摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-18页 |
·引言 | 第7页 |
·背景介绍 | 第7-9页 |
·分子对接概述 | 第9-11页 |
·分子对接原理 | 第9-10页 |
·分子对接的分类 | 第10-11页 |
·分子对接的策略选择 | 第11页 |
·评价函数 | 第11-13页 |
·优化算法 | 第13-17页 |
·优化算法简介 | 第13-14页 |
·构象搜索算法及其分类 | 第14页 |
·分子对接中的常用随机搜索算法 | 第14-17页 |
·本章小结 | 第17-18页 |
第二章 数据来源及对接准备 | 第18-22页 |
·引言 | 第18页 |
·数据来源 | 第18-19页 |
·分子预处理 | 第19-21页 |
·受体的预处理过程 | 第19-20页 |
·配体的预处理过程 | 第20-21页 |
·本章小结 | 第21-22页 |
第三章 一种改进型的量子粒子群优化算法 | 第22-34页 |
·引言 | 第22页 |
·微粒群算法 | 第22-26页 |
·经典微粒群算法 | 第22-24页 |
·惯性权重法 | 第24页 |
·基于量子行为的微粒群算法 | 第24-26页 |
·改进型的的 QPSO 算法——QPSO-LS 算法 | 第26-33页 |
·算法描述 | 第26-30页 |
·实验结果及分析 | 第30-33页 |
·本章小结 | 第33-34页 |
第四章 QPSO-LS 算法在分子对接中的运用 | 第34-42页 |
·引言 | 第34页 |
·AutoDock 简介 | 第34页 |
·格点对接理论 | 第34-35页 |
·QLDOCK 的实现 | 第35-37页 |
·QLDOCK 的参数设置 | 第35-36页 |
·程序流程 | 第36-37页 |
·实验及结果分析 | 第37-41页 |
·实验设置 | 第37页 |
·对接流程 | 第37-38页 |
·对接结果与分析 | 第38-41页 |
·本章小结 | 第41-42页 |
第五章 脂肪酶与脂肪酸酯相互作用的研究 | 第42-56页 |
·引言 | 第42页 |
·结构模型化 | 第42-44页 |
·分子对接数据预处理步骤 | 第44页 |
·1LGY 活性部位的验证 | 第44-47页 |
·不同链长脂肪酸酯与脂肪酶相互作用比较 | 第47-53页 |
·C2 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果 | 第47-49页 |
·C3 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果 | 第49-50页 |
·C6 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果 | 第50-51页 |
·C8 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果 | 第51-52页 |
·C12 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果 | 第52-53页 |
·脂肪酶1LGY 底物专一性研究 | 第53-55页 |
·本章小结 | 第55-56页 |
第六章 总结与展望 | 第56-57页 |
·工作总结 | 第56页 |
·工作展望 | 第56-57页 |
致谢 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-61页 |
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第61页 |