| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一部分 深海环境中乙醛降解菌及醛脱氢酶基因的多样性研究 | 第14-73页 |
| 1 前言 | 第14-30页 |
| 1.1 深海环境及其微生物研究进展 | 第14-18页 |
| 1.1.1 深海环境简介 | 第14-15页 |
| 1.1.2 深海微生物研究进展 | 第15-18页 |
| 1.2 乙醛的微生物降解及其研究进展 | 第18-21页 |
| 1.2.1 乙醛及其危害 | 第18-19页 |
| 1.2.2 醛与酒精代谢 | 第19-20页 |
| 1.2.3 乙醛微生物降解的研究现状与意义 | 第20-21页 |
| 1.3 醛脱氢酶(ALDH)的研究进展 | 第21-25页 |
| 1.3.1 ALDH简介 | 第21页 |
| 1.3.2 ALDH的来源与分类 | 第21-23页 |
| 1.3.3 ALDH的结构 | 第23-24页 |
| 1.3.4 ALDH的催化机理 | 第24页 |
| 1.3.5 ALDH的重要生理功能 | 第24页 |
| 1.3.6 ALDH的研究应用方向 | 第24-25页 |
| 1.4 微生物生态学研究方法 | 第25-28页 |
| 1.4.1 微生物新型培养方法 | 第25-26页 |
| 1.4.2 以PCR为基础的微生物分子生态学研究方法 | 第26-27页 |
| 1.4.3 以PCR为基础的微生物分子生态学方法的缺点 | 第27-28页 |
| 1.5 本研究技术路线、目的及意义 | 第28-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-46页 |
| 2.1 实验材料 | 第30-35页 |
| 2.2 基本方法 | 第35-46页 |
| 2.2.1 南海水体实验室、原位两种富集方式下未培养乙醛降解菌多样性比较 | 第35-39页 |
| 2.2.2 东太平洋深海沉积物中醛脱氢酶基因多样性分析 | 第39-43页 |
| 2.2.3 南海水体及东太平洋深海沉积物中可培养乙醛降解菌初步研究 | 第43-46页 |
| 3 结果与分析 | 第46-68页 |
| 3.1 南海水体两种富集方式下未培养乙醛降解菌多样性比较 | 第46-55页 |
| 3.1.1 宏基因组DNA的提取及16S rRNA基因的PCR扩增 | 第46-47页 |
| 3.1.2 16S rRNA基因克隆文库的构建及阳性克隆验证 | 第47页 |
| 3.1.3 16S rRNA基因测序结果处理及文库多样性指数分析 | 第47-49页 |
| 3.1.4 16S rRNA基因系统发育分析 | 第49-55页 |
| 3.2 东太平洋深海沉积物中醛脱氢酶基因多样性分析 | 第55-63页 |
| 3.2.1 醛脱氢酶简并引物的设计 | 第55-56页 |
| 3.2.2 宏基因组DNA的提取及醛脱氢酶基因片段的扩增 | 第56-57页 |
| 3.2.3 醛脱氢酶基因片段克隆文库构建及阳性克隆验证 | 第57-58页 |
| 3.2.4 醛脱氢酶基因片段克隆文库的RFLP分析 | 第58页 |
| 3.2.5 醛脱氢酶基因片段序列分析 | 第58-60页 |
| 3.2.6 东太平洋深海沉积物中醛脱氢酶系统发育分析 | 第60-63页 |
| 3.3 南海水体及东太平洋深海沉积物中可培养乙醛降解菌初步分析 | 第63-68页 |
| 3.3.1 可培养乙醛耐受菌的分离及初步鉴定 | 第63-65页 |
| 3.3.2 可培养乙醛耐受菌乙醛耐受度分析 | 第65页 |
| 3.3.3 可培养乙醛降解菌的乙醛降解率测定 | 第65-68页 |
| 4 讨论与展望 | 第68-73页 |
| 4.1 南海深海水体原位亩集及非原位亩集的结果比较 | 第68页 |
| 4.2 东太平洋深海沉积物中醛脱氢酶基因多样性检测结果及讨论 | 第68-69页 |
| 4.3 关于本研究中检測到的各细苗门类的分析 | 第69-71页 |
| 4.4 对分离培养的乙醛降解苗的讨论 | 第71页 |
| 4.5 展望 | 第71-73页 |
| 第二部分 Flammeovirga sp.Wpaga001中α-淀粉酶基因的异源表达及酶学性质分析 | 第73-95页 |
| 1 前言 | 第73-77页 |
| 1.1 淀粉酶简介 | 第73页 |
| 1.2 α-淀粉酶概述 | 第73-74页 |
| 1.3 α-淀粉酶的结构及催化机制 | 第74-75页 |
| 1.4. α-淀粉酶的研究及应用 | 第75-76页 |
| 1.5 本文的研究目的及意义 | 第76-77页 |
| 2 材料及方法 | 第77-86页 |
| 2.1 实验材料 | 第77-79页 |
| 2.2 实验方法 | 第79-86页 |
| 2.2.1 α-淀粉酶amy608异源表达菌株的构建 | 第79-82页 |
| 2.2.2 α-淀粉酶amy608的诱导表达及纯化 | 第82页 |
| 2.2.3 α-淀粉酶amy608基因序列及蛋白结构分析 | 第82-83页 |
| 2.2.4 α-淀粉酶amy608酶活力的检测及酶学性质分析 | 第83-86页 |
| 3 结果及分析 | 第86-93页 |
| 3.1 阳性重组子的菌落PCR及双酶切验证结果 | 第86页 |
| 3.2 淀粉酶amy608的诱导表达及纯化 | 第86-88页 |
| 3.3 amy608基因序列及蛋白结构分析 | 第88-90页 |
| 3.4 α-淀粉酶amy608的酶学性质分析 | 第90-93页 |
| 4 总结与讨论 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-102页 |
| 附录：α-淀粉酶amy608的基因序列及氨基酸序列 | 第102-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
