摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
引言 | 第8-10页 |
1 基础理论 | 第10-18页 |
1.1 分子力场 | 第10-13页 |
1.1.1 分子力场的概述 | 第10页 |
1.1.2 分子力场中所有作用项的一般形式 | 第10-13页 |
1.2 ABEEM-7P水分子模型 | 第13-15页 |
1.2.1 ABEEM-7P水分子模型概述 | 第13页 |
1.2.2 ABEEM-7P水分子模型能量计算 | 第13-15页 |
1.3 分子动力学模拟 | 第15-18页 |
1.3.1 分子动力学模拟原理简介 | 第15-16页 |
1.3.2 周期性边界条件 | 第16-17页 |
1.3.3 截断半径与最近镜像 | 第17-18页 |
2 ABEEM-7P模型下水分子的动力学模拟 | 第18-47页 |
2.1 分子动力学模拟细节 | 第18-20页 |
2.2 不同条件对NPT系综下水分子动力学模拟性质的影响 | 第20-43页 |
2.2.1 216个水分子的动力学性质随温度的变化 | 第20-32页 |
2.2.2 500个水分子的动力学性质随温度的变化 | 第32-43页 |
2.3 216个水分子的水盒子边长的影响 | 第43-46页 |
2.4 小结 | 第46-47页 |
3 ABEEM力场模拟得到性质和AMBER力场模拟得到性质的比较 | 第47-52页 |
3.1 216个水分子动力学性质的比较 | 第47-49页 |
3.2 500个水分子动力学性质的比较 | 第49-51页 |
3.3 小结 | 第51-52页 |
结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-56页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第56-57页 |
致谢 | 第57页 |