双向聚类算法研究及其在乳腺癌亚型分析上的应用
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号对照表 | 第11-12页 |
| 缩略语对照表 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-16页 |
| 1.2 研究现状 | 第16-18页 |
| 1.3 研究内容及意义 | 第18-19页 |
| 1.4 章节安排 | 第19-21页 |
| 第二章 基于AP的ISA双向聚类算法 | 第21-31页 |
| 2.1 AP聚类 | 第21-23页 |
| 2.2 常用的双向聚类算法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 CC算法 | 第23-24页 |
| 2.2.2 Bimax算法 | 第24-25页 |
| 2.2.3 ISA算法 | 第25-27页 |
| 2.3 基于AP的ISA双向聚类算法 | 第27-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-31页 |
| 第三章 基于AP的ISA算法在乳腺癌分型上的应用 | 第31-43页 |
| 3.1 乳腺癌数据集预处理 | 第31-32页 |
| 3.2 基于AP的ISA算法在乳腺癌亚型上的应用 | 第32-42页 |
| 3.2.1 乳腺癌亚型临床结果分析 | 第33-34页 |
| 3.2.2 乳腺癌亚型基因表达模式分析 | 第34-42页 |
| 3.3 本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 乳腺癌亚型的生物意义解释 | 第43-55页 |
| 4.1 乳腺癌亚型相关基因分析 | 第43-46页 |
| 4.1.1 Basal-like亚型相关基因 | 第43-44页 |
| 4.1.2 HER2+亚型相关基因 | 第44-45页 |
| 4.1.3 Luminal亚型相关基因 | 第45-46页 |
| 4.2 pathway富集分析 | 第46-52页 |
| 4.2.1 pathway富集结果 | 第47-49页 |
| 4.2.2 pathway富集分析 | 第49-52页 |
| 4.3 乳腺癌亚型甲基化分析 | 第52-54页 |
| 4.4 本章小结 | 第54-55页 |
| 第五章 总结和展望 | 第55-57页 |
| 5.1 研究总结 | 第55页 |
| 5.2 研究展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 致谢 | 第63-65页 |
| 作者简介 | 第65-66页 |
