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书虱种群遗传多样性及线粒体基因组进化研究

中文摘要第1-16页
Abstract第16-22页
第一章 文献综述第22-44页
 第一节 分子标记在书虱研究中的应用第22-30页
     ·书虱概论第22-23页
     ·分子生态学中的里程碑——分子标记的应用第23-30页
 第二节 裂化线粒体基因组的进化属性和特征第30-40页
     ·两侧对称动物线粒体基因组的多样化第30-31页
     ·两侧对称动物线粒体基因组裂化的一般特征第31-35页
     ·两侧对称动物线粒体基因组裂化的“分子化石”——再现裂化的过程第35-38页
     ·两侧对称动物线粒体基因组裂化的驱动因子第38-40页
 第三节 微卫星分子标记的筛选策略第40-44页
     ·查找已存在的微卫星位点第40-41页
     ·筛选新的微卫星位点第41-44页
引言第44-48页
第二章 常见书虱的分子鉴定及其系统发育关系研究第48-72页
 第一节 6种常见书虱的ITS基因克隆第50-62页
     ·材料和方法第50-52页
     ·结果和分析第52-61页
     ·小结第61-62页
 第二节 6种常见书虱的快速鉴定及其系统发育关系的构建第62-70页
     ·材料和方法第62-63页
     ·结果与分析第63-68页
     ·小结第68-70页
 本章讨论第70-72页
第三章 嗜卷书虱和嗜虫书虱的种群遗传结构比较研究第72-100页
   ·材料和方法第73-77页
     ·主要仪器和试剂第73页
     ·样本采集和基因组DNA提取第73-75页
     ·分子数据的获得第75页
     ·种群遗传学数据分析第75-76页
     ·系统发育分析第76-77页
   ·结果与分析第77-96页
     ·基于线粒体Cytb基因的分析结果第77-90页
     ·基于核糖体ITS基因的分析结果第90-96页
 本章讨论第96-100页
第四章 嗜卷书虱线粒体基因组的测定与进化分析第100-132页
   ·材料和方法第101-106页
     ·主要仪器和试剂第101页
     ·样本采集、DNA提取及PCR扩增和测序第101-103页
     ·序列分析第103-104页
     ·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的PCR验证及定量分析第104-105页
     ·基于线粒体全基因组序列的啮总目系统发育关系研究第105-106页
   ·结果与分析第106-122页
     ·嗜卷书虱具有裂化的线粒体基因组第106-112页
     ·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的PCR及酶切验证第112-113页
     ·基于定量PCR技术的嗜卷书虱两个线粒体染色体相对拷贝数的评估第113-114页
     ·嗜卷书虱裂化线粒体基因组的一般特征第114-120页
     ·啮总目(书虱、皮虱和寄生虱)系统发育树的重建第120-122页
 本章讨论第122-132页
第五章 嗜卷书虱和嗜虫书虱微卫星富集文库的构建及比较分析第132-148页
   ·材料和方法第132-138页
     ·主要仪器和试剂第132页
     ·供试虫源第132-133页
     ·接头、引物和探针第133页
     ·微卫星富集文库的构建第133-136页
     ·含有微卫星的阳性克隆的筛选及测序第136-137页
     ·微卫星序列分析第137页
     ·微卫星引物设计与试扩第137-138页
   ·结果与分析第138-146页
     ·基因组DNA提取第138页
     ·基因组DNA酶切、人工接头连接及其PCR产物检测第138-139页
     ·磁珠捕捉和PCR扩增第139页
     ·微卫星富集文库的抽样检测和微卫星鉴别第139-141页
     ·微卫星引物试扩第141-146页
 本章讨论第146-148页
第六章 主要结论、创新点及研究展望第148-152页
   ·主要结论第148-150页
     ·建立了基于ITS2基因的6种常见书虱的快速鉴定方法第148页
     ·系统比较分析了嗜卷书虱和嗜虫书虱的种群遗传结构第148-149页
     ·测序获得了以嗜卷书虱为代表种的裂化线粒体基因组第149页
     ·成功构建了嗜卷书虱和嗜虫书虱的微卫星富集文库第149-150页
   ·创新点第150页
   ·展望第150-152页
参考文献第152-168页
附录Ⅰ 小眼书虱线粒体部分基因组的组装序列第168-171页
附录Ⅱ 嗜卷书虱和嗜虫书虱部分微卫星序列第171-178页
博士在读期间发表的论文及参加科研课题情况第178-182页
致谢第182-184页

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