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鲤头型性状的全基因组遗传解析及生长性状的SNP挖掘

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
缩略语中英文对照第11-14页
第一章 前言第14-18页
    1.1 鲤第14页
    1.2 基因分型的发展第14-16页
    1.3 水产生物重要性状的遗传解析第16-18页
第二章 鲤头型性状的全基因组遗传定位及解析第18-42页
    2.1 材料与方法第18-22页
        2.1.1 家系构建及性状测量第18页
        2.1.2 基因分型及质控第18-19页
        2.1.3 全基因组关联分析第19-22页
        2.1.4 QTL定位第22页
        2.1.5 候选基因挖掘第22页
    2.2 结果与讨论第22-40页
        2.2.1 表型性状测量及统计分析第22-24页
        2.2.2 GWAS和QTL定位第24-32页
        2.2.3 候选基因挖掘第32-40页
    2.3 结论第40-42页
第三章 基于扩增子重测序的鲤生长相关基因的SNP挖掘第42-56页
    3.1 前言第42-44页
    3.2 材料与方法第44-50页
        3.2.1 样本采集及表型测量第44-45页
        3.2.2 DNA提取及PCR扩增第45-46页
        3.2.3 文库构建、模板制备及测序第46-48页
        3.2.4 数据质控及SNP挖掘第48-50页
    3.3 结果与讨论第50-53页
        3.3.1 SNP挖掘第50-51页
        3.3.2 SNP验证第51页
        3.3.3 黄河鲤分子选育家系构建第51-53页
    3.4 结论第53-56页
第四章 鲤bmp基因家族的研究第56-75页
    4.1 前言第56-57页
    4.2 材料与方法第57-59页
        4.2.1 Bmp基因鉴定及序列调取第57-58页
        4.2.2 系统发育分析第58页
        4.2.3 基因命名第58页
        4.2.4 共线性分析第58-59页
        4.2.5 基因表达谱第59页
    4.3 结果与讨论第59-73页
        4.3.1 基因鉴定第59-65页
        4.3.2 鲤bmp基因家族系统发育分析及命名第65-68页
        4.3.3 基因表达及功能分析第68-70页
        4.3.4 BMP基因的复制和保留第70-73页
    4.4 结论第73-75页
第五章 总结与展望第75-77页
参考文献第77-87页
附录第87-93页
致谢第93-94页
攻读学位期间学术业绩第94-96页

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