中文摘要 | 第1-16页 |
Abstract | 第16-22页 |
第一章 文献综述 | 第22-44页 |
第一节 分子标记在书虱研究中的应用 | 第22-30页 |
·书虱概论 | 第22-23页 |
·分子生态学中的里程碑——分子标记的应用 | 第23-30页 |
第二节 裂化线粒体基因组的进化属性和特征 | 第30-40页 |
·两侧对称动物线粒体基因组的多样化 | 第30-31页 |
·两侧对称动物线粒体基因组裂化的一般特征 | 第31-35页 |
·两侧对称动物线粒体基因组裂化的“分子化石”——再现裂化的过程 | 第35-38页 |
·两侧对称动物线粒体基因组裂化的驱动因子 | 第38-40页 |
第三节 微卫星分子标记的筛选策略 | 第40-44页 |
·查找已存在的微卫星位点 | 第40-41页 |
·筛选新的微卫星位点 | 第41-44页 |
引言 | 第44-48页 |
第二章 常见书虱的分子鉴定及其系统发育关系研究 | 第48-72页 |
第一节 6种常见书虱的ITS基因克隆 | 第50-62页 |
·材料和方法 | 第50-52页 |
·结果和分析 | 第52-61页 |
·小结 | 第61-62页 |
第二节 6种常见书虱的快速鉴定及其系统发育关系的构建 | 第62-70页 |
·材料和方法 | 第62-63页 |
·结果与分析 | 第63-68页 |
·小结 | 第68-70页 |
本章讨论 | 第70-72页 |
第三章 嗜卷书虱和嗜虫书虱的种群遗传结构比较研究 | 第72-100页 |
·材料和方法 | 第73-77页 |
·主要仪器和试剂 | 第73页 |
·样本采集和基因组DNA提取 | 第73-75页 |
·分子数据的获得 | 第75页 |
·种群遗传学数据分析 | 第75-76页 |
·系统发育分析 | 第76-77页 |
·结果与分析 | 第77-96页 |
·基于线粒体Cytb基因的分析结果 | 第77-90页 |
·基于核糖体ITS基因的分析结果 | 第90-96页 |
本章讨论 | 第96-100页 |
第四章 嗜卷书虱线粒体基因组的测定与进化分析 | 第100-132页 |
·材料和方法 | 第101-106页 |
·主要仪器和试剂 | 第101页 |
·样本采集、DNA提取及PCR扩增和测序 | 第101-103页 |
·序列分析 | 第103-104页 |
·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的PCR验证及定量分析 | 第104-105页 |
·基于线粒体全基因组序列的啮总目系统发育关系研究 | 第105-106页 |
·结果与分析 | 第106-122页 |
·嗜卷书虱具有裂化的线粒体基因组 | 第106-112页 |
·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的PCR及酶切验证 | 第112-113页 |
·基于定量PCR技术的嗜卷书虱两个线粒体染色体相对拷贝数的评估 | 第113-114页 |
·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的一般特征 | 第114-120页 |
·啮总目(书虱、皮虱和寄生虱)系统发育树的重建 | 第120-122页 |
本章讨论 | 第122-132页 |
第五章 嗜卷书虱和嗜虫书虱微卫星富集文库的构建及比较分析 | 第132-148页 |
·材料和方法 | 第132-138页 |
·主要仪器和试剂 | 第132页 |
·供试虫源 | 第132-133页 |
·接头、引物和探针 | 第133页 |
·微卫星富集文库的构建 | 第133-136页 |
·含有微卫星的阳性克隆的筛选及测序 | 第136-137页 |
·微卫星序列分析 | 第137页 |
·微卫星引物设计与试扩 | 第137-138页 |
·结果与分析 | 第138-146页 |
·基因组DNA提取 | 第138页 |
·基因组DNA酶切、人工接头连接及其PCR产物检测 | 第138-139页 |
·磁珠捕捉和PCR扩增 | 第139页 |
·微卫星富集文库的抽样检测和微卫星鉴别 | 第139-141页 |
·微卫星引物试扩 | 第141-146页 |
本章讨论 | 第146-148页 |
第六章 主要结论、创新点及研究展望 | 第148-152页 |
·主要结论 | 第148-150页 |
·建立了基于ITS2基因的6种常见书虱的快速鉴定方法 | 第148页 |
·系统比较分析了嗜卷书虱和嗜虫书虱的种群遗传结构 | 第148-149页 |
·测序获得了以嗜卷书虱为代表种的裂化线粒体基因组 | 第149页 |
·成功构建了嗜卷书虱和嗜虫书虱的微卫星富集文库 | 第149-150页 |
·创新点 | 第150页 |
·展望 | 第150-152页 |
参考文献 | 第152-168页 |
附录Ⅰ 小眼书虱线粒体部分基因组的组装序列 | 第168-171页 |
附录Ⅱ 嗜卷书虱和嗜虫书虱部分微卫星序列 | 第171-178页 |
博士在读期间发表的论文及参加科研课题情况 | 第178-182页 |
致谢 | 第182-184页 |