中文摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
缩略语 | 第12-13页 |
前言 | 第13-18页 |
研究现状、成果 | 第13-17页 |
研究目的、方法 | 第17-18页 |
一、利用PCR-HRM筛查OI患者COL1A1/COL1A2基因突变 | 第18-38页 |
1.1 实验材料 | 第18-19页 |
1.1.1 仪器及耗材 | 第18页 |
1.1.2 主要试剂 | 第18-19页 |
1.1.3 溶液的配制 | 第19页 |
1.2 研究方法 | 第19-22页 |
1.2.1 收集临床资料并采集血液标本 | 第19页 |
1.2.2 提取基因组DNA及纯度测定 | 第19-20页 |
1.2.3 PCR-HRM技术的引物设计 | 第20-21页 |
1.2.4 PCR-HRM操作方法及反应条件 | 第21页 |
1.2.5 PCR-HRM技术结果判断 | 第21页 |
1.2.6 PCR扩增及基因测序验证 | 第21-22页 |
1.2.7 序列分析 | 第22页 |
1.2.8 统计学分析 | 第22页 |
1.3 实验结果 | 第22-33页 |
1.3.1 突变总数 | 第22-23页 |
1.3.2 PCR-HRM的筛查效果 | 第23-24页 |
1.3.3 突变人群的表现型情况 | 第24-25页 |
1.3.4 突变形式 | 第25页 |
1.3.5 氨基酸的改变 | 第25-26页 |
1.3.6 基因型和表现型的关系 | 第26-33页 |
1.4 讨论 | 第33-37页 |
1.4.1 PCR-HRM技术的可行性分析 | 第33-35页 |
1.4.2 COL1A1/COL1A2基因突变及与表现型的关系 | 第35-37页 |
1.5 小结 | 第37-38页 |
二、一个特殊家系的COL1A1基因突变效应分析 | 第38-46页 |
2.1 实验材料 | 第38-39页 |
2.1.1 仪器及耗材 | 第38页 |
2.1.2 病例基本资料 | 第38-39页 |
2.2 研究方法 | 第39页 |
2.3 实验结果 | 第39-44页 |
2.3.1 家系PCR-HRM筛查结果 | 第39-40页 |
2.3.2 家系Sanger测序结果 | 第40-41页 |
2.3.3 突变预测软件概述 | 第41-42页 |
2.3.4 Polyphen2突变效应预测 | 第42-43页 |
2.3.5 SIFT突变效应预测 | 第43-44页 |
2.3.6 Align GVGD突变效应预测 | 第44页 |
2.4 讨论 | 第44-45页 |
2.4.1 生物信息学预测软件简介 | 第44-45页 |
2.4.2 特殊家系COL1A1基因的突变分析 | 第45页 |
2.5 小结 | 第45-46页 |
三、PCR-HRM筛查结果阴性的部分OI患者的全基因组测序 | 第46-54页 |
3.1 实验材料 | 第46-47页 |
3.1.1 临床资料 | 第46-47页 |
3.1.2 提取基因组DNA及纯度测定 | 第47页 |
3.2 研究方法 | 第47-48页 |
3.2.1 样品准备及送检 | 第47页 |
3.2.2 SNPs的分析鉴定 | 第47页 |
3.2.3 InDels的分析鉴定 | 第47页 |
3.2.4 SVs的分析鉴定 | 第47页 |
3.2.5 CNVs的分析鉴定 | 第47-48页 |
3.2.6 数据分析 | 第48页 |
3.3 结果 | 第48-49页 |
3.3.1 COL1A2基因突变 | 第48页 |
3.3.2 PAPSS2基因突变 | 第48-49页 |
3.4 讨论 | 第49-53页 |
3.4.1 与成骨不全有关的致病基因 | 第49-52页 |
3.4.2 PAPSS2基因突变分析 | 第52-53页 |
3.5 小结 | 第53-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-64页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第64-65页 |
附录一 | 第65-70页 |
附录二 | 第70-75页 |
附录三 | 第75-77页 |
附录四 | 第77-79页 |
综述 成骨不全治疗方法的研究进展 | 第79-90页 |
综述参考文献 | 第85-90页 |
致谢 | 第90-91页 |
个人简历 | 第91页 |