| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第15-18页 |
| 1.2.1 使用先验知识的方法 | 第15-17页 |
| 1.2.2 不使用先验知识的方法 | 第17-18页 |
| 1.3 本文工作及结构安排 | 第18-20页 |
| 第二章 相关理论与方法 | 第20-32页 |
| 2.1 lncRNA概述 | 第20-24页 |
| 2.1.1 lncRNA基本特征 | 第20-22页 |
| 2.1.2 lncRNA的功能及其与疾病的关系 | 第22-24页 |
| 2.2 元图与元路径 | 第24-25页 |
| 2.3 SVM简介 | 第25-30页 |
| 2.3.1 SVM算法原理 | 第25-28页 |
| 2.3.2 SVM最优参数选择方法与常用工具 | 第28-30页 |
| 2.4 方法评价指标 | 第30-31页 |
| 2.5 本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 lncRNA-疾病关联预测方法 | 第32-46页 |
| 3.1 方法设计 | 第32-35页 |
| 3.2 数据预处理方法 | 第35-40页 |
| 3.2.1 lncRNA-疾病数据来源及预处理 | 第35-37页 |
| 3.2.2 lncRNA-miRNA数据来源及预处理 | 第37页 |
| 3.2.3 lncRNA-mRNA与lncRNA-lncRNA数据来源及预处理 | 第37-39页 |
| 3.2.4 miRNA-mRNA数据来源及预处理 | 第39页 |
| 3.2.5 mRNA-mRNA数据来源及预处理 | 第39-40页 |
| 3.2.6 mRNA-疾病数据来源及预处理 | 第40页 |
| 3.2.7 疾病-疾病数据来源及预处理 | 第40页 |
| 3.3 异质网络构建及元路径的选择 | 第40-44页 |
| 3.3.1 异质网络的构建及其对应的元图 | 第40-42页 |
| 3.3.2 元路径及其对应语义 | 第42-44页 |
| 3.4 对候选关联对进行分类 | 第44-45页 |
| 3.4.1 基于元路径的特征提取 | 第44页 |
| 3.4.2 分类方法选择及训练集构建 | 第44-45页 |
| 3.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第46-56页 |
| 4.1 最优参数选择 | 第46-47页 |
| 4.2 与其他方法的比较 | 第47-49页 |
| 4.3 14个特征的重要性评估结果 | 第49-51页 |
| 4.4 案例分析 | 第51-54页 |
| 4.4.1 与肝癌相关的lncRNA-疾病关联对分析 | 第51-52页 |
| 4.4.2 与胃癌相关的lncRNA-疾病关联对分析 | 第52-53页 |
| 4.4.3 与结肠癌相关的lncRNA-疾病关联对分析 | 第53-54页 |
| 4.5 本章小结 | 第54-56页 |
| 第五章 总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 总结 | 第56页 |
| 5.2 展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 作者简介 | 第68-69页 |
