| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 综述 | 第10-16页 |
| 1 翅碱蓬 | 第10-11页 |
| 1.1 翅碱蓬的简介 | 第10页 |
| 1.2 翅碱蓬在生态修复中的研究概况 | 第10-11页 |
| 1.2.1 翅碱蓬对重金属污染的修复 | 第10页 |
| 1.2.2 翅碱蓬对有机物污染物的修复 | 第10-11页 |
| 1.2.3 翅碱蓬对盐碱土的改良 | 第11页 |
| 1.2.4 翅碱蓬对盐碱土壤微生物的影响 | 第11页 |
| 2 根际微生物 | 第11-12页 |
| 2.1 植物根际微生物的概念及多样性研究 | 第11-12页 |
| 2.2 植物根际微生物的种类 | 第12页 |
| 3 植物内生菌 | 第12-13页 |
| 3.1 植物内生细菌的概念及多样性研究 | 第12页 |
| 3.2 植物内生菌的种类 | 第12-13页 |
| 4 植物根系微生物多样性的研究方法 | 第13-15页 |
| 4.1 传统的分离培养法 | 第13页 |
| 4.2 基于分子生物学技术的非培养法 | 第13-15页 |
| 4.2.1 随机扩增多态性DNA技术 | 第13-14页 |
| 4.2.2 聚合酶链式反应—单链构象多态性 | 第14页 |
| 4.2.3 末端限制性片段长度多态性 | 第14页 |
| 4.2.4 扩增r DNA限制性酶切片段分析 | 第14页 |
| 4.2.5 扩增片段长度多态性 | 第14-15页 |
| 4.2.6 变性/温度梯度凝胶电泳 | 第15页 |
| 4.2.7 高通量测序技术 | 第15页 |
| 5 本研究的目的及意义 | 第15-16页 |
| 第二章 利用高通量测序方法分析翅碱蓬根系原核生物多样性 | 第16-35页 |
| 1 材料与方法 | 第16-21页 |
| 1.1 样品采集及处理 | 第16-17页 |
| 1.2 主要试剂 | 第17页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第17页 |
| 1.4 方法 | 第17-19页 |
| 1.4.1 样品总DNA的提取 | 第17页 |
| 1.4.2 提取DNA的PCR扩增 | 第17-18页 |
| 1.4.3 荧光定量 | 第18页 |
| 1.4.4 Miseq文库构建 | 第18页 |
| 1.4.5 Miseq测序 | 第18-19页 |
| 1.5 翅碱蓬根系及内生细菌生物信息学分析 | 第19-21页 |
| 1.5.1 样品原始数据的区分与统计 | 第19页 |
| 1.5.2 样品数据的优化与统计 | 第19-20页 |
| 1.5.3 OTU聚类 | 第20页 |
| 1.5.4 稀释性曲线建立 | 第20页 |
| 1.5.5 多样性指数计算 | 第20-21页 |
| 1.5.6 分类学分析 | 第21页 |
| 1.5.7 Shannon-Wiener曲线制作 | 第21页 |
| 1.5.8 OTU分布Venn图制作 | 第21页 |
| 1.5.9 制作群落结构组分图 | 第21页 |
| 1.5.10 Rank-Abundance曲线 | 第21页 |
| 2 结果 | 第21-34页 |
| 2.1 样品总DNA提取结果 | 第21-23页 |
| 2.2 PCR扩增结果 | 第23页 |
| 2.3 数据结果统计 | 第23-24页 |
| 2.4 稀释性曲线 | 第24-26页 |
| 2.5 样品多样性指数结果统计 | 第26-27页 |
| 2.6 Shannon-Wiener曲线 | 第27-29页 |
| 2.7 OTU分布Venn图 | 第29-30页 |
| 2.8 群落结构组分图 | 第30-32页 |
| 2.9 Rank-Abundance曲线 | 第32-34页 |
| 3 讨论 | 第34-35页 |
| 第三章 翅碱蓬根系及根组织内可培养细菌多样性分析 | 第35-44页 |
| 1 材料与方法 | 第35-36页 |
| 1.1 样品采集与处理 | 第35页 |
| 1.2 主要试剂 | 第35页 |
| 1.3 主要设备 | 第35-36页 |
| 2 方法 | 第36页 |
| 2.1 样品的分离和纯化 | 第36页 |
| 2.2 菌株DNA的提取 | 第36页 |
| 2.3 16S r DNA的PCR扩增及测序 | 第36页 |
| 3 结果 | 第36-43页 |
| 3.1 菌株的分离纯化与测序分析 | 第36-43页 |
| 4 讨论 | 第43-44页 |
| 第四章 翅碱蓬根系对降油细菌负载能力测定 | 第44-50页 |
| 1 材料方法 | 第44-46页 |
| 1.1 材料 | 第44-45页 |
| 1.1.1 主要材料 | 第44-45页 |
| 1.1.2 其他材料 | 第45页 |
| 1.1.3 试验器材 | 第45页 |
| 1.2 方法 | 第45-46页 |
| 1.2.1 翅碱蓬根系石油降解菌负载性能测定 | 第45页 |
| 1.2.2 水培实验观察翅碱蓬根系石油降解菌负载情况 | 第45页 |
| 1.2.3 G12菌株在根系表面附着情况观察 | 第45-46页 |
| 1.2.4 根系石蜡切片 | 第46页 |
| 2 结果 | 第46-48页 |
| 2.1 最佳定植条件 | 第46-47页 |
| 2.2 水培条件下根系的革兰氏染色 | 第47页 |
| 2.3 翅碱蓬根系的石蜡切片 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-49页 |
| 4 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 攻读硕士学位期间参与的研究项目与发表的论文 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |