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染色体3p21.3区域中口腔鳞癌相关候选抑瘤基因的筛选及其功能的初步研究

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-21页
前言第21-25页
技术路线图第25-27页
第一章 3p21.3区候选抑瘤基因在口腔鳞状细胞癌中的筛选及其甲基化在基因表达中的作用第27-54页
 第一节 材料和方法第27-37页
  1 材料第27-31页
   ·细胞和细胞系第27页
   ·标本第27-28页
   ·引物第28-29页
     ·RT-PCR引物第28-29页
     ·MSP引物第29页
   ·菌株和载体第29-30页
     ·菌株第29页
     ·载体第29-30页
   ·主要试剂/试剂盒第30页
   ·主要仪器和设备第30-31页
  2 方法第31-37页
   ·组织和细胞总RNA的提取第31-32页
     ·RNA的制备第31页
     ·RNA中痕量DNA的去除第31页
     ·总RNA的鉴定第31-32页
   ·两步法差异RT-PCR第32-33页
     ·逆转录反应第32页
     ·PCR反应第32页
     ·平台期循环数的确定第32-33页
     ·灰度扫描与分析第33页
   ·组织和细胞基因组DNA的提取第33页
   ·MSPCR第33-34页
     ·亚硫酸盐处理DNA第33-34页
     ·MSP第34页
     ·结果判定及分析第34页
   ·PCR产物纯化测序第34-35页
   ·甲基化产物测序第35-36页
     ·制备感受态第35页
     ·连接T载体第35页
     ·质粒转化第35-36页
     ·测序第36页
   ·5-aza-2’-deoxycytidine(5-Aza-CdR)处理舌癌细胞系第36页
   ·统计学方法第36-37页
 第二节 实验结果第37-46页
  1 生物信息学分析确定待分析基因第37页
  2 RNA质量检测第37-38页
  3 基因扩增平台期的测定第38页
  4 半定量RT-PCR检测候选基因的表达情况第38-40页
  5 四个下调基因在TCA8113细胞和36对OSCC组织中的表达第40-42页
  6 MSP分析基因在OSCC及其癌旁对照组织中甲基化情况第42-46页
 第三节 分析与讨论第46-54页
  1 染色体3p21.3区候选抑瘤基因在OSCC中的表达第46-51页
  2 启动子区异常甲基化对基因表达的影响第51-54页
第二章 LTF基因在舌癌中的生物学功能研究第54-78页
 第一节 材料与方法第54-64页
  1 材料第54-57页
   ·细胞系第54页
   ·标本第54-55页
   ·菌株和载体第55-56页
   ·引物第56页
   ·主要试剂第56-57页
   ·主要仪器第57页
  2 方法第57-64页
   ·组织和细胞总RNA的提取第57页
   ·Real-time quantitative PCR(实时荧光定量PCR)第57-58页
   ·免疫组化第58页
   ·LTF/pcDNA3.1(-)真核表达载体的构建第58-60页
     ·质粒酶切、纯化和重组第58-59页
     ·质粒转化第59页
     ·LTF/pcDNA3.1真核表达载体的鉴定第59-60页
   ·细胞转染第60页
   ·建立稳定表达LTF基因的TCA8113舌癌细胞系第60页
   ·培养细胞的蛋白质制备第60-61页
   ·BCA法蛋白定量第61页
   ·Western Blotting分析第61页
   ·免疫细胞化学第61-62页
   ·平板克隆形成实验第62页
   ·噻唑蓝(MTT)比色实验检测细胞增殖能力第62-63页
   ·流式细胞仪检测细胞周期第63页
   ·统计学方法第63-64页
 第二节 实验结果第64-75页
  1 Real-time RT-PCR分析LTF的表达第64页
  2 LTF蛋白在口腔鳞癌组织中的定位表达第64-66页
  3 LTF基因mRNA水平以及蛋白水平表达分析的小结第66页
  4 真核表达载体LTF/pcDNA3.1(-)的构建第66-69页
   ·载体构建策略及流程第66-67页
   ·pCMV6-XL5-LTF载体的鉴定第67-68页
   ·真核表达载体LTF/pcDNA3.1(-)的构建第68-69页
  5 建立稳定表达LTF基因的TCA8113细胞系第69-72页
   ·细胞克隆的筛选第69-70页
   ·RT-PCR分析稳定转染的细胞克隆中LTF基因mRNA水平的表达第70页
   ·PCR鉴定稳定转染细胞中pcDNA3.1(-)载体的整合第70页
   ·Western Blotting检测稳定转染后TCA8113细胞中LTF蛋白的表达第70-71页
   ·免疫细胞化学检测LTF蛋白的表达及定位第71-72页
  6 稳定转染LTF基因对舌癌细胞TCA8113细胞生物学特性的影响第72-75页
   ·LTF基因对细胞增殖能力的影响第72-73页
   ·平板克隆形成实验第73-74页
   ·LTF基因对细胞周期的影响第74-75页
 第三节 分析与讨论第75-78页
结论第78-79页
参考文献第79-90页
综述第90-110页
攻读学位期间主要研究成果(第一作者)第110页
在读期间承担课题(第三责任人)第110-111页
致谢第111页

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