| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 东乡野生稻耐冷相关研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 东乡野生稻的耐寒性的分子生物学研究 | 第11-12页 |
| 1.1.2 东乡野生稻耐冷生理的研究 | 第12-13页 |
| 1.2 植物micro RNA概述 | 第13-17页 |
| 1.3 水稻逆境相关micro RNA的研究概况 | 第17-18页 |
| 1.4 本研究的创新点 | 第18-19页 |
| 1.5 研究内容及技术路线 | 第19-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-26页 |
| 2.1 small RNA文库的构建与测序 | 第21页 |
| 2.2 东乡野生稻冷相关micro RNA靶基因的预测及筛选 | 第21-22页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第22页 |
| 2.3 冷胁迫处理后micro RNA表达变化的real time q PCR实验验证 | 第22-26页 |
| 2.3.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.3.1.1 植物材料 | 第22页 |
| 2.3.1.2 实验试剂 | 第22页 |
| 2.3.2 实验方法 | 第22-26页 |
| 第三章 结果与分析 | 第26-84页 |
| 3.1 测序结果 | 第26-28页 |
| 3.2 将数据转为fasta格式 | 第28-31页 |
| 3.3 micro RNA靶标预测 | 第31-43页 |
| 3.3.1 利用在线软件ps RNAtarget预测靶标基因 | 第31-32页 |
| 3.3.2 利用软件Targetfinder预测micro RNA靶标 | 第32-34页 |
| 3.3.3 获取两种软件靶标预测的交集 | 第34-43页 |
| 3.4 筛选耐冷相关的靶基因及对应的micro RNA | 第43-76页 |
| 3.4.1 根据基因注释筛选出与冷胁迫相关靶基因 | 第43-56页 |
| 3.4.2 利用GO及KEGG注释分析结果筛选冷胁迫相关靶基因及micro RNA | 第56-76页 |
| 3.5 东乡野生稻冷胁迫相关micro RNA预测结果的real-time q PCR验证 | 第76-82页 |
| 3.5.1 高通量测序结果的real-time q PCR验证 | 第76页 |
| 3.5.2 c DNA模板的制备 | 第76-78页 |
| 3.5.2.1 总RNA的提取 | 第76-77页 |
| 3.5.2.2 mi RNA 的反转录 | 第77-78页 |
| 3.5.3 mi RNA real-time q PCR反应 | 第78-82页 |
| 3.6 讨论 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第93页 |
