| 中文摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 目录 | 第10-14页 |
| 第1章 文献综述 | 第14-43页 |
| ·引言 | 第14页 |
| ·植物基因组学研究 | 第14-29页 |
| ·植物基因组测序进展 | 第15-17页 |
| ·比较基因组学与分子进化 | 第17-24页 |
| ·基因重复与基因家族 | 第18-20页 |
| ·禾本科植物比较基因组学研究 | 第20-22页 |
| ·分子进化研究 | 第22-24页 |
| ·相关数据库资源 | 第24页 |
| ·功能基因组学研究 | 第24-29页 |
| ·转录组学研究 | 第25-27页 |
| ·蛋白质组学研究 | 第27-28页 |
| ·植物基因功能研究方法 | 第28-29页 |
| ·Oxylipin 信号途径 | 第29-37页 |
| ·HPL 途径 | 第30-31页 |
| ·AOS 途径 | 第31-37页 |
| ·JA 的化学本质及生理功能 | 第31-32页 |
| ·JA 的生物合成及调节 | 第32-34页 |
| ·JA 信号的产生及转导 | 第34-36页 |
| ·JA 信号与其他防御途径信号的整合 | 第36-37页 |
| ·植物OPR 基因家族的生物学功能研究 | 第37-40页 |
| ·植物OPR 基因家族的分布及生化特性 | 第38-39页 |
| ·植物OPR 基因家族的生理功能 | 第39-40页 |
| ·本研究的目的、意义及技术路线 | 第40-43页 |
| 第2章 植物OPR 基因家族系统发育分析 | 第43-68页 |
| ·引言 | 第43-44页 |
| ·材料与方法 | 第44-47页 |
| ·数据检索与收集 | 第44页 |
| ·序列比对及系统发育分析 | 第44-45页 |
| ·基因结构及进化分析 | 第45页 |
| ·核酸替代模式及正选择分析 | 第45-46页 |
| ·功能分化分析 | 第46-47页 |
| ·结果与分析 | 第47-63页 |
| ·植物OPR 家族同源基因的鉴定 | 第47-48页 |
| ·植物OPR 基因家族系统发育分析 | 第48-52页 |
| ·植物OPR 家族基因结构进化 | 第52-56页 |
| ·植物OPR 亚家族及成员间正选择分析 | 第56-61页 |
| ·植物OPR 亚家族及成员间功能分化分析 | 第61-63页 |
| ·讨论 | 第63-67页 |
| ·植物OPR 基因家族的起源与进化 | 第63-64页 |
| ·植物OPR 基因家族的结构进化 | 第64-65页 |
| ·植物OPR 基因家族的功能分化 | 第65-67页 |
| ·小结 | 第67-68页 |
| 第3章 OsOPR 家族基因分子生物学功能研究 | 第68-163页 |
| ·引言 | 第68-71页 |
| ·OsOPR 家族基因蛋白结构及生化功能研究 | 第71-117页 |
| ·材料与试剂 | 第71-81页 |
| ·菌株与载体 | 第71-72页 |
| ·仪器与试剂 | 第72-81页 |
| ·实验方法 | 第81-95页 |
| ·蛋白同源建模 | 第81-82页 |
| ·核酸凝胶电泳 | 第82-84页 |
| ·质粒DNA 提取 | 第84-85页 |
| ·目的DNA 片段回收、纯化及与载体连接 | 第85-86页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞制备、转化及重组子鉴定 | 第86-88页 |
| ·SDS-PAGE 凝胶电泳 | 第88-89页 |
| ·GST 融合表达载体构建及表达体系优化 | 第89-91页 |
| ·GST 融合蛋白分离、纯化及酶活性分析 | 第91-95页 |
| ·结果与分析 | 第95-117页 |
| ·OsOPR 蛋白同源建模模板选择 | 第95-97页 |
| ·OsOPR 蛋白同源建模及结构比较 | 第97-103页 |
| ·GST-OsOPR 融合表达载体构建 | 第103-107页 |
| ·GST-OsOPR 融合表达体系优化 | 第107-109页 |
| ·GST-OsOPR 融合蛋白表达与纯化 | 第109-112页 |
| ·GST-OsOPR 融合蛋白酶活性分析 | 第112-117页 |
| ·OsOPR 家族基因生理功能研究 | 第117-158页 |
| ·材料与试剂 | 第118-125页 |
| ·植物材料 | 第118-119页 |
| ·菌株与载体 | 第119-120页 |
| ·仪器与试剂 | 第120-125页 |
| ·实验方法 | 第125-140页 |
| ·启动子顺式作用元件分析 | 第125页 |
| ·MPSS 芯片数据分析 | 第125页 |
| ·水稻幼苗诱导处理 | 第125-127页 |
| ·植物总RNA 提取及半定量RT-PCR | 第127-130页 |
| ·农杆菌感受态细胞制备、转化及重组子鉴定 | 第130-132页 |
| ·过表达载体构建及烟草叶盘法转化 | 第132-136页 |
| ·转基因烟草DNA 及RNA 水平分子鉴定 | 第136-138页 |
| ·过表达转基因烟草逆境胁迫处理 | 第138-140页 |
| ·结果与分析 | 第140-158页 |
| ·OsOPR 家族基因启动子分析 | 第140-141页 |
| ·MPSS 数据库分析OsOPR 家族基因表达谱 | 第141-144页 |
| ·半定量RT-PCR 分析OsOPR 家族基因表达谱 | 第144-148页 |
| ·OsOPR 家族基因过表达转化烟草的初步研究 | 第148-158页 |
| ·讨论 | 第158-162页 |
| ·OsOPR 家族基因可能的生物学功能 | 第158-162页 |
| ·小结 | 第162-163页 |
| 第4章 总结与展望 | 第163-168页 |
| ·总结 | 第163-166页 |
| ·植物OPR 基因家族系统进化研究 | 第163-164页 |
| ·OsOPR 家族基因分子生物学功能研究 | 第164-166页 |
| ·展望 | 第166-168页 |
| 参考文献 | 第168-184页 |
| 附录 | 第184-221页 |
| 附录1 缩略词表 | 第184-187页 |
| 附录2 植物OPR 家族基因信息 | 第187-191页 |
| 附录3 植物OPR 家族基因氨基酸序列比对 | 第191-198页 |
| 附录4 植物OPR 家族基因系统发育树 | 第198-199页 |
| 附录5 植物OPR 家族蛋白功能分化相关氨基酸位点分布 | 第199-200页 |
| 附录6 OsOPR 家族基因干涉转化水稻的初步研究 | 第200-218页 |
| 附录7 本研究所用引物序列信息 | 第218-220页 |
| 附录8 在研期间论文发表情况 | 第220-221页 |
| 致谢 | 第221页 |
