| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 丹七类方研究现状 | 第11-13页 |
| 1.1.1 中药类方研究概述 | 第11页 |
| 1.1.2 丹七类方概述 | 第11-12页 |
| 1.1.3 丹七类方抗心脑血管疾病作用机制研究 | 第12-13页 |
| 1.2 蛋白互作网络在医药研究中的应用 | 第13-16页 |
| 1.2.1 蛋白互作网络概述 | 第13页 |
| 1.2.2 蛋白质相互作用数据库 | 第13-15页 |
| 1.2.3 蛋白互作网络在医药研究中的应用 | 第15-16页 |
| 1.2.4 小结 | 第16页 |
| 1.3 模块分析及应用 | 第16-20页 |
| 1.3.1 复杂网络的模块性 | 第16-17页 |
| 1.3.2 模块识别算法 | 第17-19页 |
| 1.3.3 模块识别算法的评价 | 第19页 |
| 1.3.4 模块分析在PIN中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.5 小结 | 第20页 |
| 1.4 本文的研究目的与意义 | 第20-21页 |
| 第二章 基于蛋白互作网络模块分析的方法研究 | 第21-30页 |
| 2.1 蛋白互作网络构建及模块分析流程 | 第21-22页 |
| 2.1.1 成分靶点挖掘 | 第21-22页 |
| 2.1.2 靶点蛋白互作信息挖掘 | 第22页 |
| 2.1.3 蛋白质相互作用网络的构建 | 第22页 |
| 2.1.4 网络模块分析及GO注释 | 第22页 |
| 2.2 蛋白互作网络大小的考察 | 第22-26页 |
| 2.2.1 丹酚酸A靶点挖掘 | 第23页 |
| 2.2.2 丹酚酸A和丹酚酸B蛋白互作网络的准备 | 第23-24页 |
| 2.2.3 网络大小对模块识别的影响 | 第24-26页 |
| 2.3 蛋白互作网络稳定性考察 | 第26-27页 |
| 2.3.1 数据准备 | 第26页 |
| 2.3.2 网络稳定性考察 | 第26-27页 |
| 2.4 模块识别算法的选择 | 第27-29页 |
| 2.4.1 模块识别算法及关键参数的考察 | 第27-28页 |
| 2.4.2 功能一致性评价 | 第28页 |
| 2.4.3 模块分析方法F值评价 | 第28-29页 |
| 2.5 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 丹七类方主要有效成分PIN及分子作用机制研究 | 第30-47页 |
| 3.1 丹七类方主要有效成分的选择 | 第30-31页 |
| 3.2 主要有效成分蛋白互作网络的构建与分析 | 第31-47页 |
| 3.2.1 丹酚酸B蛋白互作网络的构建与模块分析 | 第31-32页 |
| 3.2.2 其他成分蛋白互作网络的构建与模块分析 | 第32-47页 |
| 第四章 丹参中各组分蛋白互作网络的构建及分子作用机制研究 | 第47-53页 |
| 4.1 丹酚酸类成分蛋白互作网络的构建及模块分析 | 第47-48页 |
| 4.2 丹参酮类成分蛋白互作网络的构建及模块分析 | 第48-50页 |
| 4.3 丹参其他水溶性成份蛋白互作网络的构建及模块分析 | 第50-51页 |
| 4.4 丹参三类组分分子作用机制对比研究 | 第51-52页 |
| 4.5 本章小结 | 第52-53页 |
| 第五章 丹七类方单味药蛋白互作网络的构建及分子作用机制研究 | 第53-65页 |
| 5.1 丹参蛋白互作网络的构建及模块分析 | 第53-55页 |
| 5.1.1 丹参PIN的构建 | 第53页 |
| 5.1.2 丹参PIN模块分析 | 第53-54页 |
| 5.1.3 丹参多成分协同作用机制研究 | 第54-55页 |
| 5.2 三七、降香、黄芪蛋白互作网络构建及模块分析 | 第55-63页 |
| 5.2.1 三七作用机制分析 | 第55-57页 |
| 5.2.2 降香作用机制分析 | 第57-60页 |
| 5.2.3 黄芪作用机制分析 | 第60-62页 |
| 5.2.4 冰片PIN的构建及模块分析 | 第62-63页 |
| 5.3 丹参、三七、降香、黄芪、冰片作用机制对比分析 | 第63-64页 |
| 5.4 本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章 丹七类方蛋白互作网络的构建及分子作用机制研究 | 第65-77页 |
| 6.1 丹七药对蛋白互作网络的构建及模块分析 | 第65-68页 |
| 6.1.1 丹七药对蛋白互作网络的构建 | 第65页 |
| 6.1.2 丹七药对PIN模块分析 | 第65-67页 |
| 6.1.3 丹七药对协同作用机制分析 | 第67-68页 |
| 6.2 复方丹参蛋白互作网络及模块分析 | 第68-69页 |
| 6.2.1 复方丹参蛋白互作网络的构建 | 第68页 |
| 6.2.2 复方丹参方PIN模块分析 | 第68-69页 |
| 6.3 冠心丹参方蛋白互作网络及模块分析 | 第69-72页 |
| 6.3.1 冠心丹参蛋白互作网络的构建 | 第69-70页 |
| 6.3.2 冠心丹参方PIN模块识别分析 | 第70-71页 |
| 6.3.3 冠心丹参方协同作用机制分析 | 第71-72页 |
| 6.4 芪参益气方蛋白互作网络及模块分析 | 第72-75页 |
| 6.4.1 芪参益气方蛋白互作网络的构建 | 第72-73页 |
| 6.4.2 芪参益气方PIN模块分析 | 第73-74页 |
| 6.4.3 芪参益气方协同作用机制分析 | 第74-75页 |
| 6.5 复方丹参方、冠心丹参方、芪参益气方作用机制对比研究 | 第75-76页 |
| 6.6 本章小结 | 第76-77页 |
| 第七章 基于功能模块的中药协同作用、继承性、涌现性机制分析及验证 | 第77-82页 |
| 7.1 基于功能模块的中药协同作用分析 | 第77-79页 |
| 7.2 基于功能模块的中药作用继承性及涌现性分析 | 第79-80页 |
| 7.3 模块分析结果文献验证 | 第80页 |
| 7.4 模块分析结果实验验证 | 第80-81页 |
| 7.5 本章小结 | 第81-82页 |
| 第八章 总结与讨论 | 第82-84页 |
| 8.1 蛋白互作网络模块分析方法方法学考察 | 第82页 |
| 8.2 丹七类方四个层次的作用机制解析 | 第82-83页 |
| 8.3 展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 个人简历 | 第90-91页 |
| 附表 | 第91-127页 |
