| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-21页 |
| ·引论 | 第12页 |
| ·研究背景及意义 | 第12-15页 |
| ·国内外蛋白质功能预测研究的现状 | 第15-18页 |
| ·基于序列的功能预测 | 第16页 |
| ·基于结构的功能预测 | 第16-17页 |
| ·基于蛋白相互作用信息的功能预测 | 第17-18页 |
| ·各种功能预测方法比较 | 第18页 |
| ·本文研究的主要内容 | 第18-19页 |
| ·本论文的结构安排 | 第19-21页 |
| 第2章 蛋白序列的编码与功能预测 | 第21-39页 |
| ·蛋白质功能预测的预备知识 | 第22-24页 |
| ·蛋白质分子的组成、物化性质 | 第22-24页 |
| ·蛋白质分子结构 | 第24页 |
| ·蛋白质功能预测过程 | 第24-25页 |
| ·蛋白质特征提取与功能编码 | 第25-30页 |
| ·简单的序列编码方式 | 第25页 |
| ·Profile 编码 | 第25-26页 |
| ·DipeptideCompsition 编码 | 第26页 |
| ·基于 EDP 的序列编码 | 第26-27页 |
| ·BioSimilarity 编码方法 | 第27页 |
| ·PseAA 编码方法 | 第27-29页 |
| ·基于 CIS 编码方法 | 第29-30页 |
| ·各种编码之比较 | 第30页 |
| ·相似函数 | 第30-33页 |
| ·距离测度 | 第30-31页 |
| ·相近测度 | 第31-32页 |
| ·匹配测度 | 第32-33页 |
| ·测度小结 | 第33页 |
| ·蛋白质功能类分类算法 | 第33-37页 |
| ·KNN 算法 | 第33-34页 |
| ·贝叶斯分类算法 | 第34-35页 |
| ·遗传算法 | 第35-37页 |
| ·蛋白质功能预测性能评估 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-39页 |
| 第3章 蛋白质功能类预测的一种数据集选取法 | 第39-46页 |
| ·引言 | 第39页 |
| ·数据集 | 第39-40页 |
| ·原理与方法 | 第40-45页 |
| ·结果与讨论 | 第45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 第4章 基于聚类的蛋白质功能预测 | 第46-56页 |
| ·引言 | 第46页 |
| ·提取特征与编码 | 第46-49页 |
| ·ExtendProfile 编码 | 第46-48页 |
| ·ProfileAA 编码 | 第48页 |
| ·各类编码比较 | 第48-49页 |
| ·聚类方类 | 第49-51页 |
| ·分类算法 | 第51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-54页 |
| ·小结 | 第54-56页 |
| 结论 | 第56-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附录 A 攻读学位期间所发表的学术论文及所参加项目 | 第65页 |