| 摘要 | 第5-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 引言 | 第14-15页 |
| 1.2 长链非编码RNA的研究现状 | 第15-17页 |
| 1.3 核糖开关的研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3.1 核糖开关的结构特点 | 第17-18页 |
| 1.3.2 核糖开关的调控机理 | 第18-19页 |
| 1.4 SAM核糖开关家族的研究性状 | 第19-21页 |
| 1.5 SAM-V核糖开关的研究性状 | 第21-23页 |
| 1.6 核糖开关的研究意义 | 第23页 |
| 1.7 RNA结构的研究方法 | 第23-24页 |
| 1.8 SHAPE化学探测法简介 | 第24-27页 |
| 1.8.1 SHAPE化学探测法的基本原理 | 第25页 |
| 1.8.2 SHAPE化学探测法的基本步骤 | 第25-26页 |
| 1.8.3 SHAPE化学探测法的重要应用 | 第26-27页 |
| 1.9 文章的研究内容及其意义 | 第27-28页 |
| 第2章 SHAPE化学探测法预测SAM-V核糖开关二级结构的前期准备 | 第28-44页 |
| 2.1 实验仪器与材料 | 第28-33页 |
| 2.1.1 实验仪器与设备 | 第28-29页 |
| 2.1.2 主要生化试剂及材料 | 第29-30页 |
| 2.1.3 常用试剂配制 | 第30-33页 |
| 2.2 实验方法 | 第33-41页 |
| 2.2.1 感受态细胞的制备 | 第33-34页 |
| 2.2.2 Taq DNA聚合酶的制备与纯化 | 第34-35页 |
| 2.2.3 T7 RNA聚合酶的制备及纯化 | 第35-38页 |
| 2.2.4 SAM-V核糖开关两段基因 62metY，116metY结构模板的PCR扩增 | 第38-40页 |
| 2.2.5 62metY，116metY RNA的制备与纯化 | 第40-41页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第41-43页 |
| 2.3.1 感受态细胞效率 | 第41页 |
| 2.3.2 Taq DNA聚合酶活性检测 | 第41页 |
| 2.3.3 T7 RNA聚合酶SDS-PAGE凝胶检测 | 第41-42页 |
| 2.3.4 62metY 116metY结构模板PCR扩增 | 第42-43页 |
| 2.3.5 62metY，116metY RNA的制备与纯化 | 第43页 |
| 2.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 第3章 SHAPE化学探测法应用在预测SAM-V核糖开关二级结构中的优化 | 第44-58页 |
| 3.1 实验仪器与材料 | 第44-47页 |
| 3.1.1 实验仪器与设备 | 第44-45页 |
| 3.1.2 实验材料与试剂 | 第45页 |
| 3.1.3 常用试剂配制 | 第45-47页 |
| 3.2 实验方法 | 第47-49页 |
| 3.2.1 SHAPE化学实验的基本步骤 | 第47-48页 |
| 3.2.2 SHAPE化学实验的优化 | 第48-49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-55页 |
| 3.3.1 62metY RNA浓度优化结果分析 | 第49-50页 |
| 3.3.2 修饰物（NMIA）浓度优化实验结果分析 | 第50-54页 |
| 3.3.3 优化前的SHAPE实验与优化后SHAPE实验的比较 | 第54-55页 |
| 3.4 SAM-V核糖开关二级结构的初级预测 | 第55-56页 |
| 3.5 本章小结 | 第56-58页 |
| 第4章 全文总结与展望 | 第58-60页 |
| 4.1 结论 | 第58-59页 |
| 4.2 展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 附录 1：攻读学位期间发表的论文情况 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
