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小麦与小麦孢囊线虫互作早期的转录组分析

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 前言第7-14页
    1.1 小麦孢囊线虫病概述第7-10页
        1.1.1 小麦孢囊线虫病的分布和危害第7-8页
        1.1.2 小麦孢囊线虫的生活习性第8页
        1.1.3 小麦孢囊线虫的防治概况第8-10页
    1.2 吸引阶段线虫-寄主的互作研究第10页
    1.3 转录组测序在H.avenae研究中的应用第10-11页
    1.4 植物寄生线虫效应因子对寄主防御反应的影响第11-12页
        1.4.1 植物寄生线虫效应因子概述第11页
        1.4.2 植物寄生线虫效应因子对寄主防御反应的影响第11-12页
    1.5 烟草BT-PCD的抑制筛选体系在效应因子功能研究中的应用第12页
    1.6 本研究的目的与意义第12-14页
第二章 材料与方法第14-29页
    2.1 试验材料及试剂第14页
    2.2 试验方法第14-29页
        2.2.0 小麦根尖对线虫的吸引第14页
        2.2.1 植物组织内线虫染色第14-15页
        2.2.2 总RNA提取及检测第15-16页
        2.2.3 RNA文库构建、质控及上机测序第16页
        2.2.4 生物信息学分析第16-21页
        2.2.5 差异表达基因验证第21-24页
        2.2.6 线虫效应因子预测第24页
        2.2.7 BT-PCD的抑制性检测第24-29页
第三章 结果与讨论第29-57页
    3.1 小麦根对线虫的吸引第29页
    3.2 小麦根组织转录组数据第29-40页
        3.2.1 测序数据产出统计第29-30页
        3.2.2 转录组数据与参考基因组序列比对第30页
        3.2.3 小麦差异表达基因分析第30-40页
    3.3 线虫转录组数据第40-54页
        3.3.1 测序数据产出统计第40-41页
        3.3.2 转录组测序数据组装第41-42页
        3.3.3 测序数据与组装结果的比对统计第42页
        3.3.4 Havenae差异表达基因分析第42-54页
    3.4 讨论第54-57页
参考文献第57-67页
致谢第67-68页
个人简历第68-70页

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