| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-35页 |
| 1 导言 | 第17页 |
| 2 猪生产性状分子标记的研究进展 | 第17-21页 |
| ·猪QTL定位研究现状 | 第17-21页 |
| ·分子标记的研究进展 | 第21页 |
| 3 猪肌肉生长发育及其品质相关候选基因的研究进展 | 第21-24页 |
| ·已明确的主效基因 | 第22页 |
| ·其它候选基因 | 第22-24页 |
| 4 猪与其它物种比较基因图谱的研究进展 | 第24-26页 |
| 5 电脑克隆在分离新基因中的应用 | 第26-29页 |
| ·依据 | 第26页 |
| ·EST及其应用 | 第26-27页 |
| ·应用EST分离新基因 | 第27-28页 |
| ·基于基因组序列数据库的新基因克隆 | 第28-29页 |
| 6 拟分离基因的研究进展 | 第29-35页 |
| ·己糖激酶2(Hexokinase Ⅱ,HK2) | 第29-30页 |
| ·LIM结构域富半胱氨酸蛋白(LIM and cysteine-rich domains 1,LMCD1) | 第30页 |
| ·伴肌动蛋白相关锚定蛋白基因(Nebulin-related anchoring protein,NRAP) | 第30-31页 |
| ·烯脂酰-CoA水合酶1(Enoyl CoA hydratase 1,ECH1) | 第31-32页 |
| ·肌节线粒体肌酸激酶(creatine kinase,mitochondrial 2(sarcomeric),CKMT2) | 第32页 |
| ·肌联蛋白免疫球蛋白区域蛋白(Titin Immunoglobulin Domain Protein；TTID) | 第32-33页 |
| ·肌型磷酸果糖激酶(Phosphofructokinase Muscle Type,PFKM) | 第33-34页 |
| ·肌浆球蛋白轻链可磷酸化蛋白(myosin light chain,phosphorylatable,fast skeletal muscle,MYLPF) | 第34-35页 |
| 第二章 本研究的目的和意义 | 第35-36页 |
| 第三章 材料与方法 | 第36-53页 |
| 1 实验材料 | 第36-38页 |
| ·实验样品和性状测定 | 第36-37页 |
| ·主要仪器和设备 | 第37页 |
| ·主要药品及试剂 | 第37页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第37-38页 |
| 2 实验方法 | 第38-53页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·基因组DNA的浓度测定和质量检测 | 第39页 |
| ·总RNA的提取及利用RT-PCR方法扩增cDNA片段 | 第39-40页 |
| ·候选基因的确定及其引物设计合成 | 第40-42页 |
| ·基因片段的回收纯化、克隆和测序 | 第42-45页 |
| ·DNA序列的生物信息学分析 | 第45-46页 |
| ·猪候选基因基因组序列的克隆、测序及SNPs研究 | 第46-48页 |
| ·猪候选基因部分SNP检测-单链构型多态性分析(PCR—SSCP) | 第48-49页 |
| ·统计分析 | 第49-50页 |
| ·用RACE方法扩增部分候选基因的全长cDNA序列 | 第50-52页 |
| ·组织表达谱分析 | 第52-53页 |
| 第四章 结果与分析 | 第53-127页 |
| 1 猪HK2基因 | 第53-64页 |
| ·猪HK2基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第53-54页 |
| ·推导的HK2蛋白质的基本特征分析 | 第54-56页 |
| ·猪HK2基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第56-58页 |
| ·猪HK2基因遗传变异的多态性检测 | 第58-60页 |
| ·猪HK2基因基因型与生产性状的统计分析 | 第60-63页 |
| ·猪HK2基因的组织表达谱分析 | 第63-64页 |
| 2 猪LMCD1基因 | 第64-70页 |
| ·猪LMCD1基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第64-65页 |
| ·推导的LMCD1蛋白质的基本特征分析 | 第65-66页 |
| ·猪LMCD1基因第3外显子遗传变异的多态性检测 | 第66-67页 |
| ·猪LMCD1基因基因型与生产性状的统计分析 | 第67-69页 |
| ·猪LMCD1基因的组织表达谱分析 | 第69-70页 |
| 3 猪NRAP基因 | 第70-77页 |
| ·猪NRAP基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第70-72页 |
| ·猪NRAP基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第72-73页 |
| ·推导的NRAP蛋白质的基本特征分析 | 第73-74页 |
| ·猪NRAP基因第39内含子遗传变异的多态性检测 | 第74-75页 |
| ·猪NRAP基因基因型与生产性状的统计分析 | 第75-76页 |
| ·猪NRAP基因的组织表达谱分析 | 第76-77页 |
| 4 猪ECH1基因 | 第77-89页 |
| ·猪ECH1基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第77-79页 |
| ·猪ECH1基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第79-80页 |
| ·推导的ECH1蛋白质的基本特征分析 | 第80-82页 |
| ·猪ECH1基因第1、5内含子以及第4外显子遗传变异的多态性检测 | 第82-84页 |
| ·猪ECH1基因基因型与生产性状的统计分析 | 第84-88页 |
| ·猪ECH1基因的组织表达谱分析 | 第88-89页 |
| 5 猪CKMT2基因 | 第89-97页 |
| ·猪CKMT2基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第89-90页 |
| ·猪CKMT2基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第90-91页 |
| ·推导的CKMT2蛋白质的基本特征分析 | 第91-93页 |
| ·猪CKMT2基因第4内含子遗传变异的多态性检测 | 第93-94页 |
| ·猪CKMT2基因基因型与生产性状的统计分析 | 第94-96页 |
| ·猪CKMT2基因的组织表达谱分析 | 第96-97页 |
| 6 猪TTID基因 | 第97-106页 |
| ·猪TTID基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第97-98页 |
| ·猪TTID基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第98-99页 |
| ·推导的TTID蛋白质的基本特征分析 | 第99-102页 |
| ·猪TTID基因第6内含子遗传变异的多态性检测 | 第102-103页 |
| ·猪TTID基因基因型与生产性状的统计分析 | 第103-105页 |
| ·猪TTID基因的组织表达谱分析 | 第105-106页 |
| 7 猪PFKM基因 | 第106-120页 |
| ·猪PFKM基因cDNA序列的克隆、测序及序列分析 | 第106-108页 |
| ·猪PFKM基因部分基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第108-111页 |
| ·推导的PFKM蛋白质的基本特征分析 | 第111-113页 |
| ·猪PFKM基因第13、17外显子遗传变异的多态性检测 | 第113-115页 |
| ·猪PFKM基因基因型与生产性状的统计分析 | 第115-119页 |
| ·猪PFKM基因的组织表达谱分析 | 第119-120页 |
| 8 猪MYLPF基因 | 第120-127页 |
| ·猪MYLPF基因基因组序列的克隆、测序及序列分析 | 第120-121页 |
| ·推导的MYLPF蛋白质的基本特征分析 | 第121-122页 |
| ·猪MYLPF基因第1内含子遗传变异的多态性检测 | 第122-124页 |
| ·猪MYLPF基因基因型与生产性状的统计分析 | 第124-126页 |
| ·猪MYLPF基因的组织表达谱分析 | 第126-127页 |
| 第五章 讨论 | 第127-141页 |
| 1 关于候选基因的筛选 | 第127-129页 |
| 2 利用电子克隆策略克隆猪新基因 | 第129-130页 |
| 3 猪与人、鼠间基因结构和编码区序列的保守性 | 第130页 |
| 4 不同猪种间基因序列的SNPs研究 | 第130-131页 |
| 5 生物信息学软件进行预测蛋白的结构域及其功能位点分析 | 第131-133页 |
| 6 分子标记在不同猪种间的基因频率分布 | 第133-135页 |
| 7 分子标记的遗传效应分析 | 第135-139页 |
| 8 组织表达谱分析 | 第139-140页 |
| 9 下一步工作 | 第140-141页 |
| 小结 | 第141-142页 |
| 参考文献 | 第142-153页 |
| 致谢 | 第153-154页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第154-155页 |
| 附录 | 第155-171页 |
