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基于分子对接技术的小分子—蛋白质相互作用研究

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 绪论第7-18页
   ·引言第7页
   ·背景介绍第7-9页
   ·分子对接概述第9-11页
     ·分子对接原理第9-10页
     ·分子对接的分类第10-11页
     ·分子对接的策略选择第11页
   ·评价函数第11-13页
   ·优化算法第13-17页
     ·优化算法简介第13-14页
     ·构象搜索算法及其分类第14页
     ·分子对接中的常用随机搜索算法第14-17页
   ·本章小结第17-18页
第二章 数据来源及对接准备第18-22页
   ·引言第18页
   ·数据来源第18-19页
   ·分子预处理第19-21页
     ·受体的预处理过程第19-20页
     ·配体的预处理过程第20-21页
   ·本章小结第21-22页
第三章 一种改进型的量子粒子群优化算法第22-34页
   ·引言第22页
   ·微粒群算法第22-26页
     ·经典微粒群算法第22-24页
     ·惯性权重法第24页
     ·基于量子行为的微粒群算法第24-26页
   ·改进型的的 QPSO 算法——QPSO-LS 算法第26-33页
     ·算法描述第26-30页
     ·实验结果及分析第30-33页
   ·本章小结第33-34页
第四章 QPSO-LS 算法在分子对接中的运用第34-42页
   ·引言第34页
     ·AutoDock 简介第34页
   ·格点对接理论第34-35页
   ·QLDOCK 的实现第35-37页
     ·QLDOCK 的参数设置第35-36页
     ·程序流程第36-37页
   ·实验及结果分析第37-41页
     ·实验设置第37页
     ·对接流程第37-38页
     ·对接结果与分析第38-41页
   ·本章小结第41-42页
第五章 脂肪酶与脂肪酸酯相互作用的研究第42-56页
   ·引言第42页
   ·结构模型化第42-44页
   ·分子对接数据预处理步骤第44页
   ·1LGY 活性部位的验证第44-47页
   ·不同链长脂肪酸酯与脂肪酶相互作用比较第47-53页
     ·C2 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果第47-49页
     ·C3 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果第49-50页
     ·C6 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果第50-51页
     ·C8 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果第51-52页
     ·C12 脂肪酸酯与脂肪酶1LGY 的对接结果第52-53页
   ·脂肪酶1LGY 底物专一性研究第53-55页
   ·本章小结第55-56页
第六章 总结与展望第56-57页
   ·工作总结第56页
   ·工作展望第56-57页
致谢第57-58页
参考文献第58-61页
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第61页

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