利用转录组分析研究柑橘砧穗间mRNA的移动
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-20页 |
| 1.1 课题提出 | 第10页 |
| 1.2 文献综述 | 第10-19页 |
| 1.2.1 嫁接的发展及应用 | 第11-12页 |
| 1.2.2 嫁接植物砧穗间物质交换研究 | 第12-14页 |
| 1.2.3 嫁接植物体内长距离信号传递 | 第14-15页 |
| 1.2.4 嫁接植物体内mRNA运输的研究进展 | 第15-19页 |
| 1.3 本研究的目的和主要内容 | 第19-20页 |
| 2 材料和方法 | 第20-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.1.2 数据 | 第20-21页 |
| 2.1.3 实验主要试剂和仪器 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-29页 |
| 2.2.1 嫁接口愈合观察方法 | 第21-23页 |
| 2.2.1.1 田间观察 | 第21-22页 |
| 2.2.1.2 石蜡切片制作及观察 | 第22-23页 |
| 2.2.2 生物信息学析方法 | 第23-24页 |
| 2.2.2.1 转录组分析 | 第23页 |
| 2.2.2.2 基因组SNP分析 | 第23-24页 |
| 2.2.2.3 转录组SNP分析 | 第24页 |
| 2.2.2.4 SNP校正分析 | 第24页 |
| 2.2.3 分析结果验证相关方法 | 第24-29页 |
| 2.2.3.1 植物RNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.3.2 反转录cDNA合成 | 第25-26页 |
| 2.2.3.3 聚合酶链式反应（PCR扩增） | 第26-27页 |
| 2.2.3.4 验证基因引物设计 | 第27页 |
| 2.2.3.5 实时荧光定量PCR检测 | 第27页 |
| 2.2.3.6 定量引物设计 | 第27-28页 |
| 2.2.3.7 目的片段切胶回收 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-49页 |
| 3.1 嫁接生长观察 | 第29-30页 |
| 3.2 嫁接前后砧木与接穗转录组水平差异比较 | 第30-38页 |
| 3.2.1 克里曼丁橘与早实枳差异SNP筛选 | 第32-33页 |
| 3.2.2 克里曼丁橘和早实枳中SNP校正分析 | 第33-34页 |
| 3.2.3 克里曼丁橘与早实枳差异基因表达量分析 | 第34-36页 |
| 3.2.4 嫁接与未嫁接克里曼丁橘转录组比较 | 第36-37页 |
| 3.2.5 嫁接与未嫁接早实枳转录组比较 | 第37-38页 |
| 3.3 嫁接后砧木和接穗比较分析 | 第38-42页 |
| 3.3.1 移动SNP分析 | 第38-40页 |
| 3.3.2 移动InDel分析 | 第40页 |
| 3.3.3 移动mRNA分析 | 第40-42页 |
| 3.4 分析结果实验验证 | 第42-49页 |
| 3.4.1 可移动mRNA实验验证 | 第42-46页 |
| 3.4.2 移动基因在不同组织中表达 | 第46-47页 |
| 3.4.3 基因不同时期的移动情况 | 第47-49页 |
| 4 讨论 | 第49-53页 |
| 4.1 实验中SNP的可靠性 | 第49页 |
| 4.2 mRNA的移动预测 | 第49-50页 |
| 4.3 移动mRNA的验证 | 第50-51页 |
| 4.4 可能移动基因探讨及研究展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 附录 验证的基因引物 | 第60-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
