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水稻对稻瘟菌侵染胁迫应答机制的定量蛋白质组学研究

摘要第2-6页
Abstract第6-10页
第一章 文献综述第15-47页
    1.1 水稻及稻瘟菌的研究进展第15-27页
        1.1.1 稻瘟菌的生活周期研究第16-19页
            1.1.1.1 稻瘟病菌的侵染循环第16页
            1.1.1.2 孢子萌发第16页
            1.1.1.3 附着胞的分化和成熟第16-17页
            1.1.1.4 侵入栓形成和侵入第17-18页
            1.1.1.5 侵入后的菌丝分化与扩展第18页
            1.1.1.6 产孢与再侵染第18-19页
        1.1.2 稻瘟菌基因组学研究第19-20页
        1.1.3 稻瘟菌与水稻之间的“基因对基因”研究进展第20-21页
        1.1.4 水稻的病害控制第21-22页
        1.1.5 水稻抗病的分子机理研究进展第22-27页
            1.1.5.1 水稻抗病与水杨酸(SA)信号传导途径第23-24页
            1.1.5.2 水稻抗病与茉莉酸/乙烯信号传导途径第24-25页
            1.1.5.3 水稻抗病与生长素信号传导途径第25-26页
            1.1.5.4 水稻抗病性与ABA信号传导途径第26页
            1.1.5.5 水稻抗病性与其他信号传导途径第26-27页
    1.2 蛋白质组学研究进展第27-37页
        1.2.1 基于生物质谱的蛋白质组学研究第27-33页
            1.2.1.1 离子化技术第27-28页
            1.2.1.2 质谱仪的质量分析器,及串联质谱第28-30页
            1.2.1.3 质谱采集模式的研究进展第30-33页
        1.2.2 定量蛋白质组学研究及进展第33-37页
            1.2.2.1 蛋白质组学相对定量技术第34-37页
                1.2.2.1.1 体内标记相对定量技术第34-35页
                1.2.2.1.2 体外标记相对定量技术第35-37页
                1.2.2.1.3 非标记相对定量技术第37页
    1.3 水稻响应生物胁迫的比较蛋白质组学研究进展第37-39页
    参考文献第39-47页
第二章 稻瘟菌侵染不同时间对水稻叶片蛋白表达的影响第47-85页
    2.1 引言第47-48页
    2.2 材料与方法第48-57页
        2.2.1 试剂耗材第48页
        2.2.2 仪器设备第48页
        2.2.3 实验菌株第48页
        2.2.4 培养基制备第48-49页
        2.2.5 菌株保存第49页
        2.2.6 菌株活化及菌丝培养第49-50页
        2.2.7 水稻培养第50页
        2.2.8 水稻接种第50-51页
        2.2.9 水稻叶片蛋白提取第51页
        2.2.10 水稻蛋白样品置换buffer第51页
        2.2.11 BCA定量分析蛋白质浓度第51-52页
        2.2.12 水稻叶片蛋白样品胰酶酶解第52页
        2.2.13 iTRAQ试剂标记样品第52页
        2.2.14 复杂标记肽段SCX分级第52-53页
        2.2.15 固相萃取小柱去除洗脱液样本中的盐成分第53-54页
        2.2.16 在线反向色谱分离标记肽段第54页
        2.2.17 质谱采集参数设置第54-55页
        2.2.18 数据库搜索及软件分析第55页
        2.2.19 结果筛选第55页
        2.2.20 Real-time PCR及数据分析第55-57页
    2.3 实验结果第57-72页
        2.3.1 质谱鉴定结果第57-58页
        2.3.2 差异表达蛋白的筛选第58-64页
        2.3.3 生物信息学分析第64-72页
            2.3.3.1 筛选到的差异蛋白进行GO (Gene Ontology)分类第64-66页
            2.3.3.2 差异蛋白参与的KEGG代谢途径分析第66页
            2.3.3.3 通过SignalP对差异蛋白进行分泌蛋白预测分析第66-69页
            2.3.3.4 差异表达蛋白功能富集分析第69-70页
            2.3.3.5 差异表达蛋白质在线进行相互作用分析第70-72页
    2.4 讨论第72-83页
        2.4.1 数据的可靠性第72-73页
        2.4.2 胰蛋白酶抑制剂在稻瘟菌侵染过程中的作用第73-77页
        2.4.3 稻瘟菌侵染水稻过程对光合作用的影响第77-80页
        2.4.4 稻瘟菌侵染水稻后对细胞能量代谢变化的影响第80-83页
        2.4.5 小结第83页
    参考文献第83-85页
第三章 稻瘟菌侵染对不同抗性水稻叶片蛋白表达的影响第85-115页
    3.1 引言第85-86页
    3.2 材料与方法第86-90页
        3.2.1 试剂耗材第86页
        3.2.2 仪器设备第86页
        3.2.3 实验菌株第86页
        3.2.4 培养基制备第86页
        3.2.5 菌株保存第86页
        3.2.6 菌株活化及菌丝培养第86页
        3.2.7 水稻生长第86页
        3.2.8 接种第86-87页
        3.2.9 水稻叶片蛋白提取第87页
        3.2.10 水稻蛋白样品置换buffer第87页
        3.2.11 BCA定量分析蛋白质浓度第87页
        3.2.12 水稻叶片蛋白样品胰酶酶解第87页
        3.2.13 iTRACQ试剂标记样品第87页
        3.2.14 复杂标记肽段SCX分级第87-88页
        3.2.15 固相萃取小柱去除洗脱液样本中的盐成分第88页
        3.2.16 在线反向色谱分离标记肽段第88页
        3.2.17 质谱采集参数设置第88页
        3.2.18 数据库搜索及软件分析第88页
        3.2.19 结果筛选第88页
        3.2.20 Real-time PCR及数据分析第88-90页
    3.3 结果第90-106页
        3.3.1 质谱鉴定结果第90-92页
        3.3.2 差异表达蛋白的筛选第92-97页
        3.3.3 生物信息学分析第97-106页
    3.4 讨论第106-114页
        3.4.1 数据的可靠性第106-107页
        3.4.2 胰蛋白酶抑制剂在稻瘟菌侵染不同抗性植株时的表达第107-110页
        3.4.3 稻瘟菌侵染不同抗性植株时对光合作用的影响第110-112页
        3.4.4 稻瘟菌侵染不同抗性植株对能量代谢的影响第112-113页
        3.4.5 小结第113-114页
    参考文献第114-115页
第四章 总结及讨论第115-117页
致谢第117-118页
攻读学位期间发表的学术论文目录第118-119页

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