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基于模式物种的草坪草与病原真菌蛋白互作预测与分析

中文摘要第1-8页
Abstract第8-10页
1 引言第10-21页
   ·草坪草真菌病害研究概况第11-13页
     ·病害调查第11-12页
     ·病原真菌的致病机理及草坪草的防御响应第12页
     ·病害防治第12-13页
   ·病原真菌与植物互作机理研究第13-17页
     ·病原真菌与植物互作的形态学变化第13-14页
     ·病原真菌与植物互作的生理生化变化第14页
     ·病原真菌与植物互作的分子机理第14-16页
     ·病原真菌与二穗短柄草的互作研究第16-17页
   ·蛋白质相互作用的研究第17-19页
     ·蛋白质相互作用的研究方法第17-19页
     ·跨物种蛋白互作的预测第19页
   ·本研究目的和意义第19-21页
2 材料与方法第21-27页
   ·数据来源第21-23页
     ·病原真菌与二穗短柄草的全基因组数据来源第21页
     ·作预测方法的相关数据来源第21-22页
     ·互作蛋白的GO注释信息来源第22页
     ·二穗短柄草物种内蛋白互作数据来源第22-23页
   ·实验方法第23-27页
     ·病原真菌分泌蛋白的筛选第23页
     ·病原真菌与二穗短柄草的跨物种蛋白互作预测第23-26页
     ·蛋白互作网络构建与节点分析第26页
     ·二穗短柄草物种内互作网络的节点连接度和介数分析第26页
     ·病菌效应子的预测及效应了相关子网络分析第26-27页
3 结果与分析第27-50页
   ·病原真菌与二穗短柄草的跨物种PPI预测与分析第27-36页
     ·病原真菌分泌蛋白及其与寄主蛋白的互作情况第27-28页
     ·高支持度预测结果的网络构建与分析第28-36页
   ·二穗短柄草物种内PPI网的病菌靶标蛋白分析第36-41页
     ·病菌靶标蛋白是二穗短柄草PPI网的关键节点第36-37页
     ·病菌靶标蛋白的生物学功能多样第37-40页
     ·病菌靶标蛋白互作子网络的模块化分析第40-41页
   ·病菌与二穗短柄草的重要互作蛋白对分析第41-50页
     ·病菌致病因子与二穗短柄草蛋白的互作第41-47页
     ·病菌候选效应子与二穗短柄草防御相关蛋白的互作第47-50页
4 讨论第50-53页
   ·病原真菌与寄主之间的蛋白互作预测第50-51页
   ·预测结果的功能富集分析第51-52页
   ·病原真菌致病因子与二穗短柄草的互作第52-53页
5 小结及展望第53-54页
   ·小结第53页
   ·展望第53-54页
参考文献第54-61页
附表1 基于Interolog法的高可信度互作预测结果(部分)第61-62页
附表2 基于DDI法的高可信度互作预测结果(部分)第62-63页
附表3 Interolog法和DDI法共有的高可信度互作预测结果(部分)第63-64页
附表4 过滤前的互作网络中二穗短柄草蛋白的KEGG富集分析结果(部分)第64-65页
附图1 病菌靶标蛋白互作子网络的模块第65页

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