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利用SRAP标记、ITS和叶绿体特异序列对红花种质遗传基础初步分析

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
第1章 文献综述第12-26页
   ·红花种质资源概况第12-14页
     ·红花种质资源简介第12-13页
     ·红花资源的应用第13页
     ·红花的遗传多样性研究第13-14页
   ·SRAP 技术在植物分类学上的应用与研究进展第14-18页
     ·SRAP 分子标记技术简介第15页
     ·SRAP-PCR 体系优化第15-16页
     ·SRAP 在基因组学中的应用第16-18页
     ·SRAP 技术应用前景第18页
   ·核基因组 ITS 序列在系统发育学上的研究第18-24页
     ·ITS 序列背景简介与结构特征第18-21页
     ·ITS 序列在裸子植物鉴定中的应用第21页
     ·ITS 序列在被子植物鉴定中的应用第21-24页
     ·ITS 二级结构预测第24页
   ·叶绿体基因组特异性序列在系统发育学中的应用第24-25页
   ·本研究目的与意义第25-26页
第2章 材料与方法第26-34页
   ·实验材料第26-30页
     ·供试材料第26-29页
     ·SRAP 引物第29页
     ·ITS 引物第29-30页
     ·叶绿体 petN-psbM、psbM-trdD 序列引物第30页
   ·主要试剂第30-31页
   ·实验方法第31-34页
     ·红花总 DNA 的提取第31页
     ·SRAP-PCR 扩增第31-32页
     ·ITS-PCR 扩增第32页
     ·聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳第32页
     ·PCR 产物回收第32页
     ·感受态细胞的制备第32页
     ·目的片段的连接与转化第32-34页
第3章 SRAP 技术对红花种质资源遗传多样性分析第34-44页
   ·引言第34-35页
   ·结果与分析第35-42页
     ·SRAP-PCR 扩增体系的优化第35-36页
     ·扩增条带多态性第36-38页
     ·遗传相似系数分析第38-41页
     ·聚类分析第41-42页
   ·讨论第42-44页
第4章 基于核糖体 ITS 序列构建红花系统发育树及二级结构预测第44-63页
   ·引言第44-45页
   ·结果与分析第45-59页
     ·ITS 序列 G/C 含量和长度多态性分析第45-46页
     ·ITS 序列区碱基变异分析第46-48页
     ·不同红花种质遗传距离分析第48-50页
     ·5.8S-rDNA 序列变异及其 rRNA 的二级结构分析第50-52页
     ·ITS1 区域序列变异及 RNA 二级结构预测第52-54页
     ·ITS2 区域序列变异及其 RNA 二级结构的预测第54-57页
     ·菊科不同属 ITS 二级预测第57-59页
   ·讨论第59-61页
     ·ITS 碱基序列变异第59-60页
     ·ITS 序列聚类分析第60页
     ·ITS 序列 RNA 二级结构第60-61页
   ·结论第61-63页
第5章 对红花进行叶绿体间隔区 petN-psbM、psbM-trnD 序列分析第63-67页
   ·引言第63页
   ·结果与分析第63-65页
     ·petN-psbM 间隔区序列分析第63-64页
     ·psbM-trnD 间隔区序列分析第64-65页
     ·菊科植物叶绿体 petN-psbM 序列比对第65页
   ·讨论第65-67页
第6章 流式细胞术测红花基因组大小第67-73页
   ·实验材料、试剂与方法第67-68页
     ·实验材料第67页
     ·实验试剂与配方第67-68页
     ·实验方法第68页
   ·结果第68-71页
     ·流式结果图第68-70页
     ·红花基因组值第70-71页
   ·讨论第71-73页
第7章 总讨论第73-75页
参考文献第75-84页
致谢第84-85页
附录 A 5.8S rRNA 二级结构第85-88页
附录 B ITS1 RNA 二级结构第88-91页
附录 C ITS2 RNA 二级结构第91-95页
附录 D 流式细胞实验结果第95-104页
附录 E 菊属小红菊 ITS 序列信息及二级结构预测第104-108页
附录 F 菊科不同属叶绿体 petN-psbM 序列第108-109页
附录 G 攻读学位期间已完成或发表的论文第109页

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