摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
第一章 综述 | 第7-12页 |
1.1 全球气候变暖影响水稻产量 | 第7页 |
1.2 夜间高温影响水稻籽粒灌浆充实 | 第7页 |
1.3 我国高温热害的形成原因 | 第7页 |
1.4 水稻灌浆期耐热性的研究现状 | 第7-9页 |
1.4.1 高温对水稻籽粒灌浆的影响 | 第7-8页 |
1.4.2 高温对水稻产量及其构成因素的影响 | 第8页 |
1.4.3 高温对水稻生理生化的影响 | 第8-9页 |
1.4.4 夜间高温对水稻灌浆的影响 | 第9页 |
1.5 水稻耐高温相关基因的鉴定 | 第9-10页 |
1.6 RNA-SEQ技术 | 第10页 |
1.6.1 RNA-seq技术的优势 | 第10页 |
1.6.2 RNA-seq技术在水稻中的应用 | 第10页 |
1.7 研究内容与意义 | 第10-12页 |
1.7.1 研究内容 | 第10-11页 |
1.7.2 研究目的和意义 | 第11-12页 |
第二章 材料与方法 | 第12-16页 |
2.1 试验材料 | 第12页 |
2.2 供试水稻植株的培育 | 第12页 |
2.3 高温处理与取样 | 第12页 |
2.4 总RNA提取及MRNA文库构建 | 第12-13页 |
2.5 转录组测序步骤及信息分析流程 | 第13-14页 |
2.6 处理与对照间的差异表达基因分析 | 第14页 |
2.7 耐热与热敏感水稻间的差异表达基因分析 | 第14-15页 |
2.8 荧光定量PCR(QRT-PCR)验证RNA-SEQ的准确性 | 第15-16页 |
第三章 结果与分析 | 第16-40页 |
3.1 总RNA质量检测 | 第16-17页 |
3.2 转录组测序结果 | 第17-22页 |
3.2.1 测序reads的数量统计 | 第17-18页 |
3.2.2 高质量reads的组装结果概述 | 第18-19页 |
3.2.3 高质量reads比对到基因不同部位的统计结果 | 第19页 |
3.2.4 组装转录本功能注释 | 第19-21页 |
3.2.5 生物学重复间的表达量聚类结果 | 第21-22页 |
3.3 两水稻纯系的处理与对照间的差异表达基因 | 第22-24页 |
3.3.1 处理与对照间差异表达基因的数量概述 | 第22-23页 |
3.3.2 处理与对照间的基因差异表达基因GO分析结果 | 第23-24页 |
3.4 耐热水稻XN0437T中应答夜间高温的基因功能及其表达模式 | 第24-28页 |
3.5 热敏水稻XN0437S应答夜间高温的基因功能及其表达模式 | 第28-34页 |
3.6 耐热和热敏感水稻应答夜间高温的差异表达基因 | 第34-39页 |
3.6.1 差异表达基因的表达模式 | 第34-35页 |
3.6.2 差异表达基因的功能注释及其分类 | 第35页 |
3.6.3 胞内电子传递相关基因 | 第35页 |
3.6.4 氨基酸代谢相关基因 | 第35页 |
3.6.5 膜转运相关基因 | 第35-39页 |
3.7 RT-QPCR验证结果 | 第39-40页 |
第四章 讨论与小结 | 第40-44页 |
4.1 夜间高温影响线粒体跨膜电子传递相关基因的表达 | 第40页 |
4.2 夜间高温对氨基酸代谢的影响 | 第40-41页 |
4.3 夜间高温对跨膜转运的影响 | 第41页 |
4.4 夜间高温对细胞中水解和脱羧作用的影响 | 第41-42页 |
4.5 应答夜间高温的未知功能转录本的重要性 | 第42页 |
4.6 水稻应答灌浆初期夜间高温的可能调控模型 | 第42-44页 |
参考文献 | 第44-49页 |
致谢 | 第49页 |