| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 上篇 文献综述 | 第14-75页 |
| 第一章 植物病原真菌和卵菌效应分子研究进展 | 第15-45页 |
| 1 植物病原真菌和卵菌模式系统研究进展 | 第16-23页 |
| 1.1 番茄叶霉-番茄互作体系研究 | 第16-18页 |
| 1.2 稻瘟病菌-水稻互作体系研究 | 第18-20页 |
| 1.3 玉米黑粉菌-玉米互作体系研究 | 第20页 |
| 1.4 卵菌-寄主互作体系研究 | 第20-23页 |
| 2 病原菌效应分子的毒性机制研究进展 | 第23-30页 |
| 2.1 抑制植物PTI信号途径 | 第23-24页 |
| 2.2 作用于抗病蛋白复合体 | 第24页 |
| 2.3 调控植物激素信号通路 | 第24-26页 |
| 2.4 改变靶标蛋白的定位 | 第26-27页 |
| 2.5 抑制MAPK信号途径 | 第27页 |
| 2.6 抑制RNA沉默 | 第27-28页 |
| 2.7 作用于蛋白复合体 | 第28页 |
| 2.8 其它操控方式 | 第28-30页 |
| 参考文献 | 第30-45页 |
| 第二章 表观修饰与寄主免疫反应 | 第45-75页 |
| 1 表观修饰与免疫反应研究进展 | 第45-55页 |
| 1.1 组蛋白修饰(Histone modification)与寄主免疫反应 | 第45-49页 |
| 1.2 DNA甲基化(DNA methylation)与寄主免疫反应 | 第49-51页 |
| 1.3 非编码RNA调控与寄主免疫反应 | 第51-53页 |
| 1.4 染色体重塑与寄主免疫反应 | 第53-55页 |
| 2 SAGA复合体研究进展 | 第55-62页 |
| 2.1 SAGA复合体概述 | 第55-59页 |
| 2.1.1 去泛素化模块(DUBm) | 第56-57页 |
| 2.1.2 组蛋白乙酰化模块(HAT module) | 第57页 |
| 2.1.3 SPT模块 | 第57-58页 |
| 2.1.4 TAF模块 | 第58-59页 |
| 2.2 SAGA复合体在基因调控中的作用 | 第59-62页 |
| 2.2.1 SAGA复合体调控盐分和干旱响应 | 第59-60页 |
| 2.2.2 SAGA复合体调控寒冷响应 | 第60页 |
| 2.2.3 SAGA复合体调控光信号响应 | 第60页 |
| 2.2.4 SAGA复合体调控营养响应 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-75页 |
| 下篇 研究内容 | 第75-157页 |
| 第一章 大豆疫霉RXLR效应分子Avh23功能分析 | 第77-97页 |
| 1 材料与方法 | 第79-86页 |
| 1.1 供试植物与菌株 | 第79-80页 |
| 1.2 数据库及序列比对 | 第80页 |
| 1.3 多态性比对分析 | 第80页 |
| 1.4 Avh23表达量分析 | 第80页 |
| 1.5 PCR扩增程序和酶切体系 | 第80页 |
| 1.6 RNA的提取 | 第80-81页 |
| 1.7 大肠杆菌超级感受态的制备 | 第81页 |
| 1.8 农杆菌GV3101电转感受态细胞的制备 | 第81-82页 |
| 1.9 农杆菌GV3101感受态细胞的电转化 | 第82页 |
| 1.10 烟草中农杆菌介导的瞬时表达 | 第82页 |
| 1.11 培养基制备 | 第82-83页 |
| 1.12 PEG介导的大豆疫霉原生质体转化技术 | 第83-84页 |
| 1.13 CRISP/Cas9技术介导的Avh23在大豆疫霉中的敲除 | 第84-85页 |
| 1.14 Avh23敲除转化子基因组DNA的提取和PCR | 第85页 |
| 1.15 Avh23敲除转化子生长速率和致病性测定 | 第85-86页 |
| 2 结果与分析 | 第86-91页 |
| 2.1 Avh23在侵染阶段诱导表达 | 第86页 |
| 2.2 Avh23在大豆疫霉四个生理小种之间无多态性 | 第86-87页 |
| 2.3 Avh23在疫霉基因组中同源基因的鉴定 | 第87-88页 |
| 2.4 Avh23的序列特征分析 | 第88页 |
| 2.5 Avh23能够抑制XEG1和Avh241引起的细胞坏死 | 第88-89页 |
| 2.6 Avh23突变体的筛选 | 第89-91页 |
| 2.7 Avh23突变体致病能力下降 | 第91页 |
| 3 讨论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-97页 |
| 第二章 Avh23抑制植物免疫反应的分子靶标鉴定 | 第97-139页 |
| 1 材料与方法 | 第101-108页 |
| 1.1 供试植物、菌株和载体 | 第101页 |
| 1.2 Avh23及其突变体、ADA2和GCN5基因的克隆及载体构建 | 第101页 |
| 1.3 农杆菌感受态细胞的制备和转化方法 | 第101页 |
| 1.4 农杆菌介导的烟草瞬时表达 | 第101页 |
| 1.5 植物蛋白提取及烟草中Co-IP实验 | 第101-102页 |
| 1.6 原核蛋白表达与GST Pull-down实验 | 第102-103页 |
| 1.7 酵母菌株、载体、所用培养基、酵母转化和酵母文库筛选 | 第103页 |
| 1.8 Western blot所用试剂及操作步骤 | 第103页 |
| 1.9 大豆毛状根转化和大豆疫霉接种 | 第103-105页 |
| 1.9.1 Day-6种豆子 | 第103-104页 |
| 1.9.2 Day-2摇菌 | 第104页 |
| 1.9.3 材料 | 第104页 |
| 1.9.4 Day-0转化步骤 | 第104-105页 |
| 1.9.5 毛状根生长 | 第105页 |
| 1.9.6 大豆疫霉接种 | 第105页 |
| 1.10 辣椒疫霉侵染烟草 | 第105页 |
| 1.11 病毒介导的烟草基因沉默 | 第105-106页 |
| 1.12 qRT-PCR分析 | 第106-107页 |
| 1.12.1 总RNA的提取及反转录 | 第106页 |
| 1.12.2 Real-Time PCR | 第106-107页 |
| 1.13 组蛋白乙酰化活性测定及Avh23对其活性的影响 | 第107-108页 |
| 1.13.1 乙酰化活性测定 | 第107页 |
| 1.13.2 Avh23影响ADA2-GCN5亚复合体的活性测定 | 第107-108页 |
| 1.14 Avh23影响ADA2-GCN5亚复合体的形成 | 第108页 |
| 1.15 酵母双杂交实验 | 第108页 |
| 2 结果与分析 | 第108-128页 |
| 2.1 Avh23促进病原菌的侵染 | 第108-111页 |
| 2.2 Avh23自激活及对酵母毒性的验证 | 第111页 |
| 2.3 酵母双杂交鉴定Avh23在大豆中的互作蛋白 | 第111-112页 |
| 2.4 Avh23与植物中的ADA2蛋白互作 | 第112-115页 |
| 2.4.1 Avh23与大豆中的ADA2蛋白互作 | 第112-113页 |
| 2.4.2 Avh23与烟草中的ADA2蛋白互作 | 第113-115页 |
| 2.5 Avh23与ADA2互作关键区域的鉴定 | 第115-116页 |
| 2.6 Avh23的C端FVxR突变体丧失毒性功能 | 第116-118页 |
| 2.7 Avh23改变ADA2蛋白的亚细胞定位 | 第118-119页 |
| 2.8 植物中的ADA2和GCN5蛋白能够互作 | 第119-122页 |
| 2.9 Avh23影响ADA2-GCN5亚复合体的形成 | 第122-124页 |
| 2.10 Avh23抑制ADA2-GCN5介导的核小体组蛋白乙酰化活性 | 第124-127页 |
| 2.11 ADA2和GCN5正调控植物对疫霉菌的抗性 | 第127-128页 |
| 3 结果讨论 | 第128-132页 |
| 参考文献 | 第132-139页 |
| 第三章 Avh23调控GCN5介导的植物免疫反应机制研究 | 第139-157页 |
| 1 材料与方法 | 第142-145页 |
| 1.1 实验样品的准备 | 第142页 |
| 1.1.1 基本材料: | 第142页 |
| 1.1.2 RNA样品准备: | 第142页 |
| 1.2 RNA提取 | 第142-143页 |
| 1.3 测序方法 | 第143-144页 |
| 1.4 差异表达基因分析 | 第144页 |
| 1.5 qRT-PCR验证RNA-seq数据 | 第144页 |
| 1.6 染色质免疫共沉淀(ChIP)所需试剂 | 第144页 |
| 1.7 ChIP-qPCR验证防卫基因启动子的乙酰化水平 | 第144-145页 |
| 2 结果与分析 | 第145-150页 |
| 2.1 转录组样品RNA提取 | 第145-146页 |
| 2.2 转录组测序分析差异表达基因 | 第146页 |
| 2.3 35S-Avh23和GmGCN5-RNAi转录组样品相关性分析 | 第146-148页 |
| 2.4 qRT-PCR和ChIP-qPCR分析防卫反应基因的表达模式 | 第148-149页 |
| 2.5 防卫基因在大豆疫霉Avh23突变体中的表达模式 | 第149-150页 |
| 3 讨论 | 第150-153页 |
| 参考文献 | 第153-157页 |
| 附录 | 第157-163页 |
| 附表一 引物列表 | 第157-162页 |
| 附表二 35S-Avh23样品中差异表达基因 | 第162页 |
| 附表三 GmGCN5-RNAi样品中差异表达基因 | 第162页 |
| 附表四 35S-Avh23和GmGCN5-RNAi样品中重复基因数量 | 第162-163页 |
| 全文总结及创新点 | 第163-165页 |
| 攻读博士学位期间发表的研究论文 | 第165-167页 |
| 致谢 | 第167页 |
