基于高通量DNA测序的鄱阳湖微生物生态研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 第一章 前言 | 第8-25页 |
| 1.1 测序技术发展历程 | 第8-17页 |
| 1.1.1 第一代测序技术 | 第8-9页 |
| 1.1.2 第二代测序技术 | 第9-14页 |
| 1.1.3 第三代测序技术 | 第14-15页 |
| 1.1.4 DNA第二代测序技术的应用 | 第15-16页 |
| 1.1.5 常用的生物信息学分析软件 | 第16-17页 |
| 1.2 微生物多样性研究方法 | 第17-23页 |
| 1.2.1 基于生化技术研究微生物多样性的方法 | 第17-18页 |
| 1.2.2 基于分子生物学研究微生物多样性的方法 | 第18-20页 |
| 1.2.3 基于PCR技术的方法 | 第20-23页 |
| 1.3 鄱阳湖概况 | 第23-24页 |
| 1.4 鄱阳湖微生物生态研究情况 | 第24-25页 |
| 第二章 材料与方法 | 第25-29页 |
| 2.1 样品采集地点 | 第25页 |
| 2.2 样品采集 | 第25-26页 |
| 2.3 水样预处理 | 第26页 |
| 2.4 基因组DNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.5 测序 | 第27-28页 |
| 2.5.1 PCR扩增 | 第27-28页 |
| 2.5.2 PCR产物的混样和纯化 | 第28页 |
| 2.5.3 文库构建和上机测序 | 第28页 |
| 2.6 信息分析流程 | 第28页 |
| 2.7 实验中主要仪器、试剂信息 | 第28-29页 |
| 第三章 结果与分析 | 第29-44页 |
| 3.1 RAW Data预处理统计及质控统计 | 第29-32页 |
| 3.2 OTU分析及物种注释 | 第32-40页 |
| 3.2.1 OTU分析 | 第32-36页 |
| 3.2.2 物种注释 | 第36-40页 |
| 3.3 微生物群落丰度和分布 | 第40-44页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第44-47页 |
| 第五章 结论与展望 | 第47-50页 |
| 5.1 结论 | 第47-48页 |
| 5.2 展望 | 第48-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录A | 第57-58页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第58页 |
