| 缩略词对照 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-26页 |
| 1 研究背景 | 第10-23页 |
| ·蛋白质组学：大规模研究蛋白质功能的科学 | 第10-20页 |
| ·基于细胞的肝脏图谱 | 第20-22页 |
| ·应用组学技术研究肝脏细胞的现状 | 第22-23页 |
| 2 研究内容和创新点 | 第23-24页 |
| 3 论文结构 | 第24-26页 |
| 第二章 小鼠肝细胞分离纯化及纯度评价 | 第26-34页 |
| 1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2 结果 | 第30-32页 |
| ·HC、HSC、LSEC 和 KC 的特征、纯度和得率 | 第30-32页 |
| 3 讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 蛋白质组非标记定量研究策略的评估及蛋白质表达谱构建 | 第34-42页 |
| 1 材料与方法 | 第34-37页 |
| 2 结果 | 第37-39页 |
| ·APEX 非标记定量策略的可重复性和准确性评估 | 第37-39页 |
| ·标准蛋白校正效果分析 | 第39页 |
| ·小鼠肝脏细胞蛋白质鉴定概况 | 第39页 |
| 3 讨论 | 第39-42页 |
| 第四章 肝脏实质细胞蛋白质表达谱数据分析及相关验证 | 第42-72页 |
| 1 材料与方法 | 第42-45页 |
| 2 结果 | 第45-66页 |
| ·肝细胞蛋白质组数据分析 | 第45-66页 |
| ·HC 鉴定蛋白的偏性分析 | 第45-46页 |
| ·HC 蛋白质鉴定概况 | 第46-49页 |
| ·HC 蛋白质组的功能分类 | 第49-52页 |
| ·HC 蛋白质组与全肝蛋白质组的比较 | 第52页 |
| ·HC 转录组与肝脏转录组的比较 | 第52-54页 |
| ·HC 蛋白质组与转录组的比较 | 第54-55页 |
| ·HC 蛋白质组与血浆蛋白质组的比较 | 第55-56页 |
| ·HC 蛋白质组与其他细胞蛋白质组的比较 | 第56-57页 |
| ·肝脏细胞膜蛋白的比较 | 第57-59页 |
| ·转录因子在肝脏细胞中的表达 | 第59页 |
| ·小鼠肝脏细胞表型分析 | 第59-60页 |
| ·三种方法对功能不明确蛋白进行注释 | 第60-63页 |
| ·肝实质细胞特异的功能模块分析 | 第63-64页 |
| ·肝脏不同类型细胞通路表达差异分析 | 第64-65页 |
| ·侯选通路分子的验证 | 第65-66页 |
| 3 讨论 | 第66-72页 |
| ·肝脏细胞的纯度评估 | 第66页 |
| ·大规模质谱数据中低丰度蛋白的鉴定 | 第66-68页 |
| ·蛋白质分类和蛋白质丰度的关系 | 第68-69页 |
| ·HC 功能特性 | 第69页 |
| ·不同细胞类型在代谢通路间的协作关系 | 第69-72页 |
| 第五章 结论与展望 | 第72-76页 |
| 1 总结 | 第72-73页 |
| 2 展望 | 第73-76页 |
| 参考文献 | 第76-85页 |
| 附录 1 WGCNA 分析获得的小鼠肝脏基因共表达模块的特征 | 第85-87页 |
| 附录 2 在不同肝脏细胞中鉴定到的细胞特异 CD 分子 | 第87-89页 |
| 附录 3 肝脏不同细胞表达的转录因子 | 第89-92页 |
| 综述 | 第92-103页 |
| 个人简历 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
