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逆转座子LINE-1调控靶基因的鉴定及机制研究

致谢第1-6页
中文摘要第6-7页
ABSTRACT第7-12页
1. 引言第12-20页
   ·逆转座子概述第12-13页
   ·逆转座子LINE-1的结构特征第13页
   ·逆转座子LINE-1的功能第13-18页
     ·LINE-1与体细胞的转录第13-14页
     ·LINE-1与新着丝点的形成第14页
     ·LINE-1与X染色体失活第14-15页
     ·LINE-1在插入偏移和自然选择中的作用第15-16页
     ·DNA损伤活化LINE-1转座元件第16页
     ·LINE-1对细胞生物学功能的影响第16-17页
     ·癌症与LINE-1逆转座子第17-18页
   ·逆转座子LINE-1的调控机制第18-20页
     ·LINE-1作为非编码序列在细胞中的调控作用第18-19页
     ·LINE-1编码序列参与对自身来源siRNA的调控第19-20页
2. 实验材料、仪器与试剂配制第20-23页
   ·实验材料第20页
   ·实验仪器第20-21页
   ·试剂配制第21-23页
     ·细菌培养所用试剂配制第21页
     ·细胞培养所用试剂配制第21-22页
     ·其他试剂配制第22-23页
3. 实验方法第23-40页
   ·LINE-1调控靶基因的鉴定第23-29页
     ·E.coli DH5α感受态细胞的制备第23页
     ·pSilencer2.1-neo、pSilencer 2,1-neo-RNAi和pIRES-neoHL1(ORF1)-1质粒的转化第23-24页
     ·转染质粒的提取第24-25页
     ·细胞转染第25-27页
       ·细胞复苏第25页
       ·细胞培养第25页
       ·细胞冻存第25-26页
       ·pSilencer2.1-neo、pSilencer 2,1-neo-RNAi和pIRES-neoHL1(ORF1)-1质粒转染细胞第26-27页
     ·RT-PCR半定量检测DNA表达第27-28页
       ·Trizol法提取细胞mRNA第27页
       ·逆转录反应第27页
       ·PCR反应第27-28页
       ·琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果第28页
     ·荧光定量PCR检测DNA表达第28-29页
   ·LINE-1调控靶基因的机制第29-40页
     ·pIRES-neoL15'UTRf与pIRES-neoL15'UTRr表达载体的构建第29-34页
       ·目的基因片段的选择第29-30页
       ·PCR扩增目的片段第30页
       ·PCR反应体系第30-31页
       ·PCR产物的切胶纯化第31页
       ·双酶切第31-32页
       ·载体与片段连接第32-33页
       ·连接产物转化大肠杆菌感受态细胞E.coli DH5α第33页
       ·阳性重组质粒的酶切鉴定与测序第33-34页
     ·转染质粒的提取第34-35页
     ·细胞转染第35页
     ·RT-PCR检测DNA表达第35-37页
       ·Trizol法提取细胞mRNA第35-36页
   ·4.2 逆转录反应第36页
       ·荧光定量PCR检测目的基因的表达第36-37页
     ·基因启动子甲基化检测第37-40页
       ·细胞转染第37页
       ·基因组DNA的提取第37-38页
       ·HapⅡ和MspⅠ酶切体系第38页
       ·荧光定量PCR检测基因表达第38-40页
4 实验结果第40-59页
   ·LINE-1调控靶基因的鉴定第40-44页
     ·LINE-1调控基因的筛查与分析第40-41页
     ·转染不同载体对HepG2细胞靶基因表达的影响第41-44页
       ·RT-PCR结果第41-43页
       ·荧光定量PCR结果第43-44页
   ·LINE-1调控靶基因的机制第44-59页
     ·pIRES-neoL15'UTRf和pIRES-neoL15'UTRr载体构建第44-45页
     ·LINE-15'UTR不同转录产物对靶基因表达的影响第45-46页
     ·LINE-15'UTR和ORF1对靶基因mRNA稳定性影响的检测第46-56页
       ·LINE-15'UTR对调控靶基因mRNA稳定性的影响第46-51页
       ·下调LINE-1 ORF1对基因mRNA稳定性的影响第51-56页
     ·LINE-1 5'UTR序列对靶基因启动子甲基化的影响第56-57页
     ·LINE-1 ORF1干扰序列对靶基因启动子甲基化的影响第57-59页
5 结论第59-60页
6 讨论第60-63页
   ·下调LINE-1 ORF1对基因表达的影响第60页
   ·LINE-1 5'UTR序列对基因表达的影响第60-61页
   ·LINE-1 ORF1和5'UTR序列对基因启动子甲基化的影响第61-63页
参考文献第63-65页
附录A第65-66页
作者简历第66-68页
学位论文数据集第68页

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