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蚂蚁共生放线菌Streptomyces capitiformicae的鉴定及全基因组测序分析

摘要第8-10页
英文摘要第10-11页
1 前言第12-20页
    1.1 昆虫共生菌研究进展第12-16页
        1.1.1 昆虫共生微生物简介第12-13页
        1.1.2 昆虫共生菌与宿主的关系及作用第13页
        1.1.3 昆虫共生微生物次级代谢产物中醌酮类化合物研究进展第13-16页
    1.2 链霉菌新种多相分类学鉴定方法研究进展第16-17页
    1.3 日本弓背蚁及相关菌群的研究进展第17-18页
        1.3.1 日本弓背蚁简介第17页
        1.3.2 关于日本弓背蚁相关菌群的研究进展第17-18页
    1.4 全基因组测序技术研究进展及其概述第18页
    1.5 研究目的及意义第18-20页
2 材料与方法第20-27页
    2.1 菌株来源第20页
    2.2 试剂与仪器第20-21页
        2.2.1 试剂第20页
        2.2.2 仪器第20-21页
    2.3 主要培养基和试剂的配制方法第21页
    2.4 新种的多相分类学鉴定第21-24页
        2.4.1 形态和培养特征鉴定第21-22页
        2.4.2 生理生化特性鉴定第22页
        2.4.3 化学分类学鉴定第22-23页
        2.4.4 分子水平鉴定第23-24页
    2.5 昆虫共生菌的次级代谢产物分离第24-25页
        2.5.1 发酵培养基的筛选和处理第24-25页
        2.5.2 次级代谢产物分离步骤第25页
    2.6 全基因组数据分析方法第25-27页
        2.6.1 原始数据处理方法第25页
        2.6.2 次级代谢产物在线分析方法第25-26页
        2.6.3 蛋白直系同源簇(COG)注释方法第26-27页
3 结果与分析第27-41页
    3.1 菌株1H-SSA4~T的多相分类学鉴定结果与分析第27-32页
        3.1.1 16SrRNA基因测序及系统发育分析第27页
        3.1.2 形态及培养特征第27-28页
        3.1.3 生理生化特性第28-29页
        3.1.4 化学分类学鉴定结果分析第29-31页
        3.1.5 DNA同源性分析第31-32页
    3.2 次级代谢产物分离第32-37页
        3.2.1 发酵培养基筛选第32页
        3.2.2 主产化合物分离第32-37页
    3.3 全基因组测序分析第37-41页
        3.3.1 全基因组序列概述第37-38页
        3.3.2 次级代谢产物合成基因簇分析结果第38-39页
        3.3.3 蛋白直系同源簇(COG)数据分析结果第39-41页
4 讨论第41-43页
    4.1 昆虫内生放线菌的多样性及活性研究第41页
    4.2 ANGUCYCLINONE类抗生素研究第41-42页
    4.3 昆虫共生放线菌的科研潜力第42-43页
5 结论第43-44页
    5.1 主要结论第43页
    5.2 本研究的主要创新第43-44页
致谢第44-45页
参考文献第45-52页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第52页

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