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多粘类芽孢杆菌KF-1抗真菌物质的纯化及其编码基因簇分析

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 绪论第13-25页
    1.1 多粘类芽孢杆菌简介第13页
    1.2 多粘类芽孢杆菌抗菌物质第13-19页
        1.2.1 蛋白类第13-14页
        1.2.2 多肽类第14-19页
            1.2.2.1 多粘菌素第15-16页
            1.2.2.2 Paenibacillin第16页
            1.2.2.3 杀镰孢菌素第16-17页
            1.2.2.3 伊枯草菌素第17页
            1.2.2.4 LI-F类脂肽第17-18页
            1.2.2.5 Surfactin第18-19页
        1.2.3 核苷类第19页
    1.3 类芽孢杆菌及其抗菌物质的应用第19-22页
        1.3.1 在农业中的应用第19-20页
        1.3.2 在医药上的应用第20-21页
        1.3.3 在工业中的应用第21页
        1.3.4 在食品、饲料添加剂上的应用第21-22页
        1.3.5 在生防上的应用第22页
    1.4 研究目的及意义第22-25页
第二章 多粘类芽孢杆菌KF-1 的分离及鉴定第25-37页
    2.1 材料第25-27页
        2.1.1 菌株第25页
        2.1.2 培养基第25-26页
        2.1.3 试剂与器材第26-27页
    2.2 方法第27-30页
        2.2.1 类芽孢杆菌KF-1 的鉴定第27-29页
            2.2.1.1 菌株KF-1 DNA的提取第27-28页
            2.2.1.2 16S rDNA的PCR扩增第28-29页
            2.2.1.3 构建系统发育进化树第29页
        2.2.2 菌株KF-1 形态学特征第29页
            2.2.2.1 菌落形态观察第29页
            2.2.2.2 菌体形态第29页
        2.2.3 菌株KF-1 生理生化特征第29-30页
            2.2.3.1 淀粉水解实验第29页
            2.2.3.2 氧化酶实验第29页
            2.2.3.3 接触酶实验第29页
            2.2.3.4 硝酸盐还原实验第29-30页
            2.2.3.5 柠檬酸盐实验第30页
            2.2.3.6 甲基红实验第30页
            2.2.3.7 明胶液化实验第30页
            2.2.3.8 伏-普试验第30页
    2.3 结果与分析第30-35页
        2.3.1 菌株KF-1 的鉴定第30-31页
        2.3.2 生理生化性质第31页
        2.3.3 KF-1 菌株的 16S rDNA测序以及系统发育树的构建第31-33页
            2.3.3.1 KF-1PCR产物扩增第31-32页
            2.3.3.2 KF-1 测序结果第32-33页
        2.3.4 BLAST同源性比较第33-35页
        2.3.5 系统发育树的构建第35页
    2.4 讨论第35-37页
第三章 多粘类芽孢杆菌KF-1 抗真菌活性物质的分离及纯化第37-51页
    3.1 材料与方法第38页
        3.1.1 菌株第38页
        3.1.2 培养基第38页
    3.2 KF-1 产抗菌物质的初步分离第38-40页
        3.2.1 KF-1 菌株的抗菌谱的检测试验第38-39页
        3.2.2 菌株KF-1 的发酵培养基的选择第39页
        3.2.3 KF-1 产抗菌物质的分离提取第39-40页
        3.2.4 抗菌粗提物的HPLC分离纯化第40页
        3.2.5 ESI-MS质谱分析第40页
    3.3 结果与分析第40-48页
        3.3.1 KF-1 菌株抗菌谱的检测结果第40-42页
        3.3.2 不同培养基下KF-1 菌株的生长情况及其抑菌活性实验第42页
        3.3.3 抗菌物质的粗提第42-43页
        3.3.4 抗菌粗提物的HPLC分离第43-45页
        3.3.5 ESI-MS第45-48页
    3.4 讨论第48-51页
第四章 多粘类芽孢杆菌KF-1 基因组测序及分析第51-63页
    4.1 材料方法第51-52页
        4.1.1 菌株第51页
        4.1.2 培养基第51-52页
    4.2 方法第52页
        4.2.1 多粘类芽孢杆菌KF-1 全基因组测序第52页
            4.2.1.1 菌株KF-1 基因组的提取第52页
            4.2.1.2 KF-1 基因组测序第52页
    4.3 结果与分析第52-63页
        4.3.1 KF-1 全基因组概况第52-53页
        4.3.2 KF-1 染色体功能注释第53-54页
        4.3.3 KF-1 基因组注释第54-57页
            4.3.3.1 蛋白编码基因的GO注释第54页
            4.2.3.2 蛋白编码基因的eggNOG注释第54-57页
        4.3.5 KF-1 基因组中次级代谢产物及其生物合成基因簇预测分析第57-60页
            4.3.5.1 NRPS途径合成的次级代谢产物第58-59页
            4.3.5.2 NRPS-PKS合成的次级代谢产物第59-60页
            4.3.5.3 Lantipeptide第60页
        4.4 讨论第60-63页
第五章 结论与展望第63-65页
    5.1 结论第63-64页
    5.2 展望第64-65页
参考文献第65-71页
攻读学位期间取得的研究成果第71-73页
致谢第73页

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