植物抗性基因的数据组织与信息挖掘
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| 1.1 课题来源 | 第8页 |
| 1.2 研究背景及意义 | 第8-10页 |
| 1.2.1 研究背景 | 第8-9页 |
| 1.2.2 研究意义 | 第9-10页 |
| 1.3 研究现状 | 第10-14页 |
| 1.3.1 抗性基因的对抗机制 | 第10-11页 |
| 1.3.2 抗性基因的分类 | 第11-12页 |
| 1.3.3 抗性基因的识别方法 | 第12-14页 |
| 1.4 本文的研究内容 | 第14-15页 |
| 1.5 本文组织结构 | 第15-17页 |
| 第2章 植物抗性基因的数据获取与组织 | 第17-31页 |
| 2.1 数据的来源 | 第17-20页 |
| 2.1.1 基因相关的数据库 | 第17-18页 |
| 2.1.2 蛋白质相互作用相关的数据库 | 第18-20页 |
| 2.1.3 本文所需数据及来源 | 第20页 |
| 2.2 正例的获取 | 第20-24页 |
| 2.2.1 已知抗性基因数据 | 第20-22页 |
| 2.2.2 正例的扩展方法 | 第22-24页 |
| 2.3 反例的获取 | 第24-27页 |
| 2.4 实验结果及分析 | 第27-28页 |
| 2.5 数据的组织 | 第28-30页 |
| 2.5.1 数据内容 | 第28-29页 |
| 2.5.2 数据库选择及存储结构 | 第29-30页 |
| 2.6 本章小结 | 第30-31页 |
| 第3章 植物抗性基因特征的提取 | 第31-41页 |
| 3.1 基因的特征提取方法 | 第31-33页 |
| 3.2 蛋白质的特征提取方法 | 第33-36页 |
| 3.2.1 基于蛋白质序列的特征提取 | 第34页 |
| 3.2.2 基于氨基酸理化特性的特征提取方法 | 第34-36页 |
| 3.3 抗性基因的特征提取 | 第36-38页 |
| 3.4 实验结果及分析 | 第38-40页 |
| 3.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 第4章 基于 SVM 的抗性基因分类器的构建 | 第41-52页 |
| 4.1 SVM 的理论背景 | 第41-44页 |
| 4.1.1 SVM 理论的统计学基础 | 第41-42页 |
| 4.1.2 支持向量机 | 第42-44页 |
| 4.2 评价标准 | 第44-45页 |
| 4.3 实验结果及分析 | 第45-50页 |
| 4.3.1 核函数的选取 | 第45-48页 |
| 4.3.2 径向基核的 SVM 参数选择 | 第48-50页 |
| 4.4 抗性基因预测 Web 系统 | 第50-51页 |
| 4.4.1 Web 系统的实现 | 第50页 |
| 4.4.2 Web 系统的页面展示 | 第50-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
