| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第14-22页 |
| 1.1 球根植物休眠调控的机制研究 | 第14-17页 |
| 1.1.1 温度对高等植物休眠的影响 | 第14-15页 |
| 1.1.2 激素对球根植物休眠的影响 | 第15-16页 |
| 1.1.3 碳水化合物和自由水含量与植物休眠的关系 | 第16页 |
| 1.1.4 保护酶和内源物质对球根植物休眠解除的影响 | 第16-17页 |
| 1.2 高等植物低温打破休眠诱导成花的研究 | 第17-19页 |
| 1.3 差异表达基因筛选技术—表达谱和miRNA测序技术 | 第19-21页 |
| 1.3.1 表达谱测序RNA-Seq技术 | 第19页 |
| 1.3.2 植物miRNA参与基因表达调控作用 | 第19-21页 |
| 1.4 研究的目的与意义 | 第21页 |
| 1.5 技术路线 | 第21-22页 |
| 2 细叶百合低温解除休眠过程中鳞茎结构变化 | 第22-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第22-23页 |
| 2.1.1 试验材料与种植条件 | 第22页 |
| 2.1.2 试验方法与设计 | 第22-23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-27页 |
| 2.2.1 细叶百合鳞茎休眠过程中顶芽生长点细胞超微结构变化 | 第23-26页 |
| 2.2.2 细叶百合鳞茎休眠过程中鳞茎顶芽结构特征观察 | 第26-27页 |
| 2.3 讨论 | 第27-29页 |
| 2.3.1 鳞茎休眠解除过程顶芽生长点细胞超微结构的变化 | 第27-28页 |
| 2.3.2 鳞茎休眠解除过程中顶芽外部形态结构的变化 | 第28-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 3 细叶百合鳞茎低温储藏期间转录组测序分析 | 第30-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第30-35页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第30页 |
| 3.1.2 鳞茎总RNA的提取与检测 | 第30-31页 |
| 3.1.3 cDNA文库的构建及测序 | 第31-32页 |
| 3.1.4 数据预处理和序列拼接 | 第32-33页 |
| 3.1.5 基因功能分类 | 第33页 |
| 3.1.6 候选基因的qRT-PCR表达分析 | 第33-35页 |
| 3.2 结果与分析 | 第35-62页 |
| 3.2.1 细叶百合鳞茎总RNA质量检测 | 第35页 |
| 3.2.2 测序数据 | 第35-37页 |
| 3.2.3 Unigenes表达量估算与重复相关性评估 | 第37-39页 |
| 3.2.4 基因表达量聚类热图分析 | 第39-40页 |
| 3.2.5 差异基因表达分析 | 第40-43页 |
| 3.2.6 差异基因GO功能富集分析 | 第43-49页 |
| 3.2.7 差异基因KEGG富集分析 | 第49-52页 |
| 3.2.8 休眠解除过程淀粉和蔗糖代谢相关基因 | 第52-53页 |
| 3.2.9 休眠解除过程能量代谢途径相关基因 | 第53-58页 |
| 3.2.10 休眠解除过程激素信号转导途径相关基因 | 第58页 |
| 3.2.11 休眠解除过程抗氧化反应相关基因 | 第58页 |
| 3.2.12 休眠解除过程DNA甲基化相关基因 | 第58-59页 |
| 3.2.13 休眠解除过程细胞分裂和生长相关基因 | 第59页 |
| 3.2.14 差异基因的qRT-PCR表达验证 | 第59-60页 |
| 3.2.15 休眠解除过程转录因子分析 | 第60-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-67页 |
| 3.3.1 参与休眠调控的代谢途径 | 第62-64页 |
| 3.3.2 参与休眠调控的细胞水平活动 | 第64-65页 |
| 3.3.3 参与休眠调控的转录因子分析 | 第65-66页 |
| 3.3.4 细叶百合鳞茎低温储藏过程中休眠解除的机制 | 第66-67页 |
| 3.4 本章小结 | 第67-68页 |
| 4 细叶百合鳞茎低温储藏期间miRNA测序分析 | 第68-88页 |
| 4.1 材料与方法 | 第68-71页 |
| 4.1.1 试验材料及处理 | 第68页 |
| 4.1.2 miRNA文库构建及测序 | 第68-69页 |
| 4.1.3 miRNA的差异表达分析 | 第69页 |
| 4.1.4 miRNA靶基因的鉴定 | 第69-70页 |
| 4.1.5 miRNA与靶基因的荧光定量验证 | 第70-71页 |
| 4.2 结果与分析 | 第71-82页 |
| 4.2.1 低温贮藏不同时期鳞茎miRNA深度测序 | 第71-72页 |
| 4.2.2 保守miRNA识别 | 第72-74页 |
| 4.2.3 识别新预测miRNA | 第74-76页 |
| 4.2.4 miRNA在鳞茎休眠解除中的作用 | 第76-78页 |
| 4.2.5 差异表达的miRNA | 第78-79页 |
| 4.2.6 差异表达miRNA靶基因预测及其功能注释 | 第79-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-86页 |
| 4.3.1 休眠解除过程鳞茎miRNA深度测序 | 第82-83页 |
| 4.3.2 休眠解除过程鳞茎miRNA动态表达模式 | 第83-84页 |
| 4.3.3 休眠解除过程鳞茎miRNA和靶基因的表达模式 | 第84-85页 |
| 4.3.4 休眠解除过程鳞茎miRNA复杂的调控机制 | 第85-86页 |
| 4.4 本章小结 | 第86-88页 |
| 5 讨论 | 第88-90页 |
| 结论 | 第90-92页 |
| 参考文献 | 第92-108页 |
| 附录 | 第108-114页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第114-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 个人简历 | 第117-119页 |
| 附件 | 第119-120页 |
