摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 前言 | 第8-13页 |
1.1 鱼蛉亚科概述 | 第8-9页 |
1.2 鱼蛉亚科系统发育与生物地理学研究进展 | 第9-12页 |
1.2.1 鱼岭亚科的单系性及系统发育研究 | 第9-11页 |
1.2.2 鱼蛉亚科生物地理学研究 | 第11页 |
1.2.3 鱼蛉亚科线粒体基因组研究进展 | 第11-12页 |
1.3 研究意义 | 第12-13页 |
第二章 实验材料与方法 | 第13-23页 |
2.1 实验材料 | 第13-16页 |
2.1.1 标本采集、保存与鉴定 | 第13-14页 |
2.1.2 主要实验仪器和试剂 | 第14-16页 |
2.2 实验方法 | 第16-20页 |
2.2.1 基因组DNA的提取 | 第16页 |
2.2.2 引物的设计与合成 | 第16-19页 |
2.2.3 PCR扩增与测序 | 第19-20页 |
2.3 数据处理和分析 | 第20-23页 |
2.3.1 测序数据的处理与拼接 | 第20页 |
2.3.2 线粒体基因组的基因定位与注释 | 第20页 |
2.3.3 系统发育分析 | 第20-21页 |
2.3.4 分子物种界定 | 第21页 |
2.3.5 分歧时间估算 | 第21-22页 |
2.3.6 祖先分布区重建 | 第22-23页 |
第三章 鱼蛉亚科线粒体基因组研究 | 第23-52页 |
3.1 鱼蛉亚科线粒体基因组分析 | 第23-47页 |
3.1.1 古鱼蛉Archichauliodes deceptor(F187)线粒体基因组分析 | 第23-31页 |
3.1.2 南方斑鱼蛉Neochauliodes meridionalis (YF018)线粒体基因组分析 | 第31-38页 |
3.1.3 日本准鱼蛉Parachauliodes japonicus (925)线粒体基因组分析 | 第38-41页 |
3.1.4 原鱼蛉Protochauliodes biconicus (H306)线粒体基因组分析 | 第41-44页 |
3.1.5 华鱼蛉Sinochauliodes sp. (YF040)线粒体基因组分析 | 第44-47页 |
3.2 鱼蛉亚科线粒体基因组rRNA的比较分析 | 第47-48页 |
3.3 鱼蛉亚科的系统发育和分歧时间估算 | 第48-52页 |
3.3.1 样品与数据 | 第48-49页 |
3.3.2 系统发育分析 | 第49页 |
3.3.3 分歧时间估算与生物地理学研究 | 第49-52页 |
第四章 斑鱼蛉属的系统发育及生物地理学研究 | 第52-67页 |
4.1 样品与数据 | 第52-56页 |
4.2 分子遗传距离分析 | 第56-60页 |
4.3 系统发育分析 | 第60-62页 |
4.4 分歧时间估算与生物地理学研究 | 第62-67页 |
第五章 准鱼蛉属和华鱼蛉属的系统发育及生物地理学研究 | 第67-82页 |
5.1 样品与数据 | 第67-70页 |
5.2 分子物种界定 | 第70-74页 |
5.3 系统发育分析 | 第74-76页 |
5.4 分歧时间估算 | 第76页 |
5.5 祖先分布区重建 | 第76页 |
5.6 讨论 | 第76-82页 |
第六章 总结与展望 | 第82-83页 |
6.1 总结 | 第82页 |
6.2 展望 | 第82-83页 |
参考文献 | 第83-87页 |
致谢 | 第87-88页 |
附录 鱼蛉亚科线粒体基因组分析 | 第88-168页 |
个人简历 | 第168页 |