新型人类肠道病毒山东分离株的分子流行病学及其基因组特征研究
| 摘要 | 第1-16页 |
| Abstract | 第16-23页 |
| 符号说明 | 第23-25页 |
| 前言 | 第25-32页 |
| 一、背景 | 第25-30页 |
| (一) 人类肠道病毒(HEVs)的分类 | 第25-26页 |
| (二) 新型HEVs的致病性 | 第26-27页 |
| (三) 新型HEVs的流行状况 | 第27-28页 |
| (四) HEVs病原学及分子进化 | 第28-29页 |
| (五) 国内外研究现状 | 第29-30页 |
| 二、研究目的与意义 | 第30-31页 |
| (一) 本研究的意义 | 第30-31页 |
| (二) 本研究的目的 | 第31页 |
| 三、本研究的技术路线 | 第31-32页 |
| 材料与方法 | 第32-48页 |
| 一、材料 | 第32-40页 |
| (一) 标本与资料来源 | 第32页 |
| (二) 细胞培养材料 | 第32-34页 |
| (三) 病毒分离实验材料 | 第34-35页 |
| (四) 中和实验材料 | 第35页 |
| (五) 核酸提取及RT-PCR实验材料 | 第35-37页 |
| (六) 引物设计合成 | 第37-39页 |
| (七) 琼脂糖凝胶电泳材料 | 第39页 |
| (八) DNA序列测定材料 | 第39-40页 |
| (九) 生物信息学软件 | 第40页 |
| 二、方法 | 第40-47页 |
| (一) 细胞培养 | 第40-41页 |
| (二) 病毒分离 | 第41页 |
| (三) 血清学型别鉴定 | 第41-42页 |
| (四) 病毒核酸(RNA)的提取 | 第42-43页 |
| (五) 逆转录-聚合酶链反应 | 第43-44页 |
| (六) 琼脂糖凝胶电泳 | 第44页 |
| (七) 序列测定 | 第44-46页 |
| (八) 分子定型与序列提交 | 第46页 |
| (九) 系统发生学分析与同源性分析 | 第46页 |
| (十) 进化遗传学分析 | 第46-47页 |
| (十一) 重组分析 | 第47页 |
| 三、质量控制 | 第47-48页 |
| (一) 实验中的质量控制 | 第47页 |
| (二) 其他步骤质量控制 | 第47-48页 |
| 结果 | 第48-99页 |
| 一、新型HEVs山东分离株的鉴定与基因型分布 | 第48-52页 |
| (一) AFP监测系统来源的新型HEVs | 第48页 |
| (二) HFMD病例来源的新型HEVs | 第48-50页 |
| (三) 无菌性脑膜炎病例中的新型HEVs | 第50-52页 |
| 二、新型HEVs山东分离株的细胞病变特征 | 第52-53页 |
| (一) 细胞敏感性分析 | 第52-53页 |
| (二) 在敏感细胞上的CPE特征 | 第53页 |
| 三、新型HEVs VP1序列分析与进化遗传学研究 | 第53-83页 |
| (一) EV71山东分离株遗传进化分析 | 第54-59页 |
| (二) EV73山东分离株遗传进化分析 | 第59-62页 |
| (三) EV74山东分离株遗传进化分析 | 第62-65页 |
| (四) EV75山东分离株遗传进化分析 | 第65-69页 |
| (五) EV76山东分离株遗传进化分析 | 第69-72页 |
| (六) EV80山东分离株遗传进化分析 | 第72-75页 |
| (七) EV87山东分离株遗传进化分析 | 第75页 |
| (八) EV90山东分离株遗传进化分析 | 第75-77页 |
| (九) EV96山东分离株遗传进化分析 | 第77-81页 |
| (十) EV97山东分离株遗传进化分析 | 第81-83页 |
| 四、新型HEVs全基因组序列分析 | 第83-99页 |
| (一) EV71的全基因组序列分析 | 第83-84页 |
| (二) EV73和EV75的全基因组序列分析 | 第84-86页 |
| (三) EV76的全基因组序列分析 | 第86-88页 |
| (四) EV90的全基因组序列分析 | 第88-91页 |
| (五) EV96的全基因组序列分析 | 第91-95页 |
| (六) EV97的全基因组序列分析 | 第95-99页 |
| 讨论 | 第99-108页 |
| 一、新型HEVs山东分离株的基因型分布 | 第99-102页 |
| 二、新型HEVs的细胞病变特征 | 第102页 |
| 三、新型HEVs的分子进化 | 第102-105页 |
| (一) EV71山东分离株的分子进化 | 第102-104页 |
| (二) 其他新型HEVs山东分离株的分子进化 | 第104-105页 |
| 四、新型HEVs的基因组序列分析 | 第105-108页 |
| 本研究的主要创新点和不足 | 第108-109页 |
| 后续研究方向 | 第109-110页 |
| 结论与建议 | 第110-111页 |
| 附录、附表 | 第111-118页 |
| 参考文献 | 第118-129页 |
| 综述 | 第129-143页 |
| 参考文献 | 第136-143页 |
| 致谢 | 第143-145页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第145-147页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第147-148页 |
| 外文论文 | 第148-172页 |
