中文摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
1 引言 | 第10-21页 |
·草坪草真菌病害研究概况 | 第11-13页 |
·病害调查 | 第11-12页 |
·病原真菌的致病机理及草坪草的防御响应 | 第12页 |
·病害防治 | 第12-13页 |
·病原真菌与植物互作机理研究 | 第13-17页 |
·病原真菌与植物互作的形态学变化 | 第13-14页 |
·病原真菌与植物互作的生理生化变化 | 第14页 |
·病原真菌与植物互作的分子机理 | 第14-16页 |
·病原真菌与二穗短柄草的互作研究 | 第16-17页 |
·蛋白质相互作用的研究 | 第17-19页 |
·蛋白质相互作用的研究方法 | 第17-19页 |
·跨物种蛋白互作的预测 | 第19页 |
·本研究目的和意义 | 第19-21页 |
2 材料与方法 | 第21-27页 |
·数据来源 | 第21-23页 |
·病原真菌与二穗短柄草的全基因组数据来源 | 第21页 |
·作预测方法的相关数据来源 | 第21-22页 |
·互作蛋白的GO注释信息来源 | 第22页 |
·二穗短柄草物种内蛋白互作数据来源 | 第22-23页 |
·实验方法 | 第23-27页 |
·病原真菌分泌蛋白的筛选 | 第23页 |
·病原真菌与二穗短柄草的跨物种蛋白互作预测 | 第23-26页 |
·蛋白互作网络构建与节点分析 | 第26页 |
·二穗短柄草物种内互作网络的节点连接度和介数分析 | 第26页 |
·病菌效应子的预测及效应了相关子网络分析 | 第26-27页 |
3 结果与分析 | 第27-50页 |
·病原真菌与二穗短柄草的跨物种PPI预测与分析 | 第27-36页 |
·病原真菌分泌蛋白及其与寄主蛋白的互作情况 | 第27-28页 |
·高支持度预测结果的网络构建与分析 | 第28-36页 |
·二穗短柄草物种内PPI网的病菌靶标蛋白分析 | 第36-41页 |
·病菌靶标蛋白是二穗短柄草PPI网的关键节点 | 第36-37页 |
·病菌靶标蛋白的生物学功能多样 | 第37-40页 |
·病菌靶标蛋白互作子网络的模块化分析 | 第40-41页 |
·病菌与二穗短柄草的重要互作蛋白对分析 | 第41-50页 |
·病菌致病因子与二穗短柄草蛋白的互作 | 第41-47页 |
·病菌候选效应子与二穗短柄草防御相关蛋白的互作 | 第47-50页 |
4 讨论 | 第50-53页 |
·病原真菌与寄主之间的蛋白互作预测 | 第50-51页 |
·预测结果的功能富集分析 | 第51-52页 |
·病原真菌致病因子与二穗短柄草的互作 | 第52-53页 |
5 小结及展望 | 第53-54页 |
·小结 | 第53页 |
·展望 | 第53-54页 |
参考文献 | 第54-61页 |
附表1 基于Interolog法的高可信度互作预测结果(部分) | 第61-62页 |
附表2 基于DDI法的高可信度互作预测结果(部分) | 第62-63页 |
附表3 Interolog法和DDI法共有的高可信度互作预测结果(部分) | 第63-64页 |
附表4 过滤前的互作网络中二穗短柄草蛋白的KEGG富集分析结果(部分) | 第64-65页 |
附图1 病菌靶标蛋白互作子网络的模块 | 第65页 |