| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-25页 |
| ·现生多足动物的多样化 | 第11-16页 |
| ·多足动物主要类群的基本特征 | 第11-14页 |
| ·前殖孔类内部系统发生关系的争论 | 第14-16页 |
| ·多足动物登陆与早期分化 | 第16-21页 |
| ·早期化石记录为多足动物登陆和分化提供参考 | 第16-18页 |
| ·多足动物谱系年代学研究 | 第18-21页 |
| ·小型前殖孔类动物的研究现状与展望 | 第21-25页 |
| ·小型前殖孔类动物的研究现状 | 第21-22页 |
| ·研究的困境与展望 | 第22-25页 |
| 第2章 两种前殖孔类动物的线粒体基因组全序列测定与分析 | 第25-41页 |
| ·引言 | 第25-26页 |
| ·材料和方法 | 第26-29页 |
| ·标本采集和总DNA提取 | 第26-27页 |
| ·线粒体DNA的扩增和测序策略 | 第27-28页 |
| ·序列的拼接与校正 | 第28-29页 |
| ·结果与讨论 | 第29-41页 |
| ·线粒体基因组结构特点 | 第29-34页 |
| ·tRNA基因二级结构 | 第34-38页 |
| ·多足类线粒体基因排序的祖先类型 | 第38-41页 |
| 第3章 前殖孔类系统发生关系的推断 | 第41-47页 |
| ·引言 | 第41页 |
| ·材料与方法 | 第41-44页 |
| ·标本采集、DNA提取、mtDNA的扩增和测序 | 第41页 |
| ·外群选择和线粒体序列数据 | 第41-42页 |
| ·序列比对与区块选择 | 第42-43页 |
| ·数据集的选择 | 第43页 |
| ·系统发生树的重建 | 第43-44页 |
| ·最优树检验 | 第44页 |
| ·前殖孔类系统发生分析结果 | 第44-46页 |
| ·数据集分析 | 第44页 |
| ·系统发生分析 | 第44-45页 |
| ·最优树选择 | 第45-46页 |
| ·前殖孔类系统发生关系的争论：(P+D)vs.(P+S) | 第46-47页 |
| 第4章 前殖孔类谱系发生年代分析 | 第47-52页 |
| ·引言 | 第47页 |
| ·系统树及化石校正点的选择 | 第47-48页 |
| ·基于线粒体全基因组的年代估算 | 第48-50页 |
| ·材料与方法 | 第48页 |
| ·前殖孔类谱系年代表估算 | 第48-50页 |
| ·从谱系年代研究前殖孔类动物的早期分化 | 第50-52页 |
| 第5章 线粒体编码基因的选择压力分析 | 第52-62页 |
| ·引言 | 第52-53页 |
| ·氧化磷酸化相关基因 | 第53-54页 |
| ·材料与方法 | 第54-56页 |
| ·样品采集与鉴定 | 第54-55页 |
| ·总DNA提取和PCR扩增 | 第55页 |
| ·系统发生分析 | 第55页 |
| ·选择压力分析 | 第55页 |
| ·统计学分析 | 第55-56页 |
| ·结果 | 第56-60页 |
| ·线粒体氧化磷酸化基因分析 | 第56-58页 |
| ·核氧化磷酸化基因和非氧化磷酸化基因分析 | 第58-60页 |
| ·讨论 | 第60-62页 |
| ·形态学佐证 | 第60-61页 |
| ·少足动物线粒体基因与松散选择压力 | 第61页 |
| ·选择压力分析提示的小型前殖孔类体节与体型演化机制 | 第61-62页 |
| 第6章 应用DNA条形码技术鉴别少足科4属的代表物种 | 第62-83页 |
| ·引言 | 第62-63页 |
| ·材料和方法 | 第63-66页 |
| ·标本采集与形态学鉴定 | 第63-64页 |
| ·单只法快速提取总DNA | 第64-65页 |
| ·DNA条形码的选择与扩增、测序 | 第65页 |
| ·序列比对和数据集处理 | 第65页 |
| ·DNA条形码分析 | 第65-66页 |
| ·结果 | 第66-79页 |
| ·形态学鉴定结果 | 第66-71页 |
| ·序列比对结果和序列缺失信息 | 第71-73页 |
| ·利用遗传距离分析界定少足科物种 | 第73-74页 |
| ·系统发生分析 | 第74-77页 |
| ·新种：双短棒十别少足虫Decapauropus biclavula Dong et Qian sp.n | 第77-79页 |
| ·讨论 | 第79-83页 |
| ·基于DNA条形码分析确认新种Decapauropus biclavula sp.n | 第79-80页 |
| ·DNA条形码鉴定的有效性与中国少足虫广布种的种内遗传变异 | 第80-81页 |
| ·双叉少足虫分类地位的厘定 | 第81-82页 |
| ·利用DNA条形码技术鉴定少足动物的优势和存在的问题 | 第82-83页 |
| 附录Ⅰ 线粒体基因组、系统发生分析和谱系年代学中涉及的名称及其英文缩写 | 第83-84页 |
| 附录Ⅱ 新种描述中用到的名词全称及其英文缩写 | 第84-85页 |
| 附录Ⅲ 系统发生分析使用的29种多足动物部分线粒体基因信息和碱基组成 | 第85-87页 |
| 附录Ⅳ 少足科46个个体之间K2P遗传距离表 | 第87-90页 |
| 参考文献 | 第90-104页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
