| 符号及缩略语说明(Abbreviations) | 第1-10页 |
| 中文摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-59页 |
| 1 芸薹属基因组研究进展 | 第17-22页 |
| ·芸薹属植物基因组间亲缘关系 | 第17-18页 |
| ·芸薹属A、B 和C 基因组之间的关系 | 第18-19页 |
| ·芸薹属基因组结构和起源进化研究 | 第19-22页 |
| 2 分子原位杂交技术及其发展 | 第22-28页 |
| ·DNA 分子杂交技术的概念 | 第22页 |
| ·原位杂交技术的发展 | 第22-26页 |
| ·研究概况 | 第22-23页 |
| ·原位杂交技术的进展及应用 | 第23-26页 |
| ·FISH 在物理作图中的应用 | 第26-28页 |
| ·单拷贝或寡拷贝DNA 序列的FISH 物理作图 | 第26页 |
| ·重复序列和多基因家族的FISH 物理作图 | 第26-28页 |
| 3 核糖体基因在芸薹属中的研究应用 | 第28-32页 |
| ·核rDNA 序列的同步进化 | 第28-30页 |
| ·植物核rDNA-FISH 在芸薹属中的物理定位 | 第30-32页 |
| 4 甘蓝型油菜人工合成种的研究 | 第32-34页 |
| ·甘蓝型油菜的起源与进化 | 第32-33页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜的研究 | 第33页 |
| ·研究甘蓝型油菜人工合成种的目的与意义 | 第33-34页 |
| 5 植物异源多倍体形成过程中的基因组变异和表观遗传变异 | 第34-39页 |
| ·亲本序列消除 | 第34-36页 |
| ·基因组序列丢失发生的时间 | 第34-35页 |
| ·基因组序列丢失的非随机性 | 第35页 |
| ·影响序列消除的因素 | 第35-36页 |
| ·表观遗传变异 | 第36-39页 |
| ·核仁显性（nucleolar dominance） | 第37页 |
| ·基因沉默（Gene silencing） | 第37-38页 |
| ·转座元件激活 | 第38-39页 |
| ·DNA 甲基化与亲本印迹 | 第39页 |
| 6 蛋白质组学的研究 | 第39-47页 |
| ·蛋白质组学的历史背景 | 第39-41页 |
| ·植物蛋白质组学研究概况 | 第41-45页 |
| ·蛋白质组学研究必要性与意义 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-59页 |
| 第二章 芸薹属基本种 45S rDNA 重复序列的有丝分裂与减 数分裂的 FISH 定位分析 | 第59-68页 |
| 前言 | 第59-60页 |
| 1 材料与方法 | 第60-61页 |
| ·植物材料 | 第60页 |
| ·染色体制片 | 第60页 |
| ·探针的标记 | 第60页 |
| ·原位杂交 | 第60-61页 |
| ·信号检测和图像处理 | 第61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-62页 |
| 3 讨论 | 第62-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 第三章 着丝粒重复序列原位杂交及CAPS 标记分析芸薹属A、B 和C 基因组间的关系 | 第68-77页 |
| 前言 | 第68-69页 |
| 1 材料和方法 | 第69-70页 |
| ·植物材料 | 第69页 |
| ·试验方法 | 第69-70页 |
| ·染色体制片 | 第69页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第69页 |
| ·探针的制备 | 第69-70页 |
| ·原位杂交 | 第70页 |
| ·信号检测和图像处理 | 第70页 |
| ·FAE1 基因的克隆和CAPS 分析 | 第70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-73页 |
| ·原位杂交分析 | 第70-71页 |
| ·FAE1 基因的克隆和CAPS 分析 | 第71-73页 |
| 3 讨论 | 第73-74页 |
| 4 结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-77页 |
| 第四章 芸薹属种子贮藏蛋白质组分的比较研究 | 第77-86页 |
| 前言 | 第77-78页 |
| 1 材料与方法 | 第78-79页 |
| ·植物材料 | 第78页 |
| ·方法 | 第78-79页 |
| ·种子贮藏蛋白质样品的提取 | 第78页 |
| ·SDS-PAGE 电泳 | 第78-79页 |
| ·染色和脱色 | 第79页 |
| ·Rf 值及统计蛋白质亚基条带数 | 第79页 |
| 2 结果与分析 | 第79-84页 |
| ·油菜种子贮藏蛋白质亚基分析 | 第79-82页 |
| ·6 个种蛋白质亚基相似度及亲缘关系 | 第82-83页 |
| ·种间的遗传距离和聚类分析 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-86页 |
| 第五章 芸薹属A、C 基因组间比较蛋白质组学的分析及PCR 分子标记的开发 | 第86-115页 |
| 前言 | 第86-87页 |
| 1 材料与方法 | 第87-88页 |
| ·材料 | 第87页 |
| ·仪器与试剂 | 第87-88页 |
| 2 实验方法 | 第88-96页 |
| ·油菜叶片可溶性蛋白2-DE 样品的提取与溶解 | 第88页 |
| ·油菜叶片全蛋白的提取——三氯乙酸（TCA）/丙酮沉淀法 | 第88页 |
| ·蛋白质的溶解 | 第88页 |
| ·采用Bradford 法测定样品溶液中蛋白质含量 | 第88-90页 |
| ·溶液的配置 | 第89页 |
| ·标准曲线的制作 | 第89-90页 |
| ·双向凝胶电泳 | 第90-94页 |
| ·溶液的配置 | 第90-91页 |
| ·水化加样及第一向等电聚焦电泳（IEF） | 第91-92页 |
| ·胶条的平衡 | 第92页 |
| ·第二向SDS-PAGE 电泳 | 第92页 |
| ·凝胶染色 | 第92-93页 |
| ·凝胶成像及软件分析 | 第93页 |
| ·差异表达蛋白肽质量指纹谱的质谱测定 | 第93-94页 |
| ·质谱数据的数据库搜索 | 第94页 |
| ·根据差异蛋白的核酸序列合成引物进行PCR 反应 | 第94-96页 |
| ·试验材料 | 第94页 |
| ·油菜基因组DNA 的提取 | 第94-95页 |
| ·引物合成 | 第95-96页 |
| 3 结果与分析 | 第96-112页 |
| ·PDQuest 软件分析油菜二倍体芸薹与甘蓝叶片可溶性蛋白的差异 | 第96-98页 |
| ·差异表达蛋白的MALDI-TOF-MS 分析及数据库检索 | 第98-104页 |
| ·PCR 鉴定 | 第104-108页 |
| ·讨论与结论 | 第108-112页 |
| ·基于PMF 数据的蛋白质鉴定的评价 | 第108-109页 |
| ·白菜与甘蓝比较蛋白质组学的分析与讨论 | 第109-110页 |
| ·白菜与甘蓝间标记的开发 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-115页 |
| 第六章 利用差异蛋白质组对人工合成甘蓝型油菜F1及早期世代蛋白质变化的研究 | 第115-164页 |
| 第一节 人工合成甘蓝型油菜F1及其亲本叶片比较蛋白质组学研究 | 第115-136页 |
| 1 材料与方法 | 第116页 |
| ·实验材料 | 第116页 |
| 2 实验方法 | 第116页 |
| ·叶片可溶性蛋白的提取（参见第五章） | 第116页 |
| ·叶片可溶性蛋白双向电泳实验（参见第五章） | 第116页 |
| 3 结果与分析 | 第116-136页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜F1 代及其亲本二倍体叶片可溶性蛋白2-DE 蛋白质组的比较分析 | 第116-122页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜F1 中新出现蛋白点的数据库搜索结果 | 第122-125页 |
| ·新合成甘蓝型油菜F1 中新蛋白的功能分析 | 第125-130页 |
| ·与物质和能量的代谢相关蛋白 | 第125-129页 |
| ·转录相关蛋白 | 第129页 |
| ·抗病相关蛋白 | 第129-130页 |
| ·双向电泳分析油菜叶片蛋白质组的复杂性 | 第130-132页 |
| ·同一个蛋白质出现在凝胶的多个位置 | 第130-131页 |
| ·差异蛋白质的鉴定率 | 第131页 |
| ·功能未知蛋白 | 第131页 |
| ·质谱鉴定结果与图谱中蛋白点的偏差 | 第131-132页 |
| ·杂种F1 代与双亲叶片蛋白质组的比较分析 | 第132-136页 |
| 第二节 人工合成甘蓝型油菜早期世代蛋白质组的变化 | 第136-155页 |
| 1 材料与方法 | 第136-137页 |
| ·实验材料 | 第136-137页 |
| 2 实验方法 | 第137页 |
| ·花粉活性观察 | 第137页 |
| ·叶片可溶性蛋白的提取（参见第五章） | 第137页 |
| ·叶片可溶性蛋白双向电泳实验（参见第五章） | 第137页 |
| 3 结果与分析 | 第137-151页 |
| ·人工合成甘蓝型油菜F1~F4 代叶片可溶性蛋白的2-DE 电泳 | 第137-151页 |
| ·差异蛋白点的统计分析 | 第137-138页 |
| ·差异蛋白点的MALDI-TOF-MS 分析与鉴定 | 第138-143页 |
| ·鉴定蛋白质的功能分类 | 第143-144页 |
| ·差异蛋白点的功能推测 | 第144-151页 |
| 4 人工合成甘蓝型油菜后代表观遗传变化的分析 | 第151-155页 |
| 参考文献 | 第155-164页 |
| 致谢 | 第164-165页 |
| 博士期间发表的论文 | 第165页 |
