基于宿主防御素基因表达谱判别细菌病毒感染的研究
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略词表 | 第10-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-25页 |
| 1.1 感染与其诊断方法 | 第12-14页 |
| 1.2 机器学习与感染类型的判别 | 第14-19页 |
| 1.3 防御素与感染 | 第19-22页 |
| 1.4 GEO数据库 | 第22-23页 |
| 1.5 研究内容 | 第23-25页 |
| 第二章 数据的整合和预处理 | 第25-41页 |
| 2.1 本实验的目的 | 第25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-33页 |
| 2.2.1 R语言 | 第25-26页 |
| 2.2.2 GEO数据集的选择和下载 | 第26-27页 |
| 2.2.3 数据的整合 | 第27-28页 |
| 2.2.4 数据的预处理 | 第28页 |
| 2.2.5 防御素基因表达值的提取 | 第28-33页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第33-40页 |
| 2.4 小结 | 第40-41页 |
| 第三章 利用机器学习的方法判别感染类型 | 第41-65页 |
| 3.1 本实验的目的 | 第41页 |
| 3.2 实验方法 | 第41-53页 |
| 3.2.1 差异基因表达分析 | 第41-45页 |
| 3.2.2 定义分类函数 | 第45-46页 |
| 3.2.3 参数选择与分类模型评价 | 第46-48页 |
| 3.2.4 数据验证与结果比较 | 第48-53页 |
| 3.3 实验结果与讨论 | 第53-64页 |
| 3.4 小结 | 第64-65页 |
| 第四章 讨论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
