| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 序言 | 第11-19页 |
| 1.1 量子力学在计算化学中的发展 | 第11-12页 |
| 1.2 卤代烃 SN2 反应的研究背景 | 第12-15页 |
| 1.3 亲核取代反应简介 | 第15-19页 |
| 1.3.1 单分子亲核取代 | 第16页 |
| 1.3.2 双分子亲核取代反应 | 第16-17页 |
| 1.3.3 影响双分子亲核取代反应速率的因素 | 第17-19页 |
| 第二章 理论知识概况 | 第19-41页 |
| 2.1 混合量子力学/分子力学方法（QM/MM 方法）简介 | 第19-23页 |
| 2.1.1 使用 QM／MM 的原因 | 第20-21页 |
| 2.1.2 最简单的混合 QM/MM 模型 | 第21-22页 |
| 2.1.3 简单 QM/MM 模型的缺点 | 第22-23页 |
| 2.1.4 量子方法的选择 | 第23页 |
| 2.2 密度泛函理论 DENSITY FUNCTIONAL THEORY (DFT) | 第23-31页 |
| 2.2.1 理论模型的发展 | 第24-31页 |
| 2.2.2 DFT 方法的适用范围 | 第31页 |
| 2.3 有机反应机理 | 第31-35页 |
| 2.3.1 反应机理的研究 | 第31-32页 |
| 2.3.2 反应的能量学 | 第32-35页 |
| 2.4 耦合簇理论 | 第35-38页 |
| 2.4.1 波函数拟设 | 第35-36页 |
| 2.4.2 簇算符 | 第36-37页 |
| 2.4.3 耦合簇方程 | 第37-38页 |
| 2.4.4 耦合簇方法的种类 | 第38页 |
| 2.5 过渡态理论 | 第38-40页 |
| 2.6 NUDGED ELASTIC BAND(NEB)方法 | 第40-41页 |
| 第三章 运用量子/分子动力学研究液相中 CH_3BR + CN 的反应机制 | 第41-57页 |
| 3.1 引言 | 第41-42页 |
| 3.2 方法和体系建立 | 第42-45页 |
| 3.3 结果讨论 | 第45-55页 |
| 3.3.1 反应物 | 第45-46页 |
| 3.3.2 过渡态 | 第46-47页 |
| 3.3.3 产物 | 第47-48页 |
| 3.3.4 结构演化 | 第48-49页 |
| 3.3.5 电荷分布 | 第49-50页 |
| 3.3.6 偶极矩 | 第50-51页 |
| 3.3.7 自由能曲线 | 第51-54页 |
| 3.3.8 溶剂贡献 | 第54-55页 |
| 3.4 与液相下的 CH_3BR +OH 反应对比 | 第55-56页 |
| 3.5 结论 | 第56-57页 |
| 第四章 运用多表象 QM/MM 研究 CH_3BR + OH~- 在液相下的 SN2 反应 | 第57-71页 |
| 4.1 引言 | 第57-58页 |
| 4.2 理论方法和体系建立： | 第58-61页 |
| 4.3 结果讨论 | 第61-69页 |
| 4.3.1 反应物 | 第61-62页 |
| 4.3.2 过渡态 | 第62页 |
| 4.3.3 产物 | 第62-64页 |
| 4.3.4 结构沿 NEB 反应路径的演化 | 第64-65页 |
| 4.3.5 电荷分布沿 NEB 反应路径的演化 | 第65-66页 |
| 4.3.6 自由能曲线 | 第66-68页 |
| 4.3.7 反应速率常数 | 第68-69页 |
| 4.4 结论 | 第69-71页 |
| 第五章 双分子亲核取代反应 CH_3CL + CN~- 在水溶液中的动力学研究 | 第71-87页 |
| 5.1 引言 | 第71-73页 |
| 5.2 方法和系统建立 | 第73-76页 |
| 5.3 结果讨论 | 第76-85页 |
| 5.3.1 反应络合物的比较 | 第76-77页 |
| 5.3.2 过渡态和产物 | 第77-79页 |
| 5.3.3 双分子亲核取代机制 | 第79-80页 |
| 5.3.4 电荷分布沿反应路径的演化 | 第80-81页 |
| 5.3.5 自由能曲线的比较 | 第81-84页 |
| 5.3.6 溶剂贡献 | 第84-85页 |
| 5.4 与 CH_3BR + CN~- 反应的比较 | 第85-86页 |
| 5.5 结论 | 第86-87页 |
| 第六章 总结与展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-97页 |
| 攻读博士学位期间完成的论文 | 第97-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
