| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-34页 |
| 1.1 大丽轮枝菌型黄萎病的发生及危害 | 第15页 |
| 1.2 黄萎病的病害循环 | 第15-18页 |
| 1.2.1 大丽轮枝菌的存活结构 | 第15-16页 |
| 1.2.2 萌发和侵染 | 第16-17页 |
| 1.2.3 定殖 | 第17页 |
| 1.2.4 症状表现 | 第17-18页 |
| 1.2.5 新微菌核的形成 | 第18页 |
| 1.3 黄萎病的流行学 | 第18-24页 |
| 1.3.1 单循环病害 | 第18页 |
| 1.3.2 接种体的存活 | 第18-19页 |
| 1.3.3 土壤中大丽轮枝菌微菌核密度与病害流行的关系 | 第19-20页 |
| 1.3.4 环境因素与黄萎病的发生 | 第20-21页 |
| 1.3.5 土壤中大丽轮枝菌微菌核检测技术 | 第21-24页 |
| 1.4 微菌核的时空分布研究概况 | 第24-25页 |
| 1.4.1 大丽轮枝菌的传播 | 第24-25页 |
| 1.4.2 土壤中大丽轮枝菌微菌核的空间分布 | 第25页 |
| 1.4.3 土壤中大丽轮枝菌微菌核的动态分布 | 第25页 |
| 1.5 大丽轮枝菌型黄萎病的防治 | 第25-30页 |
| 1.5.1 选育抗病品种 | 第26页 |
| 1.5.2 化学防治 | 第26-27页 |
| 1.5.3 物理方法 | 第27-28页 |
| 1.5.4 生物方法 | 第28-30页 |
| 1.5.5 拮抗微生物 | 第30页 |
| 1.6 土传病害的防治对土壤微生物群落的影响 | 第30-31页 |
| 1.7 土壤微生物群落分析技术 | 第31-33页 |
| 1.7.1 传统方法 | 第31页 |
| 1.7.2 BIOLOG鉴定系统 | 第31页 |
| 1.7.3 脂肪酸甲酯分析 | 第31-32页 |
| 1.7.4 基于DNA分析的方法 | 第32-33页 |
| 1.8 本研究的目的意义及技术路线 | 第33-34页 |
| 1.8.1 本研究的目的意义 | 第33页 |
| 1.8.2 本研究的技术路线 | 第33-34页 |
| 第二章 微菌核的定量检测 | 第34-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第34-42页 |
| 2.1.1 试剂和仪器 | 第34-35页 |
| 2.1.2 供试菌株 | 第35页 |
| 2.1.3 供试培养基及溶液 | 第35-36页 |
| 2.1.4 供试引物 | 第36页 |
| 2.1.5 真菌DNA提取 | 第36页 |
| 2.1.6 供试土样 | 第36-37页 |
| 2.1.7 土样处理 | 第37页 |
| 2.1.8 选择性培养基平板法定量土壤中大丽轮枝菌微菌核 | 第37页 |
| 2.1.9 微菌核的离体产生 | 第37页 |
| 2.1.10 引物特异性验证 | 第37-38页 |
| 2.1.11 土壤总DNA提取 | 第38-39页 |
| 2.1.12 质粒标准品制备 | 第39-41页 |
| 2.1.13 质粒标准品的稳定性 | 第41-42页 |
| 2.1.14 土壤中微菌核密度与IGS基因拷贝数的关系 | 第42页 |
| 2.1.15 水筛+qPCR方法与常规水筛平板法的相关性 | 第42页 |
| 2.1.16 数据处理 | 第42页 |
| 2.2 结果与分析 | 第42-49页 |
| 2.2.1 引物特异性 | 第42-44页 |
| 2.2.2 标准曲线 | 第44-47页 |
| 2.2.3 质粒标准品保存的稳定性 | 第47-48页 |
| 2.2.4 水筛+qPCR检测与传统方法定量检测结果的相关性 | 第48-49页 |
| 2.3 讨论 | 第49-51页 |
| 第三章 棉花黄萎病发生的微菌核阈值 | 第51-60页 |
| 3.1 材料与方法 | 第51-55页 |
| 3.1.1 试剂和仪器 | 第51页 |
| 3.1.2 土壤样品的采集 | 第51-52页 |
| 3.1.3 土壤样品的处理 | 第52页 |
| 3.1.4 土壤DNA提取 | 第52-53页 |
| 3.1.5 土壤中大丽轮枝菌微菌核密度评估 | 第53页 |
| 3.1.6 数据分析 | 第53-55页 |
| 3.2 结果与分析 | 第55-58页 |
| 3.2.1 土壤中大丽轮枝菌微菌核的qPCR检测 | 第55页 |
| 3.2.2 微菌核密度与病害级别的关系 | 第55-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 第四章 棉田大丽轮枝菌微菌核和病株的空间分布 | 第60-71页 |
| 4.1 材料与方法 | 第60-63页 |
| 4.1.1 试剂和仪器 | 第60页 |
| 4.1.2 土壤样品的采集 | 第60-61页 |
| 4.1.3 土壤样品的处理 | 第61-62页 |
| 4.1.4 土壤DNA提取 | 第62页 |
| 4.1.5 土壤中大丽轮枝菌微菌核密度评估 | 第62页 |
| 4.1.6 黄萎病病株的空间分布调查 | 第62页 |
| 4.1.7 数据分析 | 第62-63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-69页 |
| 4.2.1 棉花田土壤中大丽轮枝菌微菌核的空间分布 | 第63-65页 |
| 4.2.2 棉田病株空间分布 | 第65-68页 |
| 4.2.3 土壤中微菌核密度与黄萎病发生的关系 | 第68-69页 |
| 4.3 讨论 | 第69-71页 |
| 第五章 土壤熏蒸对微菌核活力及微生物群落的影响 | 第71-101页 |
| 5.1 试验材料 | 第72-73页 |
| 5.1.1 供试试剂 | 第72页 |
| 5.1.2 供试仪器 | 第72-73页 |
| 5.1.3 供试熏蒸产品 | 第73页 |
| 5.1.4 供试培养基 | 第73页 |
| 5.2 试验设计 | 第73-80页 |
| 5.2.1 生物熏蒸杀菌效果评估 | 第73-74页 |
| 5.2.2 土壤熏蒸对土壤微生物群落多样性影响试验 | 第74-80页 |
| 5.3 数据处理 | 第80-82页 |
| 5.3.1 生物熏蒸杀菌效果评估 | 第80页 |
| 5.3.2 测序结果的生物信息学分析 | 第80-81页 |
| 5.3.3 测序结果的统计分析 | 第81-82页 |
| 5.4 结果与分析 | 第82-97页 |
| 5.4.1 生物熏蒸产品对土壤中微菌核密度的影响 | 第82-85页 |
| 5.4.2 测序质量评估 | 第85-86页 |
| 5.4.3 OTU生成和注释 | 第86-89页 |
| 5.4.4 土壤熏蒸对α多样性的影响 | 第89-91页 |
| 5.4.5 土壤熏蒸对β多样性的影响 | 第91-93页 |
| 5.4.6 不同处理间单个OUT丰度的不同 | 第93-97页 |
| 5.5 讨论 | 第97-101页 |
| 第六章 结论与创新点 | 第101-102页 |
| 6.1 结论 | 第101页 |
| 6.2 创新点 | 第101-102页 |
| 参考文献 | 第102-120页 |
| 附录 | 第120-121页 |
| 英文缩略表 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
| 作者简介 | 第123-124页 |
