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HRM技术在成骨不全COL1A1/COL1A2基因突变筛查中的应用

中文摘要第4-6页
Abstract第6-8页
缩略语第12-13页
前言第13-18页
    研究现状、成果第13-17页
    研究目的、方法第17-18页
一、利用PCR-HRM筛查OI患者COL1A1/COL1A2基因突变第18-38页
    1.1 实验材料第18-19页
        1.1.1 仪器及耗材第18页
        1.1.2 主要试剂第18-19页
        1.1.3 溶液的配制第19页
    1.2 研究方法第19-22页
        1.2.1 收集临床资料并采集血液标本第19页
        1.2.2 提取基因组DNA及纯度测定第19-20页
        1.2.3 PCR-HRM技术的引物设计第20-21页
        1.2.4 PCR-HRM操作方法及反应条件第21页
        1.2.5 PCR-HRM技术结果判断第21页
        1.2.6 PCR扩增及基因测序验证第21-22页
        1.2.7 序列分析第22页
        1.2.8 统计学分析第22页
    1.3 实验结果第22-33页
        1.3.1 突变总数第22-23页
        1.3.2 PCR-HRM的筛查效果第23-24页
        1.3.3 突变人群的表现型情况第24-25页
        1.3.4 突变形式第25页
        1.3.5 氨基酸的改变第25-26页
        1.3.6 基因型和表现型的关系第26-33页
    1.4 讨论第33-37页
        1.4.1 PCR-HRM技术的可行性分析第33-35页
        1.4.2 COL1A1/COL1A2基因突变及与表现型的关系第35-37页
    1.5 小结第37-38页
二、一个特殊家系的COL1A1基因突变效应分析第38-46页
    2.1 实验材料第38-39页
        2.1.1 仪器及耗材第38页
        2.1.2 病例基本资料第38-39页
    2.2 研究方法第39页
    2.3 实验结果第39-44页
        2.3.1 家系PCR-HRM筛查结果第39-40页
        2.3.2 家系Sanger测序结果第40-41页
        2.3.3 突变预测软件概述第41-42页
        2.3.4 Polyphen2突变效应预测第42-43页
        2.3.5 SIFT突变效应预测第43-44页
        2.3.6 Align GVGD突变效应预测第44页
    2.4 讨论第44-45页
        2.4.1 生物信息学预测软件简介第44-45页
        2.4.2 特殊家系COL1A1基因的突变分析第45页
    2.5 小结第45-46页
三、PCR-HRM筛查结果阴性的部分OI患者的全基因组测序第46-54页
    3.1 实验材料第46-47页
        3.1.1 临床资料第46-47页
        3.1.2 提取基因组DNA及纯度测定第47页
    3.2 研究方法第47-48页
        3.2.1 样品准备及送检第47页
        3.2.2 SNPs的分析鉴定第47页
        3.2.3 InDels的分析鉴定第47页
        3.2.4 SVs的分析鉴定第47页
        3.2.5 CNVs的分析鉴定第47-48页
        3.2.6 数据分析第48页
    3.3 结果第48-49页
        3.3.1 COL1A2基因突变第48页
        3.3.2 PAPSS2基因突变第48-49页
    3.4 讨论第49-53页
        3.4.1 与成骨不全有关的致病基因第49-52页
        3.4.2 PAPSS2基因突变分析第52-53页
    3.5 小结第53-54页
结论第54-55页
参考文献第55-64页
发表论文和参加科研情况说明第64-65页
附录一第65-70页
附录二第70-75页
附录三第75-77页
附录四第77-79页
综述 成骨不全治疗方法的研究进展第79-90页
    综述参考文献第85-90页
致谢第90-91页
个人简历第91页

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