| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-15页 |
| 缩略语表 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-35页 |
| 1 畜禽养殖场废弃物污染现状 | 第16-17页 |
| 2 我国畜禽粪便资源化利用状况 | 第17-18页 |
| ·制作有机肥料 | 第17页 |
| ·用作能源 | 第17页 |
| ·用作饲料 | 第17-18页 |
| 3 畜禽粪便好氧堆肥技术 | 第18-23页 |
| ·堆肥的概念 | 第18页 |
| ·好氧堆肥的机理和过程 | 第18-19页 |
| ·堆肥技术的类别及其特点 | 第19-20页 |
| ·堆肥化过程中的影响因素 | 第20-23页 |
| 4 堆肥微生物群落结构研究分析的分子生态学方法 | 第23-30页 |
| ·基于16S rRNA/rDNA序列分析技术在环境微生物研究中的应用现状 | 第23-29页 |
| ·堆肥微生物学的其他研究方法 | 第29-30页 |
| 5 芽孢杆菌属(Bacillus)的研究进展 | 第30-33页 |
| ·芽孢杆菌属的分类地位 | 第30-32页 |
| ·芽孢杆菌的主要特性 | 第32页 |
| ·芽孢杆菌的应用 | 第32-33页 |
| 6 梭菌属(Clostridium)的研究进展 | 第33-34页 |
| ·梭菌的主要特性 | 第33页 |
| ·梭菌属的应用 | 第33-34页 |
| 7 本研究的目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二章 材料和方法 | 第35-60页 |
| 1 试验材料 | 第35-39页 |
| ·堆肥材料 | 第35页 |
| ·用于DGGE分析和荧光定量分析的基因组DNA样品 | 第35页 |
| ·主要仪器设备 | 第35-36页 |
| ·主要试剂、药品及试剂盒 | 第36页 |
| ·主要化学试剂及其配制 | 第36-39页 |
| 2 试验方法 | 第39-60页 |
| ·堆肥试验 | 第39页 |
| ·堆肥方法 | 第39-40页 |
| ·堆肥样品的采集与保存 | 第40页 |
| ·堆肥样品各指标的分析方法 | 第40-44页 |
| ·堆肥样品基因组DNA的提取、纯化 | 第44-46页 |
| ·PCR反应 | 第46-48页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第48-52页 |
| ·芽孢杆菌的分离、鉴定 | 第52-55页 |
| ·荧光原位杂交(FISH) | 第55-60页 |
| 第三章 结果与分析 | 第60-83页 |
| 1 堆肥试验结果和堆肥化过程中的参数变化 | 第60-61页 |
| ·堆体的物理性状 | 第60页 |
| ·堆体的温度变化 | 第60-61页 |
| ·无害化卫生学 | 第61页 |
| ·发芽指数 | 第61页 |
| 2 堆肥样品微生物总DNA的提取和质量检测 | 第61-62页 |
| 3 巢式PCR反应 | 第62-64页 |
| ·细菌近全长16S rDNA片断的扩增 | 第62-63页 |
| ·芽孢杆菌属的16S rDNA特异性扩增 | 第63-64页 |
| ·梭菌属的16S rDNA特异性扩增 | 第64页 |
| 4 DGGE图谱及系统进化分析 | 第64-72页 |
| ·芽孢杆菌属细菌的DGGE分析 | 第64-67页 |
| ·芽孢杆菌属细菌的系统进化分析 | 第67-68页 |
| ·梭菌属细菌的DGGE分析 | 第68-71页 |
| ·梭菌属细菌的系统进化分析 | 第71-72页 |
| 5 芽孢杆菌的分离与鉴定 | 第72-79页 |
| ·芽孢杆菌的分离 | 第72页 |
| ·芽孢杆菌的鉴定 | 第72-79页 |
| 6 堆肥样品荧光原位杂交 | 第79-83页 |
| ·芽孢杆菌和梭菌杂交条件的优化 | 第79-81页 |
| ·探针的特异性分析 | 第81页 |
| ·堆肥样品中芽孢杆菌和梭菌的时空分布特征 | 第81-83页 |
| 第四章 讨论 | 第83-93页 |
| 1 堆肥样品中微生物基因组DNA的提取 | 第83-84页 |
| 2 巢式PCR的应用 | 第84页 |
| 3 FISH分析 | 第84-87页 |
| ·堆肥样品中微生物的收集 | 第84-85页 |
| ·微生物的固定及预处理 | 第85-86页 |
| ·FISH技术的缺陷 | 第86-87页 |
| 4 传统方法和现代分子生物学方法的结合应用 | 第87-89页 |
| ·可培养的芽孢杆菌的鉴定 | 第87-88页 |
| ·芽孢杆菌属和梭菌的多样性研究 | 第88-89页 |
| 5 猪粪堆肥中芽孢杆菌和梭菌的种群结构及动态变化 | 第89-93页 |
| ·传统分离培养分析 | 第89-90页 |
| ·PCR-DGGE分析 | 第90-91页 |
| ·荧光原位杂交分析 | 第91-93页 |
| 第五章 小结 | 第93-96页 |
| 本研究的创新点 | 第96页 |
| 进一步研究内容 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第108-109页 |
| 附录 | 第109-116页 |