释放量差异的测定第23-24页
       ·菌丝的培养第23页
       ·诱导孢子囊产生第23页
       ·刺激孢子囊释放游动孢子第23页
       ·游动孢子的计数第23-24页
     ·烟草黑胫病菌致病力分化研究第24-25页
       ·南瓜片接种法第24页
       ·供试烟苗的培育第24页
       ·烟苗离体茎创伤接种法第24-25页
     ·基于线粒体基因间区trnY-rns片段的烟草黑胫病菌种群遗传分化第25-29页
       ·线粒体基因间隔区trnY-rns片段PCR扩增第25-26页
       ·PCR产物回收纯化第26-27页
       ·连接反应第27页
       ·转化第27-28页
       ·克隆菌株的筛选及菌液PCR鉴定第28页
       ·目的序列的测定第28页
       ·mt DNA基因间区(trnY/rns)序列分析第28-29页
     ·基于线粒体基因间区trnW-cox2片段的烟草黑胫病菌种群遗传分化第29-30页
       ·线粒体基因间隔区trnW-cox2片段PCR扩增第29页
       ·基于trnW-cox2间区片段的克隆及序列分析第29-30页
 2 结果与分析第30-46页
   ·烟草黑胫病菌的分离第30-31页
   ·烟草黑胫病菌的分子鉴定第31页
   ·供试菌株的菌丝生长速率差异的测定第31-33页
   ·供试菌株种群间游动孢子产孢量差异的测定第33-34页
   ·烟草黑胫病菌致病力分化研究第34-38页
     ·南瓜片接种法第34-36页
     ·烟苗离体茎创伤接种法第36-38页
   ·基于线粒体基因间区trnY-rns片段的烟草黑胫病菌种群遗传分化研究第38-41页
     ·线粒体基因间区(trnY/rns)片段PCR扩增结果第38-39页
     ·菌液PCR鉴定与目的序列测序第39页
     ·烟草黑胫病菌mtDNA基因间区(trnY/rns)碱基组成与序列分析第39-40页
     ·烟草黑胫病菌基于trnY/ms序列的遗传多样性分析第40-41页
     ·烟草黑胫病菌基于trnY/rns序列的系统发育分析第41页
   ·基于线粒体基因间区trnW-cox2片段的烟草黑胫病菌种群遗传分化研究第41-46页
     ·线粒体基因间区(trnW-cox2)片段PCR扩增结果第41-42页
     ·菌液PCR鉴定与目的序列测序第42-43页
     ·烟草黑胫病菌mtDNA基因间区(trnW-cox2)碱基组成与序列分析第43页
     ·烟草黑胫病菌基于trnW-cox2序列的遗传多样性分析第43-45页
     ·烟草黑胫病菌基于trnW-cox2序列的系统发育分析第45-46页
 3 全文小结与讨论第46-49页
   ·小结第46-47页
   ·讨论第47-49页
参考文献第49-53页
致谢第53页

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