| 中文摘要 | 第1-3页 |
| 英文摘要 | 第3-7页 |
| 第一章 引言 | 第7-12页 |
| 第二章 基因组的信息编码探讨 | 第12-27页 |
| 2．1 DNA人工信息编码的研究 | 第14-15页 |
| 2．2 基因组蛋白质编码区的信息编码探讨 | 第15-18页 |
| 2．3 基因组表达调控区的信息编码探讨 | 第18-27页 |
| 2．3．1 基因表达调控 | 第18-25页 |
| 2．3．2 基因组表达调控区的信息编码 | 第25-27页 |
| 第三章 双链DNA的一种可能的信息编码方式BSP | 第27-54页 |
| 3．1 双链DNA的碱基空间模式（BSP） | 第27-31页 |
| 3．1．1 研究BSP的出发点 | 第27-29页 |
| 3．1．2 DNA片段的碱基空间模式（BSP） | 第29-30页 |
| 3．1．3 两段双链DNA片段具有相同的BSP的判断定理 | 第30-31页 |
| 3．2 由BSP介导的一种4与20的关系（4-BSP-20关系） | 第31-36页 |
| 3．2．1 4-BSP-20关系 | 第32-33页 |
| 3．2．2 讨论 | 第33-36页 |
| 3．3 蛋白质对核酸专一性识别的一种可能的方式 | 第36-44页 |
| 3．3．1 蛋白质CG和SpGCF1的两组结合位点 | 第37-39页 |
| 3．3．2 从EMBL核苷酸序列数据库中得到的五组DNA结合位点 | 第39-42页 |
| 3．3．3 讨论 | 第42-44页 |
| 3．4 BSP的一种形式化描述及相关的算法 | 第44-54页 |
| 3．4．1 基于一种等价类的BSP形式化表示 | 第45-49页 |
| 3．4．2 关于BSP的一个算法 | 第49-52页 |
| 3．4．3 讨论 | 第52-54页 |
| 第四章 结论 | 第54-57页 |
| 参考文献 | 第57-69页 |
| 攻读博士期间完成的论文清单 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
