基于二级结构的蛋白质三维结构预测方法研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·蛋白质结构预测工作研究背景 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-10页 |
| ·本文的主要工作 | 第10-12页 |
| 第二章 蛋白质结构预测的若干基础知识 | 第12-19页 |
| ·蛋白质的组成单位 | 第12-15页 |
| ·氨基酸化学性质的集合分类 | 第13-14页 |
| ·按亲水性疏水性的分类 | 第14-15页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第15-17页 |
| ·维持蛋白质结构的主要作用力 | 第17-18页 |
| ·小结 | 第18-19页 |
| 第三章 蛋白质结构预测方法 | 第19-28页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第19-22页 |
| ·结构域、功能位点、相互作用点的预测 | 第22-24页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第24-27页 |
| ·小结 | 第27-28页 |
| 第四章 蛋白质结构预测的优化模型 | 第28-31页 |
| ·二维HP格点模型 | 第28-29页 |
| ·二维AB非格点模型 | 第29-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 第五章 基于特征提取的蛋白质二级结构预测 | 第31-37页 |
| ·蛋白质二级结构数据库的搭建 | 第31-32页 |
| ·生成特征序列 | 第32页 |
| ·基于密度聚类算法的模型 | 第32-34页 |
| ·聚类使用的关联函数 | 第34页 |
| ·实验设计及分析 | 第34-36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 第六章 基于二级结构的蛋白质三维结构预测 | 第37-49页 |
| ·传统的遗传算法 | 第37-39页 |
| ·遗传算法基本思想 | 第37页 |
| ·遗传算法的描述 | 第37-38页 |
| ·遗传算法的特点 | 第38-39页 |
| ·遗传算法的改进 | 第39-42页 |
| ·遗传算法中惩罚函数的改进 | 第40页 |
| ·小生境遗传算法 | 第40-42页 |
| ·基于小生境技术的遗传算法的实现 | 第42页 |
| ·实验结果及其分析 | 第42-48页 |
| ·实验数据 | 第43页 |
| ·实验环境 | 第43-44页 |
| ·实验结果与分析 | 第44-48页 |
| ·小结 | 第48-49页 |
| 第七章 总结与展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 硕士期间所做的工作 | 第53-54页 |
| 发表的学术论文 | 第53页 |
| 参加的科研项目 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
