| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-33页 |
| 1.1 菊芋简介 | 第15-16页 |
| 1.1.1 菊芋生物学特性及生态适应性 | 第15页 |
| 1.1.2 菊芋应用研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2 植物绿原酸的研究进展 | 第16-25页 |
| 1.2.1 绿原酸的理化性质 | 第16页 |
| 1.2.2 绿原酸在植物中的分布 | 第16页 |
| 1.2.3 绿原酸的生物活性与应用 | 第16-17页 |
| 1.2.4 植物绿原酸提取与检测方法 | 第17-19页 |
| 1.2.5 植物绿原酸生物合成途径研究现状 | 第19-22页 |
| 1.2.6 绿原酸合成途径相关基因研究现状 | 第22-24页 |
| 1.2.7 菊芋绿原酸的研究现状 | 第24-25页 |
| 1.3 植物对逆境胁迫的响应 | 第25-27页 |
| 1.3.1 植物对盐胁迫的响应研究 | 第25-26页 |
| 1.3.2 植物对高温胁迫的响应研究 | 第26-27页 |
| 1.4 转录组测序及电子克隆技术的应用 | 第27-30页 |
| 1.4.1 转录组测序在植物抗逆中的应用 | 第28-29页 |
| 1.4.2 电子克隆技术在绿原酸合成相关基因研究中的应用 | 第29-30页 |
| 1.5 本课题的研究目的意义与技术路线 | 第30-33页 |
| 1.5.1 研究目的意义 | 第30-31页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第31-33页 |
| 第二章 高温与盐胁迫下菊芋绿原酸含量变化的分析 | 第33-47页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第33-35页 |
| 2.1.1 材料的处理与采集 | 第33-34页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第34页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第34-35页 |
| 2.2 实验方法 | 第35页 |
| 2.2.1 绿原酸标准品溶液制备 | 第35页 |
| 2.2.2 样品测定溶液制备 | 第35页 |
| 2.2.3 检测条件 | 第35页 |
| 2.2.4 数据处理统计方法 | 第35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-43页 |
| 2.3.1 绿原酸标准曲线和菊芋不同组织绿原酸含量分析 | 第35-37页 |
| 2.3.2 江苏大丰不同品种不同生长时间菊芋叶片绿原酸分析 | 第37-38页 |
| 2.3.3 海南三亚不同品种不同生长时间菊芋叶片绿原酸分析 | 第38-39页 |
| 2.3.4 江苏大丰与海南三亚不同品种菊芋叶片绿原酸含量比较分析 | 第39-40页 |
| 2.3.5 高温胁迫下南菊芋1号幼苗叶片绿原酸含量分析 | 第40-41页 |
| 2.3.6 不同盐分地区南菊芋1号不同生长时间叶片绿原酸含量分析 | 第41-42页 |
| 2.3.7 NaCl胁迫下南菊芋1号幼苗叶片绿原酸含量分析 | 第42-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-44页 |
| 2.5 本章小结 | 第44-47页 |
| 第三章 高温胁迫下南菊芋1号叶片转录组分析 | 第47-73页 |
| 3.1 材料与仪器 | 第47-48页 |
| 3.1.1 材料的处理与采集 | 第47页 |
| 3.1.2 试验试剂 | 第47页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第47-48页 |
| 3.2 实验方法 | 第48-50页 |
| 3.2.1 测序文库的构建 | 第48页 |
| 3.2.2 序列分析 | 第48页 |
| 3.2.3 unigene的注释 | 第48-49页 |
| 3.2.4 基因表达分析 | 第49页 |
| 3.2.5 差异表达分析 | 第49页 |
| 3.2.6 转录组Unigene定量PCR验证引物设计 | 第49页 |
| 3.2.7 菊芋总RNA的提取及反转录 | 第49页 |
| 3.2.8 荧光定量PCR及数据处理 | 第49-50页 |
| 3.3 结果与分析 | 第50-70页 |
| 3.3.1 RNA-seq测序和De novo拼接结果统计 | 第50-52页 |
| 3.3.2 unigene注释结果 | 第52-55页 |
| 3.3.3 PCA分析和聚类分析 | 第55-56页 |
| 3.3.4 unigene表达分析 | 第56-62页 |
| 3.3.5 差异表达unigene的GO富集分析 | 第62-63页 |
| 3.3.6 差异表达unigene的KEGG富集分析 | 第63-64页 |
| 3.3.7 unigene定量PCR验证 | 第64-65页 |
| 3.3.8 绿原酸合成途径注释的unigene分析 | 第65-70页 |
| 3.4 讨论 | 第70-72页 |
| 3.5 本章小结 | 第72-73页 |
| 第四章 菊芋绿原酸合成途径相关基因的克隆与组织表达 | 第73-89页 |
| 4.1 材料与仪器 | 第73页 |
| 4.1.1 材料的处理与采集 | 第73页 |
| 4.1.2 试验试剂 | 第73页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第73页 |
| 4.2 实验方法 | 第73-76页 |
| 4.2.1 菊芋总RNA的提取及反转录 | 第73页 |
| 4.2.2 菊芋绿原酸合成途径相关基因的克隆 | 第73-74页 |
| 4.2.3 引物设计及PCR程序 | 第74页 |
| 4.2.4 转化 | 第74页 |
| 4.2.5 相关基因的生物信息学分析 | 第74页 |
| 4.2.6 荧光定量PCR及数据处理 | 第74-76页 |
| 4.3 结果与分析 | 第76-86页 |
| 4.3.1 PAL1和PAL2的克隆与生物信息学分析 | 第76-78页 |
| 4.3.2 4CL1的克隆与生物信息学分析 | 第78-79页 |
| 4.3.3 HCT的克隆与生物信息学分析 | 第79-81页 |
| 4.3.4 C3H1的克隆与生物信息学分析 | 第81-82页 |
| 4.3.5 HQT的克隆与生物信息学分析 | 第82-84页 |
| 4.3.6 CCoAOMT1的克隆与生物信息学分析 | 第84-85页 |
| 4.3.7 菊芋不同组织相关基因的表达 | 第85-86页 |
| 4.4 讨论 | 第86-87页 |
| 4.5 本章小结 | 第87-89页 |
| 第五章 高温和盐胁迫对菊芋绿原酸合成途径的影响 | 第89-103页 |
| 5.1 材料与仪器 | 第89页 |
| 5.1.1 材料的处理与采集 | 第89页 |
| 5.1.2 主要试剂 | 第89页 |
| 5.1.3 主要仪器 | 第89页 |
| 5.2 实验方法 | 第89页 |
| 5.3 结果与分析 | 第89-99页 |
| 5.3.1 江苏大丰南菊芋1号叶片不同生长时间相关基因的表达 | 第89-90页 |
| 5.3.2 海南三亚南菊芋1号叶片不同生长时间相关基因的表达 | 第90-91页 |
| 5.3.3 江苏大丰与海南三亚南菊芋1号叶片相关基因表达的比较 | 第91-93页 |
| 5.3.4 高温胁迫下南菊芋1号幼苗叶片相关基因的表达 | 第93-94页 |
| 5.3.5 不同盐分地区南菊芋1号叶片不同生长时间相关基因的表达 | 第94-97页 |
| 5.3.6 盐胁迫下南菊芋1号幼苗叶片相关基因表达分析 | 第97-99页 |
| 5.4 讨论 | 第99-101页 |
| 5.5 本章小结 | 第101-103页 |
| 全文总结 | 第103-105页 |
| 创新点 | 第105-107页 |
| 展望 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-121页 |
| 攻读硕士学位期间已发表和拟发表论文 | 第121-123页 |
| 致谢 | 第123-125页 |
| 附录一 | 第125-127页 |
| 附录二 | 第127-131页 |
