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好氧—厌氧产琥珀酸大肠杆菌的构建及全阶段发酵设计的研究

摘要第1-14页
Abstract第14-17页
缩写词表第17-20页
第一章 绪论第20-58页
   ·琥珀酸的理化性质第21-22页
   ·琥珀酸的市场需求第22-24页
   ·琥珀酸的应用第24-27页
     ·N-甲基吡咯烷酮第25页
     ·1,4-丁二醇第25-26页
     ·γ-丁内酯第26页
     ·己二酸第26页
     ·四氢呋喃第26页
     ·线性脂肪族酯第26-27页
     ·琥珀酸盐第27页
   ·琥珀酸的生产技术第27-30页
     ·化学合成法第27-28页
     ·生物转化法第28-29页
     ·微生物发酵法第29-30页
   ·代谢工程策略第30-31页
   ·琥珀酸产生途径第31-39页
     ·好氧琥珀酸产生途径及分析第32-34页
     ·厌氧琥珀酸产生途径及分析第34-39页
   ·大肠杆菌产琥珀酸的研究进展第39-54页
     ·好氧产琥珀酸大肠杆菌的工程策略第39页
     ·厌氧产琥珀酸大肠杆菌的工程策略第39-54页
       ·厌氧产琥珀酸大肠杆菌的构建第40-45页
       ·大肠杆菌琥珀酸发酵中酶的过量表达第45-50页
       ·计算机辅助的代谢工程设计与分析第50-51页
       ·发酵过程中细胞生理状态的调控策略第51-52页
       ·碳源对大肠杆菌工程菌株厌氧琥珀酸发酵的影响第52-53页
       ·大肠杆菌工程菌株产琥珀酸发酵条件控制策略第53-54页
   ·研究基础及存在问题第54-55页
   ·本论文的研究意义与研究内容第55-58页
     ·研究意义第55-56页
     ·课题来源第56页
     ·研究内容第56-58页
第二章 好氧-厌氧产琥珀酸大肠杆菌的构建及全阶段发酵琥珀酸第58-120页
   ·实验材料第59-72页
     ·质粒第59-60页
     ·菌株第60-61页
     ·寡核苷酸序列第61-66页
     ·培养基和主要溶液第66-69页
       ·培养基第66-67页
       ·主要溶液第67-69页
     ·分子生物学常用工具酶第69页
     ·常用试剂盒第69-70页
     ·常用生化试剂第70页
     ·仪器和设备第70-72页
   ·实验方法第72-83页
     ·菌种保藏第72页
     ·PCR扩增第72页
     ·Gibson Assembly体外组装构建重组质粒第72-75页
     ·CaCl_2法感受态细胞的制备第75页
     ·热激转化CaCl_2法制备的感受态细胞第75-76页
     ·一步法敲除和插入第76-77页
       ·电转化感受态细胞的制备第76页
       ·电转化第76-77页
       ·阳性克隆的筛选和重组质粒的去除第77页
       ·抗性基因的去除第77页
     ·一步法提取质粒第77-78页
     ·质粒和基因组的提取第78页
     ·荧光定量PCR检测基因的相对转录水平第78-81页
       ·细菌总RNA的提取第78-79页
       ·反转录获得cDNA第79-80页
       ·荧光定量PCR第80-81页
       ·数据分析第81页
     ·发酵条件第81-82页
     ·检测方法第82-83页
       ·发酵液中葡萄糖浓度的测定第82页
       ·细菌生长情况检测第82-83页
       ·发酵产物和副产物的检测第83页
   ·结果与讨论第83-119页
     ·工程菌株QZ1111和QMJ03好氧生产琥珀酸性能比较第83-89页
     ·拓展工程菌株QMJ03的厌氧琥珀酸生产能力第89-92页
     ·代谢流再分配目标的选择第92-94页
     ·pckA上游定点突变模块的构建第94-96页
     ·SfcA组成型表达载体的构建第96-99页
     ·增加QMJ09中PEP和Pyruvate的羧化流量第99-104页
     ·Glf_(Zm)组成型表达载体及基因组整合模块的构建第104-110页
     ·提高工程菌株转运葡萄糖的能力第110-117页
     ·发酵罐好氧-微好氧-厌氧全阶段分批补料发酵生产琥珀酸第117-119页
   ·本章小结第119-120页
第三章 组成型表达TCA循环还原支路关键酶对工程菌株厌氧琥珀酸发酵的影响第120-138页
   ·实验材料第121-124页
     ·菌株和质粒第121-122页
     ·寡核苷酸序列第122-124页
   ·实验方法第124-125页
     ·质粒的装配第124页
     ·发酵条件第124页
     ·检测方法第124-125页
   ·结果与讨论第125-137页
     ·CO_2对工程菌株YL106/pSCsfcA厌氧琥珀酸发酵的影响第125-127页
     ·质粒pACpckA的装配第127-131页
     ·质粒pACmdh的装配第131-132页
     ·质粒pACfumB的装配第132-133页
     ·质粒pACfrdABCD的装配第133-135页
     ·组成型表达TCA循环还原支路关键酶对工程菌株厌氧琥珀酸发酵的影响第135-137页
   ·本章小结第137-138页
第四章 调控好氧电子传递链对工程菌株厌氧琥珀酸发酵的影响第138-162页
   ·实验材料第143-145页
     ·菌株第143-144页
     ·寡核苷酸序列第144-145页
   ·实验方法第145页
     ·基因敲除第145页
     ·发酵条件第145页
     ·检测方法第145页
   ·结果与讨论第145-160页
     ·出发菌株的选择第145-146页
     ·ndh和wrbA的缺失对工程菌株YL104厌氧琥珀酸发酵的影响第146-150页
     ·转厌氧时间点对YL104NW全阶段发酵的影响第150-152页
     ·延长厌氧发酵时间对YL104NW全阶段发酵的影响第152-155页
     ·cyoB基因的敲除对YL104NW全阶段发酵的影响第155-157页
     ·组成型表达琥珀酸发酵途径中NADH利用的酶对YL104NW全阶段发酵的影响第157-160页
   ·本章小结第160-162页
创新性成果与展望第162-164页
 创新性成果第162页
 展望第162-164页
参考文献第164-172页
致谢第172-174页
攻读博士学位期间发表的论文第174-176页
外文写作第176-185页
学位论文评阅及答辩情况表第185页

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