| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 引言 | 第12-15页 |
| 第一章 麻疹病毒全基因序列的测定 | 第15-29页 |
| 1 材料 | 第15-17页 |
| ·细胞株与病毒株来源 | 第15页 |
| ·实验仪器 | 第15-16页 |
| ·实验试剂 | 第16-17页 |
| 2 方法 | 第17-24页 |
| ·Vero/slam 细胞的培养 | 第17-19页 |
| ·生长液和维持液的配制 | 第17-18页 |
| ·Vero/slam 细胞的复苏 | 第18页 |
| ·Vero/slam 细胞的传代 | 第18-19页 |
| ·病毒培养与增殖 | 第19页 |
| ·病毒 RNA 的提取 | 第19-20页 |
| ·麻疹全基因序列扩增引物的设计 | 第20-22页 |
| ·实时荧光定量 RT-PCR 鉴定 | 第22页 |
| ·RT-PCR 扩增麻疹病毒全基因序列 | 第22-23页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第23-24页 |
| ·基因测序 | 第24页 |
| 3 结果 | 第24-27页 |
| ·病毒增殖及实时荧光定量 RT-PCR 鉴定 | 第24-25页 |
| ·RT-PCR 扩增及琼脂糖凝胶电泳 | 第25-26页 |
| ·序列测定结果 | 第26页 |
| ·序列拼接 | 第26-27页 |
| 4 讨论 | 第27-29页 |
| 第二章 麻疹病毒基因组结构特性研究 | 第29-53页 |
| 1 材料 | 第29-30页 |
| ·Bioedit 软件 | 第29页 |
| ·DNAstar 软件 | 第29页 |
| ·PAML 软件 | 第29页 |
| ·Mega Version4.0 软件 | 第29-30页 |
| 2 方法 | 第30-31页 |
| ·样本来源 | 第30页 |
| ·正向选择压力分析 | 第30页 |
| ·进化率计算 | 第30页 |
| ·统计学分析 | 第30页 |
| ·其他 | 第30-31页 |
| 3 结果 | 第31-51页 |
| ·核苷酸与氨基酸的变异分析 | 第31-37页 |
| ·N 基因 | 第31-32页 |
| ·H 基因 | 第32页 |
| ·P 基因 | 第32-33页 |
| ·F 基因 | 第33页 |
| ·M 和 L 基因 | 第33-37页 |
| ·氨基酸同源性分析 | 第37-42页 |
| ·N 基因 | 第37页 |
| ·H 基因 | 第37-38页 |
| ·P 基因 | 第38-39页 |
| ·F 基因 | 第39-40页 |
| ·M 基因和 L 基因 | 第40-41页 |
| ·全基因组 6 个基因综合分析 | 第41-42页 |
| ·糖基化位点分析 | 第42-43页 |
| ·H 基因 | 第42页 |
| ·P 基因 | 第42页 |
| ·F 基因 | 第42页 |
| ·L 基因 | 第42-43页 |
| ·氨基酸位点熵值及进化压力分析 | 第43-44页 |
| ·氨基酸位点熵值计算 | 第43-44页 |
| ·氨基酸位点的进化压力计算 | 第44页 |
| ·进化率分析 | 第44-45页 |
| ·遗传距离分析 | 第45-47页 |
| ·基因进化分析 | 第47-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 第三章 麻疹病毒的分子进化分析 | 第53-63页 |
| 1 材料 | 第53-54页 |
| ·PAUP 软件 | 第53页 |
| ·Modeltest v3.7 软件 | 第53页 |
| ·Beast v1.6.2 软件 | 第53-54页 |
| ·Tracer v1.5 软件 | 第54页 |
| ·Figtreev1.3.1 软件 | 第54页 |
| ·Mega Version4.0 软件 | 第54页 |
| 2 方法 | 第54-58页 |
| ·序列整理 | 第54页 |
| ·PAUP 软件构建最大简约树(MP 树) | 第54-55页 |
| ·Modeltest3.7 软件选择核苷酸替换模型 | 第55页 |
| ·Beast v1.6.2 相关软件计算进化速率及分化时间 | 第55-58页 |
| 3 结果 | 第58-60页 |
| ·Modeltest3.7 软件核苷酸替换模型选择 | 第58页 |
| ·系统进化树分析 | 第58页 |
| ·麻疹进化速率及共同祖先的计算 | 第58-60页 |
| 4 讨论 | 第60-63页 |
| 第四章 全文小结 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |
| 文献综述 | 第68-76页 |
| 参考文献 | 第73-76页 |
| 在学研究成果 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
