| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 插图索引 | 第13-14页 |
| 表格索引 | 第14-16页 |
| 主要缩写对照表 | 第16-18页 |
| 第一章 绪论 | 第18-26页 |
| ·课题研究背景及意义 | 第18-19页 |
| ·国内外的研究现状 | 第19-22页 |
| ·面临的挑战及其展望 | 第22-24页 |
| ·压缩方法时间的限制 | 第23页 |
| ·更高效的压缩方法 | 第23页 |
| ·测序平台的影响 | 第23页 |
| ·其他挑战 | 第23-24页 |
| ·论文的研究工作及其结构安排 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第二章 DNA 数据压缩技术 | 第26-42页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·DNA 数据特点 | 第26-29页 |
| ·DNA 数据压缩方法的性能评价 | 第29-33页 |
| ·算法测试数据 | 第30-31页 |
| ·算法性能指标 | 第31-33页 |
| ·现有的 DNA 数据压缩方法 | 第33-40页 |
| ·基于替代的 DNA 数据压缩方法 | 第33-36页 |
| ·基于统计的 DNA 数据压缩方法 | 第36-38页 |
| ·基于参考基因组的 DNA 数据压缩方法 | 第38-39页 |
| ·基于从头测序的 DNA 数据压缩方法 | 第39-40页 |
| ·DNA 数据压缩方法对比 | 第40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第三章 基于扩展操作的 DNA 数据压缩算法 | 第42-49页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·扩展编辑操作 | 第42-44页 |
| ·DNAEC 算法 | 第44-46页 |
| ·搜索匹配过程 | 第44-46页 |
| ·编码过程 | 第46页 |
| ·仿真结果与分析 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第四章 基于 MEMETIC 优化的 DNA 数据压缩算法 | 第49-87页 |
| ·引言 | 第49页 |
| ·MEMETIC 框架 | 第49-50页 |
| ·基于扩展操作的近似重复矢量码书 | 第50-52页 |
| ·CPMA 压缩 | 第52-56页 |
| ·粒子编码和适应度函数的计算 | 第52-53页 |
| ·全局搜索 | 第53-55页 |
| ·局部搜索 | 第55-56页 |
| ·HPMA 压缩 | 第56-62页 |
| ·粒子编码和适应度函数的计算 | 第56-58页 |
| ·全局搜索 | 第58-59页 |
| ·局部搜索 1 | 第59-60页 |
| ·局部搜索 2 | 第60-62页 |
| ·仿真结果与分析 | 第62-85页 |
| ·参数设置 | 第62-64页 |
| ·高维测试函数 | 第64-81页 |
| ·DNA 基准测序序列 | 第81-85页 |
| ·本章小结 | 第85-87页 |
| 第五章 基于码书索引变换的高通量 DNA 数据压缩算法 | 第87-97页 |
| ·引言 | 第87页 |
| ·码书索引变换模型 | 第87-89页 |
| ·CITD 算法 | 第89-94页 |
| ·CIT 模型的编码 | 第89-91页 |
| ·CIT 模型的解码 | 第91页 |
| ·CIT 模型分析 | 第91-92页 |
| ·BWT 与 MTF | 第92-93页 |
| ·Huffman 编码 | 第93-94页 |
| ·仿真结果与分析 | 第94-96页 |
| ·本章小结 | 第96-97页 |
| 第六章 基于 K-MEANS 聚类的高通量 DNA 数据压缩算法 | 第97-103页 |
| ·引言 | 第97页 |
| ·DNAC-K 算法 | 第97-100页 |
| ·K-means 聚类 | 第98-99页 |
| ·聚类序列的比对 | 第99页 |
| ·编码过程 | 第99-100页 |
| ·仿真结果与分析 | 第100-101页 |
| ·本章小结 | 第101-103页 |
| 总结与展望 | 第103-105页 |
| 1. 研究工作总结 | 第103-104页 |
| 2. 后续研究工作展望 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-115页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第115-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 附件 | 第118页 |
