基于网络与通路的肝细胞性肝癌生物靶点筛选及综合分析
| 中文摘要 | 第4-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 缩略语/符号说明 | 第14-15页 |
| 一、前言 | 第15-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-18页 |
| 1.1.1 肝细胞性肝癌 | 第15-17页 |
| 1.1.2 表达谱芯片数据挖掘 | 第17-18页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第18页 |
| 1.3 研究内容及方法 | 第18-19页 |
| 1.4 论文创新点 | 第19-20页 |
| 1.5 论文结构安排 | 第20-21页 |
| 二、原理和方法 | 第21-36页 |
| 2.1 数据 | 第21-25页 |
| 2.1.1 数据检索与标准制定 | 第21-22页 |
| 2.1.2 肝细胞癌症差异表达基因的获得与筛选 | 第22-24页 |
| 2.1.2.1 差异表达基因的获得 | 第22-23页 |
| 2.1.2.2 差异表达基因的筛选 | 第23-24页 |
| 2.1.3 参考基因集的收集 | 第24页 |
| 2.1.4 人类蛋白质互作数据的获取 | 第24-25页 |
| 2.2 功能富集分析 | 第25-28页 |
| 2.2.1 KEGG功能分析 | 第27-28页 |
| 2.2.2 Gene Ontology 功能分析 | 第28页 |
| 2.3 通路互作分析 | 第28-30页 |
| 2.4 网络分析 | 第30-33页 |
| 2.4.1 HCC疾病特异网络的构建 | 第31-32页 |
| 2.4.2 疾病模块的构建以及功能分析 | 第32页 |
| 2.4.3 HCC疾病特异网络拓扑分析 | 第32-33页 |
| 2.4.4 核心基因的筛选 | 第33页 |
| 2.5 生存分析 | 第33-35页 |
| 2.6 研究流程框图 | 第35-36页 |
| 三、结果与分析 | 第36-58页 |
| 3.1 肝细胞癌症差异表达基因的获得与筛选 | 第36-38页 |
| 3.1.1 差异表达基因的获得 | 第36-37页 |
| 3.1.2 差异表达基因的筛选 | 第37-38页 |
| 3.2 功能富集分析 | 第38-44页 |
| 3.2.1 KEGG功能分析 | 第38-43页 |
| 3.2.2 Gene Ontology功能分析 | 第43-44页 |
| 3.3 通路互作分析 | 第44-51页 |
| 3.4 网络分析 | 第51-56页 |
| 3.4.1 HCC疾病特异网络的构建 | 第51页 |
| 3.4.2 疾病模块的构建以及功能分析 | 第51-54页 |
| 3.4.3 HCC疾病特异网络拓扑分析 | 第54-55页 |
| 3.4.4 核心基因的筛选 | 第55-56页 |
| 3.5 生存分析 | 第56-58页 |
| 四、讨论与结论 | 第58-64页 |
| 4.1 讨论 | 第58-62页 |
| 4.1.1 功能富集分析及网络分析 | 第58-61页 |
| 4.1.2 核心基因的筛选 | 第61-62页 |
| 4.2 结论 | 第62-63页 |
| 4.3 发展与展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第71-72页 |
| 附录1 | 第72-75页 |
| 附录2 | 第75-76页 |
| 附录3 | 第76-79页 |
| 综述 通路映射与疾病特异性生物标记的发展 | 第79-92页 |
| 综述参考文献 | 第86-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 个人简历 | 第93页 |
