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低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发

摘要第1-9页
1 引言第9-19页
   ·西葫芦的生产现状第9页
   ·低温冷害对植物细胞结构和代谢的影响第9-12页
     ·低温冷害对植物生物膜系统的影响第10-11页
     ·低温冷害对植物光合作用的影响第11页
     ·低温冷害对植物物质代谢的影响第11-12页
   ·植物抗寒性鉴定的指标和方法研究第12页
   ·植物抗寒性分子研究进展第12-13页
   ·高通量测序技术研究进展第13-14页
     ·Roche 454焦磷酸测序技术第14页
     ·Illumina Solexa聚合酶合成测序技术第14页
   ·转录组测序技术研究进展第14-16页
     ·有参考基因组物种的转录组测序技术第15页
     ·无参考基因组物种的转录组测序技术第15-16页
   ·分子标记方法研究进展第16-17页
     ·随机扩增多态性DNA第16页
     ·简单重复序列DNA第16-17页
     ·简单重复区间扩增多态性第17页
   ·本研究的目的和意义第17-19页
2 西葫芦耐寒性的鉴定第19-33页
   ·材料与方法第19-25页
     ·试验材料第19-20页
     ·主要试剂和药品第20页
     ·主要仪器第20页
     ·试验测试的项目第20-24页
     ·数据处理方法第24-25页
   ·结果与分析第25-29页
     ·低温对西葫芦苗期冷害指数的影响第25页
     ·低温对西葫芦叶片电导率的影响第25-26页
     ·低温对西葫芦叶片丙二醛(MDA)含量的影响第26-27页
     ·低温对西葫芦叶片可溶性糖含量的影响第27页
     ·低温胁迫对西葫芦叶片脯氨酸(Pro)含量的影响第27-28页
     ·低温胁迫对西葫芦叶片SOD、POD酶活性的影响第28-29页
     ·西葫芦抗寒指标的综合评价第29页
   ·讨论第29-32页
     ·西葫芦耐冷性与电导百分率的关系第29-30页
     ·西葫芦耐冷性与MDA含量的关系第30页
     ·西葫芦耐冷性与可溶性糖含量的关系第30页
     ·西葫芦耐冷性与脯氨酸含量的关系第30-31页
     ·西葫芦耐冷性与SOD、POD酶活性的关系第31-32页
   ·本章小结第32-33页
3 基于高通量测序技术对低温胁迫下西葫芦的差异表达基因分析第33-76页
   ·材料与方法第33-38页
     ·试验材料第33-34页
     ·主要试剂及药品第34页
     ·主要仪器第34页
     ·试验方法第34页
     ·西葫芦转录组测序与评估第34-35页
     ·序列拼接组装第35页
     ·基因结构分析第35页
     ·基因功能注释第35页
     ·转录本表达丰度分析第35-36页
     ·不同样品间差异表达基因分析第36页
     ·差异表达基因功能注释第36页
     ·部分差异表达基因的实时RT-qPCR分析第36-38页
   ·结果与分析第38-69页
     ·RNA的提取第38-39页
     ·西葫芦Unigenes文库的构建第39-46页
     ·基因结构分析和功能注释第46-54页
     ·差异表达基因分析第54-68页
     ·对部分差异表达基因的实时RT-qPCR验证第68-69页
   ·讨论第69-75页
     ·西葫芦转录组的高通量de novo测序与序列组装第69-70页
     ·抗寒西葫芦和冷敏感西葫芦在低温胁迫下的转录水平表达分析第70-72页
     ·差异表达基因注释结果分析第72-74页
     ·抗寒性西葫芦特异低温应答机制第74-75页
   ·本章小结第75-76页
4 西葫芦SSR分子标记的开发第76-88页
   ·材料与方法第77页
     ·试验材料第77页
   ·试验方法第77-83页
     ·SSR位点开发第77页
     ·SSR多态性分析第77-83页
   ·结果与分析第83-86页
     ·SSR分析第83页
     ·SSR多态性分析第83-86页
   ·讨论第86-87页
   ·本章小结第87-88页
5 结论第88-91页
参考文献第91-97页
Abstract第97-99页
致谢第99页

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