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冷诱导RNA结合蛋白在H1N1流感病毒复制中的作用及其靶蛋白的筛选

摘要第1-7页
Abstract第7-16页
第一章 H1N1病毒感染细胞后Cirbp表达规律及亚细胞定位的研究第16-25页
 1 材料与方法第17-19页
   ·细胞系及毒株第17页
   ·病毒感染细胞第17-18页
     ·爬片的准备第17页
     ·细胞接毒第17-18页
   ·反转录PCR检测H1N1流感病毒M基因第18页
     ·组织样本总RNA的提取及cDNA合成第18页
     ·PCR检测第18页
   ·免疫组化法检测H1N1流感病毒感染后Cirbp的表达第18-19页
     ·免疫组化一抗浓度的优化第18页
     ·细胞爬片的免疫组化程序第18页
     ·图片采集及数据分析第18-19页
   ·免疫荧光技术检测H1N1病毒感染条件下Cirbp的亚细胞定位第19页
 2 结果第19-23页
   ·H1N1流感病毒成功感染BHK-21,MH-S和PUVEC细胞系第19-20页
   ·H1N1 PR-8 流感病毒感染BHK-21细胞后Cirbp的动态表达第20页
   ·H1N1 PR-8 流感病毒感染MH-S细胞后Cirbp的动态表达第20-21页
   ·H1N1猪流感病毒感染PUVEC细胞后Cirbp的动态表达第21-23页
   ·H1N1流感病毒感染情况下Cirbp的亚细胞定位第23页
 3 讨论第23-24页
 4 小结第24-25页
第二章 敲低Cirbp对H1N1流感病毒mRNA稳定性的影响第25-39页
 1 材料和方法第26-32页
   ·细胞系、载体、菌株和毒株第26页
   ·敲低Cirbp慢病毒载体的构建第26-28页
     ·干扰Cirbp引物序列设计第26页
     ·:病毒载体酶切回收:第26-27页
     ·合成引物退火处理第27页
     ·将双酶切载体和目的基因片段进行连接反应:第27-28页
     ·转化第28页
     ·菌液PCR鉴定及测序鉴定第28页
   ·敲低Cirbp的BHK-21(Cirbp-BHK-21)细胞系的构建及验证第28-30页
     ·慢病毒生产第28-29页
     ·慢病毒感染细胞第29页
     ·Real-time PCR检测Cirbp的表达第29页
     ·Western-blot检测Cirbp蛋白水平的表达第29-30页
   ·Real-time PCR方法检测敲低Cirbp对H1N1病毒mRNA半衰期的影响第30页
   ·Real-time PCR方法检测敲低Cirbp对H1N1病毒mRNA,cRNA和vRNA的影响第30-31页
   ·免疫荧光技术检测敲低Cirbp对H1N1病毒NP蛋白合成的影响第31页
   ·在BHK-21和Cirbp-BHK-21细胞上测定H1N1的TCID50效价第31-32页
 2 结果第32-36页
   ·验证Cirbp-BHK-21细胞系的Real-time PCR和western-blot结果第32页
   ·敲低Cirbp降低H1N1流感病毒mRNA的稳定性第32-33页
   ·敲低Cirbp抑制H1N1流感病毒mRNA,cRNA和vRNA的合成第33-34页
   ·敲低Cirbp抑制H1N1流感病毒NP蛋白的表达第34-35页
   ·H1N1感染Cirbp-BHK-21细胞的TCID50效价显著高于感染正常BHK-21细胞的TCID50效价第35-36页
 3 讨论第36-39页
第三章 Cirbp过表达提高了H1N1病毒的复制效率并促进病毒vRNP出核转运第39-46页
 1 材料和方法第40-42页
   ·细胞系和毒株第40页
   ·过表达Cirbp对H1N1复制效率的影响第40-41页
   ·免疫荧光技术检测Cirbp过表达对H1N1病毒粘附,穿入,入核转运和出核转运的影响第41-42页
     ·在CIRP过表达及空载模型上研究对流感病毒穿入的影响第41页
     ·在BHK-21 Cirp过表达及空载模型上分析H1N1病毒vRNPs的核定位第41-42页
 2 结果第42-45页
   ·Cirbp过表达提高了H1N1病毒的复制效率第42-43页
   ·Cirbp过表达促进了H1N1病毒vRNP的出核转运第43-45页
 3 讨论第45-46页
第四章 H1N1病毒感染下Cirbp潜在靶分子的筛选及初步验证第46-61页
 1 材料和方法第47-51页
   ·细胞系和毒株第47页
   ·免疫共沉淀第47-48页
   ·质谱分析第48-49页
     ·蛋白质胶内酶解第48页
     ·肽段提取第48页
     ·基于QE的液质联用分析第48-49页
   ·数据处理、评估与分析第49-50页
     ·数据库的选择第49页
     ·数据搜索匹配(Mascot搜索)第49-50页
     ·鉴定质量评估第50页
     ·鉴定蛋白的信息分析第50页
   ·免疫荧光技术分析Cirbp与HSP90及NP蛋白的共定位第50-51页
   ·Western-blot分析Cirbp过表达对HSP90表达的影响第51页
 2 结果第51-58页
   ·SDS-PAGE检测免疫共沉淀靶蛋白第52页
   ·质谱鉴定免疫共沉淀产物第52-53页
   ·宿主细胞内Cirbp的潜在靶分子参与的信号通路第53-55页
   ·潜在靶分子的COG注释第55页
   ·潜在靶分子的GO注释分析第55-57页
   ·Cirbp与潜在靶分子HSP90及NP蛋白的共定位验证第57页
   ·过表达Cirbp上调Hsp90的表达第57-58页
 3 讨论第58-61页
结论、创新点与不足第61-62页
第五章 文献综述第62-69页
 1 hnRNPs的结构和生理功能第62-64页
 2 hnRNPs在病毒复制过程中的作用和机制第64-68页
   ·hnRNPs通过与病毒核酸结合影响病毒复制第65-67页
     ·hnRNPs与病毒RNA结合影响病毒复制第65-66页
     ·hnRNPs与病毒DNA结合影响病毒复制第66-67页
   ·hnRNPs通过与病毒蛋白结合影响病毒复制第67页
   ·hnRNPs通过影响细胞凋亡影响病毒复制第67-68页
 3 小结与展望第68-69页
参考文献第69-77页
附录 (一)第77-78页
附录 (二)第78-79页
致谢第79-80页

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