| 中文摘要 | 第1-13页 |
| 英文摘要 | 第13-18页 |
| 本文缩略语表 | 第18-19页 |
| 引言 | 第19-20页 |
| 第一部分 文献综述 | 第20-35页 |
| 1 主要的肠道细菌 | 第20-22页 |
| ·肠道硬壁菌门 | 第21-22页 |
| ·肠道拟杆菌门 | 第22页 |
| 2 检测肠道细菌丰度的方法 | 第22-25页 |
| ·对16S rRNA基因文库中的序列计数 | 第23-24页 |
| ·16S rRNA寡聚核苷酸探针原位杂交法 | 第24页 |
| ·定量PCR检测细菌群体的16S rRNA基因丰度 | 第24-25页 |
| ·其它方法 | 第25页 |
| 3 肠道细菌影响脂肪沉积 | 第25-30页 |
| ·肠道硬壁菌门和拟杆菌门对脂肪沉积的贡献 | 第25-26页 |
| ·细菌影响脂质代谢的机制 | 第26-30页 |
| 4 脂肪沉积影响肠道菌群 | 第30-34页 |
| ·不同基因型动物的脂肪沉积与肠道微生物 | 第30-32页 |
| ·不同生长阶段动物的脂肪沉积与肠道微生物 | 第32页 |
| ·采食不同日粮的动物的脂肪沉积与肠道微生物 | 第32-34页 |
| 5 存在问题 | 第34-35页 |
| 第二部分 研究目的、意义、内容及路线 | 第35-36页 |
| 1 研究目的及意义 | 第35页 |
| 2 研究内容 | 第35页 |
| 3 研究路线 | 第35-36页 |
| 第三部分 试验研究 | 第36-113页 |
| 试验一 建立定量PCR检测肠道硬壁菌门和拟杆菌门16S rRNA基因的方法 | 第36-59页 |
| 1 前言 | 第36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-46页 |
| ·材料 | 第36-38页 |
| ·方法 | 第38-46页 |
| ·菌株的培养及DNA提取 | 第38页 |
| ·寻找拟杆菌门和硬壁菌门的特异位点 | 第38页 |
| ·设计拟杆菌门和硬壁菌门引物 | 第38-42页 |
| ·引物的特异性检验 | 第42-44页 |
| ·质粒标准的制备和标准曲线 | 第44-46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-57页 |
| ·拟杆菌门和硬壁菌门的特异位点及引物 | 第46-47页 |
| ·菌株的DNA提取 | 第47-48页 |
| ·引物的特异性检验 | 第48-50页 |
| ·质粒标准的测序结果 | 第50-54页 |
| ·标准曲线 | 第54-57页 |
| 4 讨论 | 第57-58页 |
| 5 小结 | 第58-59页 |
| 试验二 肥胖和瘦的版纳微型近交系猪肠道硬壁菌门、拟杆菌门及拟杆菌属的差异 #41. | 第59-73页 |
| 1 前言 | 第59页 |
| 2 材料与方法 | 第59-62页 |
| ·材料 | 第59-60页 |
| ·方法 | 第60-62页 |
| ·粪便DNA的提取 | 第60页 |
| ·实时荧光定量PCR检测 | 第60-62页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第62页 |
| 3 结果与分析 | 第62-70页 |
| ·粪便DNA的提取 | 第62页 |
| ·标准曲线 | 第62-66页 |
| ·胖猪和瘦猪各类细菌拷贝数 | 第66-68页 |
| ·胖猪和瘦猪各类细菌的比例 | 第68-70页 |
| 4 讨论 | 第70-72页 |
| 5 小结 | 第72-73页 |
| 试验三 梅山和长白猪肠道硬壁菌门、拟杆菌门和拟杆菌属丰度与脂肪沉积的相关关系 | 第73-84页 |
| 1 前言 | 第73页 |
| 2 材料与方法 | 第73-77页 |
| ·材料 | 第73-75页 |
| ·方法 | 第75-77页 |
| ·饲养管理 | 第75页 |
| ·屠宰取样 | 第75页 |
| ·胴体指标的测定 | 第75页 |
| ·肉质指标的测定 | 第75-76页 |
| ·脂肪细胞直径和面积测量 | 第76-77页 |
| ·盲肠内容物DNA的提取 | 第77页 |
| ·盲肠内容物中各类细菌拷贝数的检测 | 第77页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第77页 |
| 3 结果与分析 | 第77-81页 |
| ·胴体指标及脂肪细胞大小 | 第77-78页 |
| ·肉质指标 | 第78页 |
| ·盲肠内容物DNA的提取 | 第78页 |
| ·梅山和长白猪各类细菌拷贝数 | 第78-80页 |
| ·梅山和长白猪各类细菌的比例 | 第80-81页 |
| 4 讨论 | 第81-83页 |
| 5 小结 | 第83-84页 |
| 试验四 脂肪型和瘦肉型猪在不同日龄肠道的硬壁菌门、拟杆菌门和拟杆菌属的变化 | 第84-94页 |
| 1 前言 | 第84页 |
| 2 材料与方法 | 第84-86页 |
| ·材料 | 第84-85页 |
| ·方法 | 第85-86页 |
| ·饲养管理 | 第85页 |
| ·粪便的采集 | 第85-86页 |
| ·粪便DNA的提取 | 第86页 |
| ·实时荧光定量PCR检测 | 第86页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第86页 |
| 3 结果与分析 | 第86-92页 |
| ·试猪各阶段的体重 | 第86页 |
| ·粪便DNA的提取 | 第86页 |
| ·标准曲线 | 第86-89页 |
| ·试猪在各日龄阶段的细菌拷贝数 | 第89-91页 |
| ·试猪各阶段肠道各类细菌的比例 | 第91-92页 |
| 4 讨论 | 第92-93页 |
| 5 小结 | 第93-94页 |
| 试验五 日粮碳水化合物和蛋白质比例对猪脂肪沉积、肠道微生物及相关基因表达的影响 | 第94-113页 |
| 1 前言 | 第94页 |
| 2 材料与方法 | 第94-100页 |
| ·材料 | 第94-96页 |
| ·方法 | 第96-100页 |
| ·饲养管理 | 第96页 |
| ·粪便的采集 | 第96页 |
| ·屠宰取样 | 第96页 |
| ·胴体指标的测定 | 第96-97页 |
| ·肉质指标的测定 | 第97页 |
| ·粪便和盲肠内容物DNA的提取 | 第97页 |
| ·粪便和盲肠内容物中各类细菌拷贝数的检测 | 第97页 |
| ·回肠、脂肪和肌肉组织脂肪沉积相关基因表达的检测 | 第97-100页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第100页 |
| 3 结果与分析 | 第100-109页 |
| ·胴体性状结果 | 第100-101页 |
| ·粪便或盲肠内容物DNA和组织总RNA的检测 | 第101页 |
| ·各类细菌拷贝数 | 第101-104页 |
| ·回肠、肌肉和脂肪中相关基因的表达 | 第104-109页 |
| 4 讨论 | 第109-112页 |
| 5 小结 | 第112-113页 |
| 第四部分 本研究的总体讨论和结论 | 第113-116页 |
| 1 总体讨论 | 第113-115页 |
| 2 总体结论 | 第115页 |
| 3 本研究的创新点 | 第115页 |
| 4 有待进一步研究的问题 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第126页 |
