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水稻应答灌浆初期夜间高温的转录组研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第一章 综述第7-12页
    1.1 全球气候变暖影响水稻产量第7页
    1.2 夜间高温影响水稻籽粒灌浆充实第7页
    1.3 我国高温热害的形成原因第7页
    1.4 水稻灌浆期耐热性的研究现状第7-9页
        1.4.1 高温对水稻籽粒灌浆的影响第7-8页
        1.4.2 高温对水稻产量及其构成因素的影响第8页
        1.4.3 高温对水稻生理生化的影响第8-9页
        1.4.4 夜间高温对水稻灌浆的影响第9页
    1.5 水稻耐高温相关基因的鉴定第9-10页
    1.6 RNA-SEQ技术第10页
        1.6.1 RNA-seq技术的优势第10页
        1.6.2 RNA-seq技术在水稻中的应用第10页
    1.7 研究内容与意义第10-12页
        1.7.1 研究内容第10-11页
        1.7.2 研究目的和意义第11-12页
第二章 材料与方法第12-16页
    2.1 试验材料第12页
    2.2 供试水稻植株的培育第12页
    2.3 高温处理与取样第12页
    2.4 总RNA提取及MRNA文库构建第12-13页
    2.5 转录组测序步骤及信息分析流程第13-14页
    2.6 处理与对照间的差异表达基因分析第14页
    2.7 耐热与热敏感水稻间的差异表达基因分析第14-15页
    2.8 荧光定量PCR(QRT-PCR)验证RNA-SEQ的准确性第15-16页
第三章 结果与分析第16-40页
    3.1 总RNA质量检测第16-17页
    3.2 转录组测序结果第17-22页
        3.2.1 测序reads的数量统计第17-18页
        3.2.2 高质量reads的组装结果概述第18-19页
        3.2.3 高质量reads比对到基因不同部位的统计结果第19页
        3.2.4 组装转录本功能注释第19-21页
        3.2.5 生物学重复间的表达量聚类结果第21-22页
    3.3 两水稻纯系的处理与对照间的差异表达基因第22-24页
        3.3.1 处理与对照间差异表达基因的数量概述第22-23页
        3.3.2 处理与对照间的基因差异表达基因GO分析结果第23-24页
    3.4 耐热水稻XN0437T中应答夜间高温的基因功能及其表达模式第24-28页
    3.5 热敏水稻XN0437S应答夜间高温的基因功能及其表达模式第28-34页
    3.6 耐热和热敏感水稻应答夜间高温的差异表达基因第34-39页
        3.6.1 差异表达基因的表达模式第34-35页
        3.6.2 差异表达基因的功能注释及其分类第35页
        3.6.3 胞内电子传递相关基因第35页
        3.6.4 氨基酸代谢相关基因第35页
        3.6.5 膜转运相关基因第35-39页
    3.7 RT-QPCR验证结果第39-40页
第四章 讨论与小结第40-44页
    4.1 夜间高温影响线粒体跨膜电子传递相关基因的表达第40页
    4.2 夜间高温对氨基酸代谢的影响第40-41页
    4.3 夜间高温对跨膜转运的影响第41页
    4.4 夜间高温对细胞中水解和脱羧作用的影响第41-42页
    4.5 应答夜间高温的未知功能转录本的重要性第42页
    4.6 水稻应答灌浆初期夜间高温的可能调控模型第42-44页
参考文献第44-49页
致谢第49页

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