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基于甲醇/乙醇底物的洛伐他汀及莫纳可林J异源生物合成

摘要第5-7页
abstract第7-8页
第1章 文献综述第13-41页
    1.1 洛伐他汀第13-16页
        1.1.1 洛伐他汀的结构与基本性质第13页
        1.1.2 洛伐他汀的生产制备第13-14页
        1.1.3 他汀类化合物的生物活性与用途第14-16页
    1.2 洛伐他汀的生物合成途径第16-23页
        1.2.1 洛伐他汀合成基因簇第16-17页
        1.2.2 LovB-LovC聚酮合酶系统的功能第17-19页
        1.2.3 聚酮合酶LovF的功能第19-20页
        1.2.4 酰基转移酶LovD的功能第20-21页
        1.2.5 LovA的功能第21-22页
        1.2.6 LovG的功能第22-23页
        1.2.7 洛伐他汀的生物合成路径第23页
    1.3 酵母细胞工厂异源合成次级代谢产物第23-33页
        1.3.1 异源生物合成途径的组装第25-27页
        1.3.2 酵母系统中异源基因的表达调控第27-29页
        1.3.3 酵母代谢调控及高通量筛选提升次级代谢产物合成第29-30页
        1.3.4 异源合成途径的区域化搭建第30-32页
        1.3.5 酵母系统成功合成的异源次级代谢产物第32-33页
    1.4 甲基营养型酵母——毕赤酵母第33-40页
        1.4.1 启动子P_(AOX1)第34-35页
        1.4.2 启动子P_(GAP)第35页
        1.4.3 其他可用的启动子第35-36页
        1.4.4 密码子优化与基因拷贝数第36页
        1.4.5 高密度培养第36-37页
        1.4.6 异源合成聚酮类化合物第37-38页
        1.4.7 乙酰辅酶A的代谢第38-39页
        1.4.8 合成生物学元件的应用第39-40页
    1.5 本课题的研究目的与意义第40-41页
第2章 洛伐他汀异源合成途径的组装第41-71页
    2.1 前言第41页
    2.2 实验材料第41-46页
        2.2.1 菌株和质粒第41-42页
        2.2.2 培养基及培养条件第42页
        2.2.3 主要分子生物学试剂第42-46页
    2.3 实验方法第46-51页
        2.3.1 洛伐他汀生物合成相关基因的序列信息第46-47页
        2.3.2 洛伐他汀生物合成相关基因异源表达质粒的构建第47-48页
        2.3.3 感受态细胞的制备及电穿孔转化第48-49页
        2.3.4 重组转化子的基因型验证第49页
        2.3.5 摇瓶水平的甲醇诱导发酵第49-50页
        2.3.6 发酵产物的提取与检测第50页
        2.3.7 洛伐他汀及其中间产物的纯化制备第50页
        2.3.8 洛伐他汀及其中间产物的LC-MS和NMR鉴定第50-51页
        2.3.9 其他方法第51页
    2.4 结果与讨论第51-70页
        2.4.1 表达质粒pZ-BCGN的构建第51-52页
        2.4.2 二氢莫纳可林L在毕赤酵母的异源合成第52-53页
        2.4.3 表达质粒pK-AR、pK-sAR的构建第53-58页
        2.4.4 莫纳可林J在毕赤酵母的异源合成第58-61页
        2.4.5 表达质粒pG-DF、pG-sDF的构建第61-66页
        2.4.6 洛伐他汀的异源合成第66-70页
    2.5 本章小结第70-71页
第3章 洛伐他汀合成途径的表达优化与反应器发酵第71-90页
    3.1 前言第71页
    3.2 实验材料第71-72页
    3.3 实验方法第72-75页
        3.3.1 毕赤酵母高拷贝菌株的筛选第72页
        3.3.2 共培养菌株的构建第72-73页
        3.3.3 共培养菌株的摇瓶及反应器接种方法第73页
        3.3.4 毕赤酵母的5-L反应器发酵工艺控制第73-75页
        3.3.5 其他方法第75页
    3.4 实验结果与讨论第75-88页
        3.4.1 优化异源基因剂量提升洛伐他汀合成第75-78页
        3.4.2 途径拆分结合共培养策略提升洛伐他汀合成第78-80页
        3.4.3 洛伐他汀高拷贝单菌株的5-L反应器发酵第80-82页
        3.4.4 共培养策略生产莫纳可林J的5-L反应器发酵第82-86页
        3.4.5 共培养策略生产洛伐他汀的反应器水平优化第86-88页
    3.5 本章小结第88-90页
第4章 乙醇诱导型人工转录调控系统的开发第90-106页
    4.1 前言第90页
    4.2 实验材料第90页
    4.3 实验方法第90-96页
        4.3.1 生长的测定第92-93页
        4.3.2 缺失株△adh3、△ald、△acs1的获得第93页
        4.3.3 毕赤酵P_(AOX1)、P_(GAP)单拷贝表达eGFP菌株的获得第93-94页
        4.3.4 乙醇诱导型启动子表达eGFP菌株的获得第94-95页
        4.3.5 毕赤酵母人工转录调控系统表达eGFP菌株的获得第95-96页
        4.3.6 eGFP表达菌株荧光强度的测定第96页
    4.4 实验结果与讨论第96-104页
        4.4.1 毕赤酵母在葡萄糖、甘油、甲醇中的代谢通路第96-98页
        4.4.2 在乙醇、乙酸中的生长第98-99页
        4.4.3 毕赤酵母中乙醇到乙酰辅酶A的代谢通路第99-100页
        4.4.4 乙醇诱导型人工转录系统的设计与构建第100-101页
        4.4.5 乙醇诱导型人工转录系统强度评价第101-103页
        4.4.6 人工转录系统在不同碳源浓度条件下的eGFP表达强度第103-104页
    4.5 本章小结第104-106页
第5章 利用乙醇诱导型人工转录调控系统异源合成莫纳克林J第106-124页
    5.1 前言第106页
    5.2 实验材料第106页
    5.3 实验方法第106-115页
        5.3.1 6-甲基水杨酸异源合成菌株的构建第106-111页
        5.3.2 人工转录系统合成二氢莫纳可林L菌株的构建第111页
        5.3.3 代谢工程改造提升二氢莫纳可林L合成的菌株构建第111-113页
        5.3.4 共培养生产莫纳可林J的菌株构建第113-114页
        5.3.5 乙醇为核心碳源的毕赤酵母摇瓶发酵方法第114页
        5.3.6 乙醇诱导系统异源合成化合物的提取、检测与定量第114页
        5.3.7 乙醇为核心碳源的5-L反应器发酵控制第114-115页
    5.4 实验结果与讨论第115-122页
        5.4.1 各表达系统生产6-MSA产量的比较第115-117页
        5.4.2 应用乙醇诱导型人工转录调控系统合成二氢莫纳可林L第117-118页
        5.4.3 代谢工程改造提升二氢莫纳可林L合成第118-120页
        5.4.4 基于乙醇诱导人工转录系统的多细胞共培养合成莫纳可林J第120-121页
        5.4.5 乙醇为底物生产莫纳可林J的5-L反应器发酵第121-122页
    5.5 本章小结第122-124页
第6章 结论、创新点与展望第124-128页
    6.1 主要结论第124-126页
    6.2 创新点第126页
    6.3 展望第126-128页
参考文献第128-139页
致谢第139-140页
攻读博士学位期间发表的论文与专利第140页

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